И вместе с тем с именем Балицкого связаны аресты и высылки крестьян, «националистической» интеллигенции. В ноябре 1932 года Балицкий был направлен особоуполномоченным ОГПУ на Украину, где в это время свирепствовал голод, с задачей «безусловно выполнить план хлебозаготовок». И, судя по всему, выполнил.
В 1933 году Балицкого снова вернули на Украину. Сталин считал необходимой его работу в этой республике, что хорошо видно из его переписки с Кагановичем. Всесоюзная газета «Известия» писала, что Балицкий должен помочь миллионам украинских селян подавить кулацкий саботаж и обеспечить молодым колхозам возможность «спокойно расти и расцветать». Видимо, для «расцвета» колхозного движения Политбюро ЦК ВКП(б) СССР 10 марта 1932 года предоставило право рассмотрения дел «по повстанчеству и контрреволюции» на Украине тройке ГПУ в составе товарищей Балицкого, Карлсона и Леплевского и применения высшей меры социальной защиты. Балицкого считают одним из главных организаторов массового террора на Украине, унесшего жизни десятков тысяч людей.
С 1935 года он имел высшее звание «комиссар государственной безопасности 1 ранга» (равнозначно генералу армии), которое за всю историю было присвоено всего девяти руководителям органов государственной безопасности.
С приходом Ежова на должность наркома внутренних дел СССР усилились массовые репрессии 1937–1938 годов. На Украине расширилась кампания по разоблачению «врагов народа» среди партийно-советского актива, командного состава Вооруженных сил и сотрудников органов государственной безопасности.
В 1937 году московский ЦК Компартии вскрывает серьезные недостатки в работе Политбюро ЦК Украины — высшего партийного органа Коммунистической партии, а первого секретаря ЦК Постышева обвиняют в развале работы и пособничестве враждебным антисоветским элементам в республике. Над Балицким, который многие годы работал с первыми секретарями ЦК Компартии Украины Квирингом, Косиором, Кагановичем, Постышевым, стали сгущаться тучи. В мае его вызвали в Москву и сильно понизили в должности, отправив в Хабаровск начальником краевого управления НКВД.
Как свидетельствуют архивные данные, на новом месте Балицкий продолжал действовать в присущей ему манере сталинского руководителя — оперативно и решительно. Так, лишь по одному уголовному делу в Особой Краснознаменной дальневосточной армии было арестовано 200 командиров и других военнослужащих.
А в это время на Украине собираются обвинения на самого Балицкого, который якобы «утаивал от покарания врагов народа, не выполнял указаний центра по разоблачению контрреволюционных и террористических организаций, сдерживал борьбу с троцкистами, националистическими элементами в республике». Доносы «о вредительской линии» Балицкого готовили его бывшие подчиненные и передавали новому наркому внутренних дел Украины Леплевскому, с которым ранее у Балицкого не сложились личные взаимоотношения. Леплевский сфабриковал дело про «антисоветский заговор в НКВД Украины во главе с наркомом Балицким», в котором якобы участвовали практически все заместители Балицкого, руководители ведущих подразделений. Важно подчеркнуть, что в одной из докладных записок в Москву на имя наркома Ежова сообщалось, что Балицкий осуществлял «неприкрытое сопротивление выполнению оперативных указаний НКВД СССР, им было сделано все, чтобы сберечь от разгрома кадры». Он стремился остановить репрессии, уменьшить количество арестов и смертных приговоров.
Балицкого обвинили по одному уголовному делу с Якиром. Трагедия заключалась в том, что еще в 1930 году командующий Киевским военным округом Якир ездил в Москву и жаловался на ГПУ Украины, которое под руководством Балицкого саботировало, по его мнению, выявление враждебных элементов из числа бывших царских офицеров.
При аресте 7 июня 1937 года у Балицкого изъяли государственные награды: три ордена Красного Знамени, орден
Трудового Красного Знамени УССР, орден Красной Звезды, два знака «Почетный работник ВЧК — ГПУ».
Допросы Балицкого проводил заместитель наркома НКВД СССР Бельский, незаконными методами добиваясь его признания об участии в «военно-фашистском заговоре». Партийные органы Украины в лучших традициях тех времен поспешили еще до суда обвинить Балицкого в том, что он входил в состав преступного «якировского контрреволюционного центра, покрывал троцкистов, правых и националистов».
Он был делегатом печально известного XVII съезда ВКП(б), попал в число тех 395 членов ЦК ВКП(б), которые погибли в 1937–1940 годах. В жизни страны шел жестокий кругооборот: выносившие смертные приговоры высшие руководители карательной системы становились жертвами. Балицкий был приговорен к высшей мере наказания и 27 ноября 1937 года расстрелян.
К периоду моей работы в КГБ УССР Балицкий не был реабилитирован. Вернулись ли к его личности современники в СБУ, я не знаю. На вопрос журналистов, почему он не реабилитирован, в 1989 году я отвечал: «Может, у кого и поднимется рука поднять вопрос о его реабилитации, однако лично я этого не сделал, хотя и отдаю ему должное как чекисту так же, как и многим другим чекистам».
14 июня 1937 года комиссар госбезопасности 2 ранга Израиль Моисеевич Леплевский был назначен наркомом внутренних дел Украины.
Родился он в Брест-Литовске в 1896 году в семье резчика табачной фабрики. Работал в шапочной мастерской, на складе аптекарских товаров, служил в армии в 1914–1917 годах рядовым Дербентского пограничного полка на Турецком фронте. Вел революционную работу среди солдат, был членом Бунда, в 1917 году вступил в партию большевиков.
Службу в органах ВЧК начал в 1918 году с должности регистратора оружия в Саратовской ЧК, затем занимал различные должности в Самарской, Екатеринославской губернских ЧК,
Одесском губотделе ГПУ, был начальником 26-го пограничного отряда. Свою активную деятельность начал с участия в подавлении различных выступлений против советской власти на Украине, разрабатывал операции по ликвидации петлюровских атаманов, подпольных белогвардейских организаций.
Леплевский был младше своего руководителя Балицкого на четыре года, но уже в 1925–1929 годах он являлся его заместителем, членом коллегии ГПУ УССР.
Среди ближайшего окружения Леплевского распространялись слухи о том, что основная заслуга в разгроме контрреволюционных сил на Украине в годы Гражданской войны принадлежит именно Леплевскому благодаря его профессионализму и оперативности. Когда об этом стало известно Балицкому, он не стал делить лавры и успехи со своим заместителем, а способствовал выдвижению Леплевского на самостоятельную должность — наркома внутренних дел Белоруссии. В некоторых печатных источниках содержится упоминание о якобы сделанном им заявлении при отъезде из Киева: «Я еще сюда вернусь и рассчитаюсь со всеми».