К концу 1941 года большая часть кораблей была собрана в Ленинграде. Для обороны Кронштадта зимой оставили линкор «Марат», лидер «Минск», канлодки «Волга» и «Кама», 5 сторожевых кораблей и 18 тральщиков [619] .
Осенью 1941 года на Антонова была составлена аттестация, в которой значилось: «Корабли дивизиона в результате 5-ти месяцев боевой деятельности подготовлены удовлетворительно к выполнению задач по огневому содействию сухопутным войскам, отражению атак с воздуха и перевозкам войск… Долгое время Антонов действовал с дивизионом самостоятельно, с возложенными на него задачами справился. В боевой обстановке ведет себя спокойно и уверенно, в сложной обстановке ориентируется хорошо» [620] .
С 20 января 1942 года капитан 2-го ранга состоял начальником штаба Охраны водного района (ОВР) КБФ [621] . После эвакуации Таллина была создана единая Охрана водного района флота из кораблей и судов ОВРа Таллинской, Кронштадтской военно-морских баз и Минной обороны КБФ. К ним присоединили катера и корабли с Ханко [622] . Всего в составе организованного 30 августа ОВРа КБФ состояло 210 различных кораблей и катеров, в том числе 2 минных заградителя, 50 тральщиков, 47 катеров-тральщиков и 45 малых охотников. В условиях, когда неприятель из береговой артиллерии мог обстреливать маршрут от Кронштадта до Ленинграда, корабли и катера обеспечивали дозорную службу, морские перевозки и выполняли другие задачи [623] . В частности, моряки очищали от мин фарватеры, осуществляли защиту конвоев от ударов с воздуха и моря.
В зимний период моряки занимались ремонтом и довооружением своих кораблей и судов. Кроме того, из экипажей были сформированы сухопутные отряды, которые охраняли места базирования со стороны земерзших Невы и Невской губы. Ладинский отмечал, что за зиму были подведены итоги боевых действий 1941 года, проанализированы недостатки, а лучшее из боевого опыта сделано достоянием всех экипажей. Моряки изучали оружие и тактические приемы. С весны ОВР КБФ получил ряд задач: обеспечение выхода в море подводных лодок, поддержание сообщений с островами Лавенсари и Сескар, где оставались гарнизоны, дозорная служба, постановка мин на фарватерах противника, траление неприятельских мин с различными типами взрывателей [624] .
Нет сомнения, что во всех этих действиях принимал участие и штаб ОВРа. Позднее Ладинский вспоминал о моряке, который сменил его на посту начальника штаба ОВР КБФ: «Первые впечатления обнадеживали – Неон Васильевич за дело взялся энергично, разумно, показал неплохие штабные качества. Эти впечатления подтвердились и в дальнейшем» [625] .
Неон Васильевич недолго руководил штабом ОВРа КБФ. Уже в апреле Антонов получил новое назначение. Некоторое время он состоял начальником штаба Отряда вновь строящихся надводных кораблей (ОВСНК) [626] . Летом 1942 года его перевели на Онежское озеро, где военная флотилия взаимодействовала с сухопутными войсками.
Флотилия существовала с июля 1941 года. Она успешно поддерживала действия сухопутных войск под командованием капитана 2-го ранга А.П. Дьяконова. 24 октября флотилия ушла на зимовку в Пермь [627] . 28 ноября 1941 года флотилию расформировали, ее корабли вошли в состав Волжской военной флотилии [628] . Однако опыт показал, что боевые корабли на Онежском озере необходимы.
30 апреля 1942 года нарком ВМФ приказал создать Онежский отряд кораблей из состава Волжской военной флотилии. В состав отряда включили управление отряда (штабной корабль «Московский комсомолец»), 6 канонерских лодок, 8 бронекатеров, 7 сторожевых катеров и катеров-тральщиков, 4 глиссера охраны водного района, 31-й отдельный батальон морской пехоты, службу наблюдения и связи, отделы тыла, складов и производственных предприятий. В качестве базы вновь избрали город Вытегра [629] . Моряки взаимодействовали с войсками 7-й отдельной армии. Они несли дозорную службу, высаживали разведчиков, обстреливали береговые позиции. В летнюю кампанию Онежский отряд кораблей успешно выполнял указания сухопутного командования [630] .
В аттестации этого времени на Антонова было указано: «За месяц пребывания в отряде разрабатывал и принимал личное участие в выполнении набеговой операции около города Вознесенск, высадке диверсионной группы 100 человек в тылу противника и ряде других операций» [631] .
В середине ноября 1942 года Онежский отряд, оставив на месте 31-й батальон морской пехоты, направился в Рыбинск на зимовку. Ранее были отправлены катера, часть тыла и оперативная часть для подготовки базирования. За зиму, несмотря на авиационные налеты противника, корабли прошли ремонт, а весной 1943 года на базе отряда была воссоздана Онежская военная флотилия. Первым эшелоном на озеро отправили канонерские лодки, бронекатера с походным штабом, тогда как капитан 2-го ранга Антонов с группой офицеров штаба оставался, чтобы ликвидировать последствия налета авиации противника и дождаться прибытия дивизиона торпедных катеров; эти минные (ракетные) катера, вооруженные «катюшами», значительно усилили огневую мощь флотилии [632] .
С января 1943 года Антонов стал начальником штаба восстановленной Онежской военной флотилии [633] .
На кампанию 1943 года Карельский фронт по согласованию с Главным штабом ВМФ поставил перед флотилией следующие задачи: противодесантная оборона побережья, содействие флангам войск артиллерией и высадками десантов, оборона озерных путей сообщения и действия на коммуникациях противника, ведение постоянных боевых действий. Основными противниками флотилии являлись авиация и береговая артиллерия [634] .
В первой половине мая 1943 года основные силы флотилии прибыли. Сразу же начались боевые действия бронекатеров.
Летом прибыл дивизион торпедных катеров с неуправляемыми ракетами («катюшами»), которые именовали минными кораблями. После изучения новой техники А.П. Дьяконов решил проверить готовность дивизиона и отправился вместе с Антоновым к устью реки Вытегра. Так как поступило сообщение о появлении неприятельского конвоя, Антонов с 2 бронекатерами вышел в море. После того как обнаружили буксир с баржей в охранении сторожевого катера, начальник штаба флотилии радировал командующему флотилией: «Вижу противника. Прошу выслать катера». Сам он принял решение атаковать противника. Так как подкрепления не прибыли, Антонов приказал второму катеру поставить дымовую завесу, прикрывающую от огня береговых батарей. Сблизившись на 42 кабельтова, атакующий катер открыл огонь и вскоре поразил баржу; буксир и сторожевой катер отвернули под прикрытие береговых батарей. Так как второй катер не успел поставить отсекающую завесу из-за малой скорости, катера попали под обстрел береговых орудий противника, и Антонов приказал выходить из боя. Катера, маневрируя под огнем, почти без повреждений прибыли на базу. Катерники получили благодарность командующего. После того были проведены успешные испытания минных катеров [635] .
