Янтарные панно по частям демонстрировали иностранным гостям в Летнем дворце Петра I, и после его смерти они простояли и пролежали в нем еще четверть века.
Вторая жизнь загадочного янтарного шедевра началась в 1743 году.
Пришедшая к власти в 1741 году Елизавета Петровна приказала Растрелли установить Янтарный кабинет в Зимнем дворце, в который были перенесены все панно. Их установка и доделка продолжались несколько лет, и в 1745 году прусский король Фридрих II даже прислал Елизавете в подарок недостающую янтарную раму работы Антона Рейха.
В связи с капитальной перестройкой Зимнего дворца Елизавета приказала Растрелли установить Янтарный кабинет в Большом дворце Царского Села, в который янтарь ее гвардейцы за 25 километров перенесли на руках. Из немецкого Янтарного кабинета Бартоломео Растрелли сделал царскую Янтарную комнату, размеры которой превысили размеры оригинала в три раза.
Зал Большого дворца, выбранный Растрелли для установки панно, был намного больше их, и мастер затянул верх стен расписанными под янтарь тканями. Сами панно мастер чередовал с зеркальными пилястрами, а в самом зале устроил роскошные интерьеры. При этом пышное оформление не подавляло янтарные панно, а подчеркивало их фантастическую неземную красоту.
Янтарь в парадном зале был установлен в три яруса. Для центрального яруса в 1752 году во флорентийской мастерской Л. Сириеса и Д. Дзокки вместо картин в янтарных рамах были сделаны янтарные мозаичные композиции, аллегорически изображавшие Зрение, Слух, Вкус, Осязание и Обоняние, размерами почти четыре на два метра каждая.
В 1755 году создание Янтарной комнаты было в основном завершено, и Б. Растрелли облегченно писал: «Большой зал весь отделан белым и желтым янтарем, все панели, обрамленные порезками, украшены барельефами, фестонами и янтарными скульптурными работами. Я велел устроить между панно зеркальные пилястры с узорами из золоченой бронзы».
Первыми хранителями Янтарной комнаты стали приглашенные в Россию из Пруссии янтарный мастер Фридрих Регенсбург, работавший в Большом дворце до 1771 года, и его сын Иоганн, продолжавший дело отца в Царском Селе до 1813 года.
Регенсбурги привезли из Берлина янтарные маски и другие изделия из солнечного камня и внесли необходимые доработки в декор Янтарной комнаты в виде узких янтарных щитов, цветов, картушей, а также сделали вензеля Елизаветы и двуглавого российского орла.
В Царском Селе была создана янтарная мастерская, заменившая расписанные под янтарь холсты настоящим камнем. В парадном зале появилась янтарная мебель и была собрана уникальная коллекция янтарных, агатовых и яшмовых произведений искусства XVII–XVIII веков.
При Екатерине II в 1770 году все работы в создававшейся более полувека Янтарной комнате были наконец завершены. Она потрясала всех, кто ее видел, и совершенно справедливо называлась сказочным драгоценным залом из «Тысячи одной ночи» и восьмым чудом света. Именно в Янтарной комнате великая императрица проводила свои вечерние собрания, на которые приглашались лучшие люди империи, именно здесь принимались все судьбоносные решения, сделавшие Россию еще более великой страной, чем при Петре I.
Увидевший Янтарную комнату в середине XIX века французский писатель Теофиль Готье писал: «Это зал, с трех сторон сплошь отделан от пола до фриза янтарной мозаикой. Глаз, непривычный видеть янтарь в таком количестве, захвачен и ослеплен богатством и теплотой желтых тонов, от пылающего топаза до светло-лимонного. Золото резьбы кажется тусклым на фоне освещенного солнцем янтаря».
В 1833, 1897 и 1935 годах Янтарная комната была реставрирована.
После начала Великой Отечественной войны, осенью 1941 года по приказу Министерства восточных территорий Альфреда Розенберга и командующего группой войск вермахта «Север» генерал-фельдмаршала Лееба, а затем сменившего его Кюхлера поврежденная солдатами Янтарная комната из 143 предметов в 22 ящиках была отправлена в Кёнигсберг в распоряжение директора его художественных собраний Альфреда Роде, автора трактата «Янтарь как немецкий материал».
В марте 1942 года Янтарную комнату собрали, привели в порядок, выставили на третьем этаже южного крыла Кёнигсбергского замка и показали немецким чиновникам и журналистам.
Летом 1944 года Советская армия наступала на Берлин по всем фронтам, а англо-американская военная авиация начала массированно бомбить немецкие города, разрушая оборонительный потенциал Третьего рейха.
Во время мощнейших налетов 29 августа и 2 сентября центр Кёнигсберга был разрушен, а замок частично сгорел, превратившись в развалины. Янтарная комната была спасена в его глубоких подвалах, о чем Роде доложил в Берлин.
В декабре 1944 года Роде несколько дней искал в Саксонии места для хранения собранных в Кёнигсберге награбленных музейных ценностей и, возможно, собирался спрятать их в замках Вексельбург и Крапштайн у Рохлица.
В январе 1945 года Янтарная комната была поднята из подвалов, упакована, погружена на два грузовика и вывезена в неизвестном направлении.
Больше Янтарную комнату, шедевр мирового искусства и национальное достояние России, никто никогда не видел.
В начале 1945 года Роде отсутствовал в Кёнигсберге почти три недели. В это время сухопутная дорога из Кёнигсберга в Германию уже была перерезана. Янтарную комнату теоретически могли вывезти из разрушенного города морем через Пиллау, по воздуху военно-транспортным самолетом, в обоих случаях с огромным риском ее гибели, спрятать в подвалах Кёнигсберга и в тайниках Восточной Пруссии.
До 22 января 1945 года Янтарная комната могла быть вывезена из Кёнигсберга по железной дороге или автомобилями, позднее только морем или по воздуху.
Немцы прятали музейные ценности в соляных шахтах, штольнях, рудниках, бункерах, тайниках Саксонии, Тюрингии, в старинных замках, в Австрии, Чехии, Словакии, Польше, вывозили в Южную Америку.
9 апреля 1945 года Кёнигсберг был взят Советской армией.
А. Роде заявил на допросе, что до 5 января Янтарная комната находилась в замке и сгорела при бомбежке и штурме, при этом совершенно очевидно, что нельзя было верить ни одному слову этого искусствоведа, заявлявшего, что все сделанные в Германии шедевры, по разным причинам попавшие в другие страны, должны были быть возвращены на историческую родину. По официальному заявлению бургомистра в декабре 1945 года А. Роде и его жена умерли в кёнигсбергской больнице от эпидемии. По неофициальным сведениям, они были убиты или покончили с собой, унеся тайну Янтарной комнаты навсегда. Навсегда?
Янтарную комнату безуспешно искали в тайниках Восточной Пруссии, Германии, Австрии, Чехии, Польши, Южной Америки, куда ее могли вывезти гитлеровцы.