Царский указ, объявленный 5 сентября 1686 г. в Москве, извещал о начале русско-турецкой войны (1686–1699 гг). Русские полки Большого, Белгородского и Севского разрядов прибыли на Украину и, разместившись в Ахтырке, Сумах, Красном Куте, готовились к походу на Крымское ханство. Казацкие полки Левобережной Украины получили царский указ также быть готовыми к военным действиям.
Готовя силы к походу на Крымское ханство, русское правительство активизировало дипломатическую деятельность, стремясь расширить антитурецкую коалицию. С этой целью в начале 1687 г. русские послы посетили Англию, Францию, Флоренцию, Брандебург, Данию, Швецию. Однако эти страны не включились в борьбу против Османской империи. Это не остановило решительные действия России.
В мае 1687 г. 150-тысячная русская армия под командованием В. В. Голицина выступила в поход. Вблизи р. Самары к ней присоединились казацкие полки общей численностью 50 тыс. чел. во главе с гетманом И. Самойловичем. Войска двигались крайне медленно и осторожно. К половине июня они достигли р. Конские Воды (ныне р. Конка), ни разу не встретив на своем пути отрядов крымских татар. Форсировав реку, армия расположилась в урочище Великий Луг, а затем продолжила движение по бескрайней степи на юг.
Для участия в Крымском походе частично были привлечены и донские казаки. Двигаясь на соединение с русским войском, они разгромили большой татарский отряд у р. Овечьи Воды. В то же время другие отряды донских казаков осуществили несколько морских походов на Крым.
Дальнейшее продвижение русской армии и украинских казацких полков было сопряжено с большими трудностями. Крымские татары подожгли степь. Изнемогая от зноя и жажды, задыхаясь в клубах дыма стенного пожара, не имея подножного корма для лошадей, войска подошли к р. Карачакрак. Понимая, что дальше двигаться по неизведанной степи опасно и нецелесообразно, русское командование приняло решение прекратить поход. Оставив в низовьях Днепра 30 тыс. русских солдат и украинских казаков, армия отошла на Полтавщину.
На обратном пути русской армии и казацких полков на берегу р. Коломак произошла замена гетмана Левобережной Украины. Генеральная старшина, недовольная самовластием и своекорыстием И. Самойловича, обратилась к царскому правительству с просьбой отстранить его от гетманства. Эту просьбу поддержал главнокомандующий русской армией В. В. Голицын. С согласия царского правительства И. Самойловича арестовали и отправили в Сибирь.
Узкий круг старшинской верхушки на раде в Коломаке 25 июля 1687 г. избрал гетманом генерального есаула И. Мазепу, кандидатуру которого поддержал и В. В. Голицын, заранее получивший крупную взятку.
И. Мазепа — предатель украинского народа и сторонник шляхетской Польши, выходец из правобережной украинской шляхты. В юношеские годы он воспитывался при дворе польского короля Яна II Казимира. В 1663–1664 гг. Мазепа принимал активное участие в подготовке вторжения шляхетских войск на Левобережную Украину, затем некоторое время находился в войске правобережного гетмана П. Дорошенко, пользуясь его доверием и выполняя тайные поручения. В 1674 г. он оказался на Левобережной Украине, где добился должности генерального есаула и приобрел значительные имения. Мазепа был представителем самой реакционной части казацкой старшины, стремившейся укрепить свою власть на Украине и разорвать связи с Россией.
Рада приняла Коломакские статьи, усиливавшие царскую власть на Левобережной Украине. Гетман лишился права отстранять от должностей генеральную старшину без согласия царского правительства, а старшина — переизбирать гетмана. Одновременно укреплялось привилегированное положение старшины, подтверждалась незыблемость их владения имениями и предусматривалось пожалование дворянства «заслуженной» старшине. Включались статьи о непременном возвращении русским помещикам беглых крестьян, широких полномочиях полковников в борьбе против антифеодальных выступлений, о праве гетмана содержать полк стрельцов для личной охраны. В целом Коломакские статьи отвечали классовым интересам казацкой старшины и русских феодалов.
Русское государство готовилось к предстоящему второму походу на Крым. Основное внимание правительство уделяло строительству вблизи устья р. Самары опорного пункта для оборонительных и наступательных действий. Прибыв в указанное место, русские солдаты и украинские казаки заложили там Новобогородицкую крепость, имевшую важное стратегическое значение. Осенью 1688 г. казацкие полки осуществили успешный поход к Очакову, нанеся турецкому гарнизону и отрядам крымских татар значительный урон.
