Целью курсов была ступенчатая подготовка военно-политических руководителей местного, районного и областного масштаба с учетом образования и специальных знаний курсантов. Первоначальные программы включали военно-политическую, тактическую и военно-техническую подготовку, изучение топографии и организации вооруженных сил буржуазии. Все эти планы не были реализованы одномоментно в течение 1924 г., но начало было положено при разработке учебных программ для нелегальной военной организации компартии Болгарии.
В военно-политической области изучались теория и практика вооруженного восстания: во-первых, ленинская теория вооруженного восстания (предпосылки пролетарской революции; роль и место вооруженного восстания в ее процессе; превращение войны национальной или империалистической в войну гражданскую); во-вторых, организационная подготовка вооруженного восстания («людской материал и его свойства»; общие принципы организация своих сил; военно-политическое воздействие на свои части и части противника); в-третьих, организационные мероприятия после захвата власти (организация Красной армии, милиции, пролетарских спецслужб по типу ВЧК, аппарата гражданского управления; отношение к старому государственному аппарату; использование его элементов в строительстве нового аппарата власти).
В области нелегальной работы (конспирация, агентурная разведка, борьба с полицией и контрразведкой буржуазного правительства) курсанты спецшколы знакомились с методами работы полиции по разработке подпольных организаций, изучали методы выявления слежки и ухода от нее, приобретали навыки пользования шифрами, кодами, симпатическими чернилами и т. п., учились внедрению агентуры в органы управления и способам сбора информации, подготовке аппарата своих секретных служб. Одним из учебников в этой области являлся сборник статей «Техника большевистского подполья», изданный Истпартом в 1924 г.
Тактический цикл преследовал цель научить правильному анализу обстановки, быстрому принятию решений, твердому проведению принятых решений в жизнь. Обучение осуществлялось по принципу от простого (захват и оборона здания) к сложному (захват ж.-д. узла, населенного пункта и т. п.). Далее следовали организация и проведение вооруженного восстания в городе при различном соотношении сил (восставших и правительственных) и проработка операций в масштабе района. Разбору подлежали следующие вопросы: скрытое сосредоточение своих сил, уличный бой, действия в особых условиях (ночью, в горах и лесах, среди враждебного населения), диверсионные и партизанские действия и т. п.
Особое внимание отводилось изучению тактики уличного боя. Основным пособием по этой теме стал сборник статей «Уличный бой», изданный в 1924 г. под редакцией В. Муратова. В числе разделов, изучаемых на картах и на практике, были следующие: разоружение полицейских постов и участков; атака и блокада казарм; атака занятого противником здания; захват занятого противником городского района; боевые действия с целью захвата города; оборона здания; устройство и оборона баррикад; оборона городского района, в том числе переправ; оборона захваченного города.
В области партизанской войны учебниками являлись книги В. Н. Клембовского «Партизанские действия», М. С. Свечникова «Революция и гражданская война в Финляндии 1917–1918 гг.» (1923 г.), П. Тихомирова «Уроки болгарского восстания. Сентябрь 1923 г.» (1924 г.) и П. П. Каратыгина «Партизанство. Начальный опыт тактического исследования» (1924 г.). Автор последнего труда был одним из ближайших помощников М. В. Фрунзе и мог рассказать о партизанских действиях в Туркестане в 1919–1920 гг. и на Украине в 1920–1924 гг., опираясь на собственный опыт. Под партизанством П. П. Каратыгин понимал действия вооруженных отрядов повстанцев или выделенных из состава армии воинских частей, имеющих задачу истребления противника путем нападения в моменты его наименьшей способности к сопротивлению и не связывающих себя постоянным вооруженным соприкосновением с врагом.
В военно-технической области курсантам надлежало изучать материальную часть оружия и пройти стрелковую подготовку по всем видам стрелкового оружия, включая минометы и автоматические стрелковые устройства, намного опередившие конструкторские идеи своего времени. Также изучались оптическая и акустическая сигнализация и средства связи: телефон, телеграф, радио. Несколько часов посвящалось средствам вождения: велосипедам, мотоциклам, автомобилям, броневикам и бронепоездам. Подрывное дело предусматривало ознакомление со взрывчатыми веществами, подрывными средствами и их применением в контексте выполнения задач операций и для противодействия противнику.
