1 марта 2006 года бои с партизанами в Багдаде приняли столь острый характер, что американцы были вынуждены ввести в столицу тяжелую технику. За этот день в Багдаде был совершен десяток терактов. В третью годовщину начала агрессии было подсчитано, что за три года войны американцы потеряли в Ираке 2300 солдат. За это же время жертвами похищений стали около 500 иностранцев. 19 марта в США прошли массовые антивоенные демонстрации против войны в Ираке. Буш по-прежнему уверял, что США побеждают в Ираке. Популярность Буша упала до 30 %, а до двух третей американцев осуждало его войну в Ираке.
Летом 2006 года в сенате США начались слушания по войне в Ираке. Атакам подвергся министр обороны Рамс-фельд, который вскоре был отправлен в отставку. В конце августа сообщали, что потери США в Ираке превысили 2600 человек, а 1 сентября было объявлено, что США посылают еще 13 тысяч солдат в Ирак.
В конце сентября 2006 г. был опубликован секретный доклад ЦРУ, в котором признавалось, что вторжение США в Ирак привело к усилению угрозы терроризма. Буш решительно отвергал этот вывод. Однако к этому времени 71 % американцев требовали вывода войск из Ирака, а 61 % одобряли нападения иракцев на американских солдат. Почти 80 % опрошенных считали, что американские войска провоцируют насилие в стране. Вудворд, автор разоблачительных книг по «Уотергейту», в своей новой книге по иракской войне утверждал, что нападения на американцев в Ираке происходят каждые 15 минут.
Проявлением кризиса политики правительства в Ираке стало поражение республиканцев на так называемых промежуточных выборах 2006 года. В обеих палатах конгресса демократы получили большинство, большая часть губернаторов штатов стали демократами.
После поражения на выборах критика политики США в Ираке усилилась. В сенате Хиллари Клинтон, которая в начале 2003 года поддерживала войну в Ираке, теперь обличала Буша и его министров за эту авантюру. С критикой политики Буша выступал и малоизвестный тогда широкой публике за пределами США чернокожий сенатор Барак Обама.
В начале декабря 2006 года вышел в свет доклад комиссии, которую возглавлял бывший государственный секретарь США Бейкер. В докладе содержался призыв к Бушу начать вывод войск из Ирака. В докладе сообщалось, что война уже поглотила 400 миллиардов долларов, унесла 2900 американских жизней, а свыше 21 тысячи американцев было ранено.
В ответ Буш отказывался назвать срок вывода американских войск из Ирака. Зато как о большой победе сообщалось о казни Саддама Хусейна 30 декабря 2006 года. Ответом на казнь президента Ирака и его министров стала серия терактов в Багдаде и других городах страны с первых же дней 2007 года.
26 апреля палата представителей, а затем 27 апреля сенат проголосовали за начало вывода американских войск из Ирака осенью 2007 года. Одновременно было принято решение о прекращении финансирования войск США. 2 мая Буш наложил вето на резолюцию конгресса о прекращении войны в Ираке, заявив, что она наносит удар по американским солдатам.
Летом 2007 г. в США разразился новый скандал, связанный с разоблачением приема в действующую армию бывших уголовников. Некоторые из них получили боевые награды в Ираке. Они избивали офицеров, терроризировали рядовых солдат, зверски убивали местных жителей.
16 сентября в Вашингтоне состоялась мощная демонстрация против войны в Ираке. Контрдемонстрация, проведенная одновременно в столице, была жалкой. Через день вышла в свет книга воспоминаний влиятельнейшего экономиста Гринспена, в которой он писал, что война в Ираке началась из-за нефти. В этот день цена на золото составила 728 долларов за унцию, а цена на нефть — от 77 до 80 долларов за баррель.
14 ноября 2007 года конгресс США опубликовал доклад, в котором сообщалось, что правительство Буша затратило на войны в Пакистане и Афганистане в 2 раза больше, чем обещало. К тому времени эти затраты составляли 21 тысячу долларов на среднюю американскую семью из 4 человек. Между тем Буш просил еще треть триллиона на эти войны.
