Активисты НФА начали блокаду расположенных в Баку казарм войсковых частей. 19 января «фронтовики» заняли здание телецентра и отключили канал трансляции Центрального (т.е. московского) телевидения.
19 января 1990 г. чрезвычайная сессия ВС Нахичеванской АССР объявила о выходе этой автономной республики из состава СССР.
Горбачев понял, что дальше медлить нельзя. На подступах к Баку была создана войсковая группировка численностью около 50 000 военнослужащих, и в ночь с 19 на 20 января 1990 г. войска были введены в Баку. НФА подготовился к сопротивлению: в городе были построены баррикады, «мирные демонстранты» использовали бутылки с зажигательной смесью и огнестрельное оружие. 20-25 января 1990 г. Советская власть была восстановлена в Баку, Джалилабаде, Ленкорани, Нахичевани. Но при этом были убиты 82 чел..
В знак протеста тысячи азербайджанцев-коммунистов публично сожгли свои партийные билеты, а Председатель ПВС Азербайджана Э. Кафарова осудила действия «военных преступников». Вечером 21 января открылась сессия ВС Азербайджанской ССР, которая признала неправомерным ввод войск в Баку. В Азербайджане ввод войск в Баку и в другие города называют «Черный январь».
Многие народные депутаты СССР демократической направленности и различные правозащитные организации стали обвинять Горбачева и Советскую армию в чрезмерном и неоправданном применении силы, повлекшем гибель мирных граждан. Считается, что спорные вопросы надо решать за столом переговоров. Горбачеву надо было сесть за стол переговоров с Н. Панаховым и уговорить его не вешать Везирова, не захватывать города, не разрушать пограничные заграждения, не убивать армян, не блокировать воинские казармы, увести с улиц своих «фронтовиков». Возможно, Горбачев был плохой переговорщик и не умел разговаривать с такими бесспорно идеальнейшими людьми, какими были руководители НФА.
Единственное, за что можно упрекнуть Горбачева в случае с вводом войск в Азербайджан — это то, что он не ввел там прямое правление из центра и снова передал власть местной элите, что и привело в дальнейшем к выходу Азербайджана из СССР. Но мог ли он поступить по-другому под контролем чекистов, инициировавших «перестройку»? Опора могла быть только на армию. А с армией в дальнейшем возникли проблемы.
Операцией в Баку командовал лично министр обороны СССР генерал армии Д. Язов (с 28 апреля 1990 г. — Маршал Советского Союза), координатором военной операции был генерал-полковник В.А. Ачалов. В январе 1990 г. они действовали грамотно, решительно и подавили сопротивление сепаратистов. Зато в августе 1991 г. в Москве Язов и Ачалов проявили просто чудеса непрофессионализма, пацифизма и непротивления злу насилием. После января 1990 г. никаких попыток реально (а не на словах) остановить развал СССР больше не делалось. Почему так произошло — к этому вопросу вернемся в дальнейшем.
Какова была роль Алиева в январских событиях? Севиль Алиева, дочь Гейдара Алиева, в интервью газете «Известия» рассказала, что в январе 1990 г. ее отец отдыхал в подмосковном санатории «Барвиха», и «ему позвонил Горбачев и говорил с ним очень агрессивно». Чем был вызван такой агрессивный звонок Горбачева? Может быть тем, что он узнал о связях Алиева и Панахова? После поражения НФА в боях с Советской Армией, Панахов сбежал в Иран, затем оттуда — в Турцию и вернулся в Азербайджан только в 1991 г. В 1993 г. Г. Алиев, назначил Панахова своим советником. 27 января 1990 г. Везиров все-таки ушел в отставку, и вместо него 1-й секретарем ЦК КП Азербайджана стал А. Муталибов.
Муталибов не принадлежал к клану Алиева, но попытался с ним помириться. 4 февраля 1990 г. он поехал в Москву и встретился с находившимся там Алиевым. А на Востоке психология существенно отличается от западной. Если ты первым пошел на переговоры — значит, ты слабак. А позиции у Муталибова действительно были слабоваты. И Алиев сумел его постепенно убрать из Азербайджана.
З. Ализаде, азербайджанский политолог и один из основателей НФА, вышедший из него из-за разногласий с Алиевым-Эльчибеем и Панаховым, в книге «Конец второй республики» сообщает: «Фронтисты Нахичеванского отделения НФА разрушили государственную границу СССР. На конференции 6-7 января 1990 г. член Правления Н. Панахов раздавал отдельным делегатам, как сувенир, пятнадцатисантиметровые куски колючей проволоки, срезанные на государственной границе СССР как символ конца режима «русской империи». (…) Он старался приписать себе всю заслугу этого героического деяния, но я знал, что (…) координацию и непосредственное руководство через свою агентуру, осуществляет Г. Алиев. Знал, и кто был его главным человеком в НФА — А. Алиев. Знал, что роль Неймата Панахова — мальчик на побегушках».