В ночь с 3 на 4 августа 1924 г. отряд С. А. Ваупшасова совершил налет на пограничный город Столбцы. Основной целью операции были захват тюрьмы и освобождение руководителя Военной организации компартии Польши С. Скульского, а также руководителя компартии Западной Белоруссии П. Корчика. Партизаны разгромили местный гарнизон, железнодорожную станцию и городской полицейский участок. Регулярные воинские части – пехота, артиллерия и броневики – вошли в город только через несколько часов после партизанского налета. В уезде было введено осадное положение.
15 сентября в селе Татарбунары (Бессарабия) началось вооруженное восстание против румынских властей под руководством местной коммунистической организации, которую возглавлял А. Клюшников. Восставшие создали ревком и провозгласили восстановление советской власти в Бессарабии. Восстание охватило почти весь юг Бессарабии. На его подавление королевское правительство Румынии направило войска и флот. 19 сентября румынские войска сломили упорное сопротивление повстанцев. Погибли более 3000 человек.
В течение лета 1924 г. ЦК компартии Эстонии все больше склонялся к тому, что при должной подготовке вооруженное восстание имеет шансы на успех. 3 августа в Таллине прошла организованная коммунистами антивоенная демонстрация, в которой, несмотря на противодействие полиции, приняли участие более 3000 человек. Этот факт (в числе целого ряда весенних и летних выступлений трудящихся) был воспринят руководством компартии как показатель роста революционных настроений пролетариата. На его основании ЦК КПЭ посчитал, что «имеет превосходство над противником» и сможет организовать успешный захват власти.
Организационная и военно-техническая подготовка восстания велась с конца весны в условиях строжайшей конспирации. Все документы составлялись только в шифрованном виде, на планах и картах не допускалось оставлять пометки. Формирование нелегальных боевых отрядов началось с создания троек. В состав троек входили в основном коммунисты, комсомольцы и особо проверенные беспартийные рабочие. Тройки создавались в городах Валга, Выра, Нарва, Пярну, Таллин, Тарту и других, а также в некоторых воинских частях. Старший тройки имел связь со связным военной организации. Параллельно шло накопление оружия, боеприпасов и другого снаряжения.
Начиная с «антивоенной недели» (начало августа 1924 г.) компартия не организовывала массовых выступлений рабочего класса из опасений разгрома со стороны контрреволюции. Даже во время «Процесса 149-ти» и расстрела депутата Государственного собрания Эстонии Я. Томпа (за три дня до восстания!) массы не вышли на улицу. Было решено, что вооруженные боевики выступят внезапно, с целью захватить противника врасплох. В этом отношении организация восстания носила характер заговора.
К середине ноября подготовка восстания в Эстонии вступила в завершающую стадию. Боевые тройки свели в десятки, из десятков сформировали роты и батальоны. В батальон входило 150–200 штыков. Всего в составе Военной организации КПЭ насчитывалось около тысячи человек, из них в Таллине – около четырехсот. Общее руководство подготовкой восстания осуществлял член ЦК КПЭ Я. Я. Анвельт.
17 ноября 1924 г. на заседании Политбюро ЦК РКП (б) М. В. Фрунзе сделал доклад о положении в Эстонии. Было принято решение оказать компартии Эстонии политическую и материальную помощь. Одной из таких мер стало привлечение эстонских, латышских и финских коммунистов, проживающих в СССР (всего около 10 000 штыков), для оказания помощи революционному правительству советской Эстонии. Также в Эстонию были направлены около шестидесяти сотрудников военной разведки и командиров Красной армии, эстонцев по национальности.
К концу ноября 1924 г. подготовка Военной организации КПЭ к вооруженному восстанию была в основном завершена. Согласно плану, восстание должно было начаться в городах Таллин, Нарва и Пярну, а затем перекинуться на другие населенные пункты. В ходе восстания предполагалось разгромить или нейтрализовать воинские подразделения противника и сразу после овладения Таллином создать революционное правительство Эстонии. Новое правительство объявило бы о восстановлении советской власти и обратилось за помощью к СССР. Овладеть основными стратегическими пунктами планировалось в течение суток.