5-ю годовщину начала войны в Ираке 19 марта 2008 года Америка встретила новыми демонстрациями протеста. Демонстранты напоминали о почти 4 тысячах погибших американских солдат и почти миллионе уничтоженных иракцев. Они несли плакаты, на которых было написано, что за 5 лет войны США потратили полтриллиона долларов на войну в Ираке и связанные с этим расходы. Комментаторы замечали, что против интервентов в Ираке сражается около 40 тысяч партизан, что около 200 тысяч людей активно поддерживают их боевые действия. Только теперь стало ясно, куда исчезла армия Ирака после блицкрига США. Свидетельством готовности народа Ирака решительно выступить против оккупантов стало новое вооруженное восстание шиитов под руководством ас-Садра в Басре в марте 2008 года. В это же время, выступая по случая 5-й годовщины начала войны, Буш призывал американцев к терпению и говорил, что победа не за горами.
Новые сообщения о действиях партизан в Ираке перекликались с новостями из Афганистана о безуспешных попытках сил коалиции подавить сопротивление талибов.
Прочно завязнув в двух войнах, подобных вьетнамской, США не прекращали, а порой наращивали враждебную кампанию против других стран мира, особенно тех, которые были включены ими в «ось зла». 7 октября 2005 г. Буш сделал угрожающее заявление в адрес Ирана и Сирии. 21 октября был опубликован доклад международной комиссии в связи с убийством Харири, в котором ответственность за это преступление возлагалась на Сирию и просирийские силы в Ливане. 26 октября Буш выступил с новыми угрозами в адрес Сирии, требуя введения против нее санкций. Однако за этими угрозами ничего не последовало.
Очевидно, что продолжавшиеся войны в Ираке и Афганистане не позволяли Соединенным Штатам предпринимать активные действия на других фронтах. Поэтому 19 августа 2005 г. на многосторонних переговорах в Пекине по поводу ядерной программы КНДР США объявили о том, что они не намерены нападать на КНДР. (В то же время КНДР объявила о намерении развивать ядерную энергетику в мирных целях.)
Было очевидно, что страны, которые являлись для США потенциальными мишенями для агрессии, маневрировали, но не отступали перед американским диктатом. Соглашаясь идти на переговоры по поводу своих программ развития атомной промышленности, правительства Ирана и КНДР игнорировали американские угрозы, продолжая развивать ядерную энергетику и одновременно укрепляя свой оборонный потенциал. Так, в начале июля 2006 года КНДР произвела запуск нескольких ракет «Тэпходон-2» дальнего радиуса, а 9 октября Пхеньян сообщил о подземном ядерном взрыве в КНДР.
Осознавая, что у США нет реальных возможностей для развязывания новой войны, на сей раз против КНДР, американские СМИ постарались преуменьшить северокорейские достижения в создании ракетно-ядерного потенциала. Сообщали, что ракеты упали недалеко от побережья, а испытание атомного оружия не привело к реакции взрыва. Но, кажется, это было подобно поведению лисицы, уверявшей, что она не ест виноград лишь потому, что он зелен. Действия КНДР свидетельствовали о том, что там поняли неспособность США вести сразу несколько «вьетнамских войн» одновременно.
Вызов США и их союзникам бросал избранный в конце июня 2005 года президентом Ирана Ахмадинежад. Во время своей инаугурации в начале августа 2005 года Ах-мадинежад отверг западноевропейские предложения по атомной программе Ирана.
Хотя решение Ирана возобновить атомную программу вызывало шумную кампанию в СМИ, США на первых порах не предпринимали никаких действий против Ирана. Однако в начале января 2006 года конфликт вокруг решения Ирана возобновить ядерную программу стал набирать обороты. 8 марта 2006 года так называемое иранское досье МАГАТЭ было передано в Совет безопасности. Ахмадинежад пригрозил прекратить поставки нефти в США. Кризис разрастался.
29 марта 2006 года Совет безопасности призвал Иран в течение месяца возобновить переговоры с МАГАТЭ. Однако Китай и Россия добились устранения из текста резолюции слов об угрозе миру и безопасности со стороны Ирана. 13 апреля в Иран прибыл генеральный директор МАГАТЭ Эль-Барадеи для ведения переговоров с иранским правительством по поводу ядерной программы страны. Но, не дожидаясь результатов переговоров, Кондолиза Райе потребовала, чтобы Совет безопасности принял суровые меры в отношении Ирана. Через день Райе потребовала принятия «силового решения против Ирана», а 19 апреля Буш пригрозил Ирану ядерным нападением. 20 апреля 2006 года было официально заявлено, что США не исключают войны с Ираном, если не будут урегулированы вопросы ядерной программы этой страны.
После нескольких недель громких заявлений 30 мая 2006 года Кондолиза Райе объявила, что США готовы пойти на переговоры с Ираном, если тот прекратит обогащение урана. В ответ правительство Ирана заявило о своей готовности вести переговоры без предварительных условий.