Была разыграна многоходовая комбинация по возврату Гейдара Алиева к власти. Сначала надо было дождаться развала СССР, чтобы исключить возможность повторного вмешательства Советской армии, а затем убрать Муталибова руками Народного Фронта.
В июле 1990 г. Г. Алиев вернулся в Азербайджан — сначала в Баку, а затем в Нахичевань. В июле 1991 г. бывший член Политбюро Г. Алиев вышел из КПСС — вторым из высших партийных чинов после Б. Ельцина, сделавшего это годом раньше (а третьим 16 августа 1991 стал А. Яковлев). 3 сентября 1991 г. Г.Алиев был избран председателем Верховного Меджлиса Нахичеванской АССР. По его словам, единственным официальным лицом, поздравившим его с избранием, стал председатель ВС Армении Л. Тер-Петросян. Лейтенант поздравил генерал-майора.
Неожиданное избрание Алиева главой Нахичеванской автономии было приурочено к президентским выборам в Азербайджане, которые должны были состояться 8 сентября. А. Муталибов, используя «административный ресурс», стал единственным кандидатом. Возглавив Нахичевань, Алиев отменил проведение выборов президента Азербайджана на территории Нахичеванской АССР, а на остальной территории Муталибов получил 98,5% голосов, после чего 10 сентября пообещал разобраться с мятежными нахичеванцами. На это Алиев ответил, что «в случае вооруженного нападения со стороны Баку 330 тысяч жителей Нахичевани готовы защищать свой Меджлис, как россияне защищали Белый дом в дни путча». Но Муталибов не решился применить силу. И это уже была третья ошибка с его стороны (после первой — переговоров с Алиевым в Москве, и второй — разрешения ему вернуться на Родину). Восточный правитель обязан применять силу. Или не поймут: «А царь-то не настоящий!».
Уже в январе 1992 г. НФА начал акции протеста с требованием отставки Муталибова. Как пишет 3. Ализаде в книге «Конец второй республики»: «Паралич власти был налицо. Силовые структуры из-за саботажа и подрывных действий НФА и слабоволия президента практически бездействовали. Президенту даже информацию из МВД передавали неверную (…) Несчастный президент был в изоляции из-за некомпетентности своего ближайшего окружения и отсутствия единой управляющей и направляющей воли в государстве».
6 марта А. Муталибов ушел в отставку и назначил и.о. президента Я. Мамедова, но, воспользовавшись неудачами азербайджанской армии в войне в Нагорном Карабахе, попытался вернуться к власти. 14 мая 1992 г. ВС Азербайджана восстановил его в должности президента. В ответ 15 мая НФА начал вооруженное восстание, а правоохранительные органы, как положено, бездействовали. «И они не могут идти против народа. Ну, натурально, не могут!». Вечером 15 мая 1992 г. А. Муталибов сбежал из президентского дворца, добрался до военного аэродрома и на российском военном самолете вылетел в Москву.
НФА захватил власть, но большинство активистов о связях своих лидеров с Г. Алиевым не знали, поэтому понадобилась промежуточная стадия. 7 июня А. Алиев (Эльчибей) был избран президентом, и два Алиева сыграли роли Керенского и Ленина в 1917 г.
Сначала дождались, пока азербайджанская армия потерпит еще ряд поражений в Нагорном Карабахе, чтобы народ захотел «сильной руки». Затем 28 июня 1993 г., когда нужная атмосфера в стране была создана, в Гяндже был поднят мятеж под руководством полковника С. Гусейнова, и 30 июня мятежные войска начинают марш на Баку, и в этот же день А. Алиев (Эльчибей) предлагает Г. Алиеву должность премьер-министра, а 15 июня Г. Алиева избирают председателем Милли Меджлиса (парламента) — именно эта должность дает право исполнять обязанности президента в случае его отставки.
В ночь с 17 на 18 июня А. Алиев (Эльчибей) улетает в Нахичевань, и власть переходит в руки Г. Алиева. 3 октября 1993 г. Г. Алиев был официально избран президентом Азербайджана. Т.о., агент 5-го Управления КГБ нахичеванец А. Алиев сдал пост генерал-майору КГБ нахичеванцу Г. Алиеву.
Такова была обстановка на национальных окраинах. Ну и для полноты картины необходимо упомянуть про крупнейшую союзную республику — РСФСР. Здесь с помощью КГБ к власти был приведен Б. Ельцин.
Создание «народных фронтов», разжигание националистических и сепаратистских настроений, организация погромов, массовых беспорядков и акций протеста были нужны КГБ СССР для того, чтобы создать в союзных республиках такие настроения среди населения и политической элиты, которые бы обеспечили отделение этих республик от Советского Союза.