Распутин прежде приобрел влияние на Александру Федоровну тем, что облегчал страдания цесаревича Алексея, больного гемофилией. Николай II и Александра Федоровна искренне уверовали, что молитвы «старца» могут облегчить страдания наследника. По словам секретаря Распутина Арона Симановича, «с первой же встречи с царевичем он отнесся к больному мальчику с особенной предупредительностью. Он владел даром влиять на людей успокаивающим образом. Его спокойствие и уверенное обращение сильно влияли на людей. Его особенное искусство воздействовать на больных сразу поставило его в надлежащее положение у кровати страдающего мальчика.
Бедный ребенок страдал кровотечениями из носа, и врачи не в силах были ему помочь. Обильные потери крови обессиливали мальчика, и в этих случаях родителям всегда приходилось дрожать за его жизнь. Дни и ночи проходили в ужасном волнении. Маленький Алексей полюбил Распутина. Суггестивные способности Распутина оказывали свое действие. Однажды, когда опять наступило кровотечение из носа, Распутин вытащил из кармана ком древесной коры, разварил ее в кипятке и покрыл этой массой все лицо больного. Только глаза и рот остались открытыми. И произошло чудо: кровотечение прекратилось. Распутин рассказывал мне подробно об этом своем первом выступлении в царском дворце в качестве врача. Он не скрывал, что кора, которой он покрыл лицо царевича, была обыкновенной дубовой корой, имеющей качество останавливать кровотечение. Царская чета при этом случае же узнала, что существуют сибирские, китайские и тибетские травы, обладающие чудесными целебными свойствами. Распутин, между прочим, умел исцелять также без помощи трав. Болел кто-нибудь головой и лихорадкой – Распутин становился сзади больного, брал его голову в свои руки, нашептывал что-то никому непонятное и толкал больного со словом: «Ступай».
Больной чувствовал себя выздоровевшим.
Действие распутинского нашептывания я испытал на себе и должен признаться, что оно было ошеломляющим».
Следующий раз упоминание о Распутине в царском дневнике появляется только через семь с лишним месяцев. 18 июля 1906 года Николай записал: «Вечером были на Сергиевке и видели Григория!»
Пока что встречи Распутина с царем были редки. Но при этом «старец» уже тогда гораздо чаще встречался с Александрой Федоровной. Близости Распутина к царской семье способствовало увлечение Николая и Александры разного рода мистиками, юродивыми и целителями. Во многом оно было обусловлено тяжелой и неизлечимой болезнью их сына и попыткой спасти его во что бы то ни стало.
Следующий визит «старца» к царской чете состоялся 13 октября. В этот день Николай записал: «В 6 1/4 к нам приехал Григорий, он привез икону Св. Симеона Верхотурского, видел детей и поговорил с ними до 7 1/2».
9 декабря царь отметил в дневнике: «Обедали Милица и Стана. Весь вечер они рассказывали нам о Григории». Очевидно, именно рекомендация «черногорок» имела решающее значение в том, что Распутин стал вхож в царскую семью.
В декабре 1906 года Распутин подал прошение на высочайшее имя об изменении своей фамилии на Распутин-Новых, ссылаясь на то, что многие его односельчане носят ту же фамилию, из-за чего могут быть недоразумения. Прошение было удовлетворено. Дело здесь было еще и в том, что его поклонники как раз собирались издавать его поучения, и желательно было, чтобы они вышли под более благозвучной фамилией.
6 декабря 1906 года Распутин писал цесаревичу Алексею: «Маленький мой, я с Тобой. Уху кушаем и яички. Скоро увидимся где-то на дороге, как в Киеве будет весело. Твой Друг».
Следующая встреча царя со «старцем», судя по записи в дневнике, состоялась только 6 апреля 1907 года: «После чая пошли на другую сторону наверх и там имели радость повидать и поговорить с Григорием! Обедала Аня. Долго принимал Столыпина».
19 июня царь отметил: «В 3 часа поехали с Аликс в ее двуколке на Знаменку. Встретили Стану на террасе перед дворцом, вошли в него и там имели радость увидеть Григория. Побеседовали около часа и вернулись к себе».
Характерно, что в тот период почти все встречи царя со «старцем» проходили в присутствии «черногорок». Самостоятельно Распутин еще не был вхож к Николаю.
Затем последовало дело о возможной принадлежности Распутина к секте хлыстов (христоверов). Название «хлысты» происходит либо от практикуемого сектантами обряда самобичевания, либо от видоизмененного слова «христы», так как официальные духовные лица считали неприличным в названии секты употреблять имя Иисуса Христа. Основателем секты ими же считается крестьянин Костромской губернии Данила Филиппович (Филиппов), умерший 1 января 1700 года на сотом году жизни. Поэтому хлыстов также называют филипповцами. Согласно преданию, в 1645 году в Стародубской волости Муромского уезда Владимирской губернии, в приходе Егорьевском, на горе Городина, сокатил на землю сам Господь Саваоф и вселился в плоть Данилы Филипповича и дал людям 12 новых заповедей. Преемники Филиппова назывались «христами». «Христами» именовались также руководители местных общин (кораблей). Хлыстовство было слабо централизовано, и общины почти не имели связей друг с другом. Согласно вероучению хлыстов, существуют небо и земля, мир духовный и мир материальный, первый создан Богом, второй – Сатаной. Всего небес семь. На седьмом небе обитают Святая Троица, под которой понимаются нравственные свойства, различные проявления одного и того же божественного существа, Богородица, архангелы, ангелы и святые угодники. По учению хлыстов, Бог может воплощаться в людей неопределенное количество раз. Воплощения Божества в человека идут непрерывно: за одним христом является другой. В принципе хлысты проповедовали аскетизм и пищевое и половое воздержание, поскольку тело человека греховно и есть наказание за первородный грех. Хлысты отрицают священников, святых, государство и священные книги, так как в свое время Данила Филиппович собрал все книги и утопил в Волге, заповедовав верить только в Святой Дух. Богослужения хлыстов (радения) проходят ночью и состоят в самобичевании, кружении, при котором они доходят до состояния экстаза. По утверждениям ряда письменных источников, в ряде кораблей радения (пусть и не каждый раз) заканчивались групповыми сексуальными и особенно гомосексуальными оргиями, так называемым свальным грехом. Хлысты практиковали также общие чаепития.
Распутин, несомненно, был в той или иной степени знаком с религиозной практикой хлыстов, но сам к секте не принадлежал. Вероятно, у хлыстов он заимствовал обряд общего чаепития со своими поклонниками и главным образом поклонницами.