В течение 1688 г. активизировалась дипломатическая деятельность стран — членов «Священной лиги». Правительство Речи Посполитой, не предпринимая действенных мер по подготовке к войне против Крымского ханства, всячески подстрекало к выступлению Русское государство. Царское правительство, со своей стороны, усиленно вело переговоры с польским королем Яном III Собесским и австрийским императором Леопольдом I о совместных действиях против Турции.
В сентябре 1688 г. в Москве был издан царский указ, который официально извещал о новом походе на Крым. Ранней весной 1689 г. русская армия (112 тыс. человек) под командованием В. В. Голицына двинулась на юг. На р. Самаре к ней присоединились украинские казацкие полки (около 40 тыс.). Отразив нападение неприятельских войск в районе Черной Долины, русская армия подошла к Перекопу, расположенному на узкой полосе суши, соединяющей Крымский полуостров с материком. К этому времени стало известно, что Речь Посполитая не поддержит военные действия Русского государства и на этот раз. Воспользовавшись сложившейся ситуацией, крымский хан сосредоточил у Перекопа все орды, кочевавшие в Северном Причерноморье. После первых же боев русское командование убедилось в том, что взять Перекоп штурмом невозможно. Переговоры с ханом о перемирии на выгодных для России условиях не принесли желаемых результатов. Осада крепости исключалась ввиду предполагаемой ее продолжительности, тяжелых климатических условий, а также угрозы со стороны крепостных гарнизонов, сосредоточенных в низовьях Днепра. Даже в случае успешного штурма Перекопа русская армия вынуждена была бы продолжать борьбу с ханским войском в неблагоприятных условиях и на значительном удалении от своих баз снабжения. Речь Посполитая и Австрия не поддержали Россию. При таких обстоятельствах русское командование решило прекратить поход. В конце мая русские войска и казацкие полки достигли южных границ и, оставив в Новобогородицкой крепости гарнизон (6 тыс. чел.), отошли вглубь своей территории.
Крымские походы 1687 и 1689 гг. положили начало активным наступательным действиям Русского государства на Крымское ханство как непосредственный очаг опустошительных вражеских вторжений на южные русские и украинские земли. Попытка согласовать свои действия с боевыми операциями союзников не имела успеха и в большой мере обусловила неудачу самих походов. Тем не менее в Крымских походах русская армия приобретала практический опыт ведения войны в неблагоприятных условиях южных степей. Крымские походы показали назревшую необходимость мобилизации значительных военных сил и экономических ресурсов для борьбы против Турции и Крымского ханства. Международное значение этих событий заключалось в том, что русская армия отвлекла крупные военные силы Крымского ханства, лишив турецкого султана помощи в войне против стран «Священной лиги», и позволила тем самым союзным австрийским и венецианским войскам одержать ряд побед в Венгрии, Далмации и Морее.
Отражение набегов татарских феодалов на украинские земли. Походы казаков под руководством С. Палия. Опустошительные вторжения турецких и татарских захватчиков в пределы Русского государства продолжались. Они превращали в пустыри многие населенные пункты, препятствовали освоению плодородных южных земель, тормозили развитие торговли со странами Ближнего Востока и Средиземноморья. Сотни и тысячи людей попадали в неволю.
Русские ратные люди, украинские и донские казаки отражали вражеские набеги, освобождая захваченный ясырь. Активное участие в борьбе против турецких и татарских феодалов-завоевателей принимали казацкие полки, охранявшие границы Левобережной Украины. Неся сторожевую службу, они извещали о продвижении татарских отрядов, что позволяло своевременно организовывать решительный отпор. Однако вражеские отряды неоднократно проникали на украинские земли, в частности на Полтавщину и Миргородщину, причиняя значительный ущерб населению этих районов.
Готовясь к вторжению на украинские земли, татарские феодалы решили использовать авантюриста Петра Иваненко, известного под именем Петрика. В 1691 г. он бежал с Левобережной Украины, где служил канцеляристом, в Крым и от имени несуществовавшего «княжества удельного Киевского, Черниговского и Войска Запорожского» заключил (1692) фиктивный союз с крымским ханом. Петрик подстрекал крымских феодалов к войне против Русского государства, рассчитывая с их помощью осуществить свои коварные замыслы. В июне 1692 г. 20-тысячное ханское войско во главе с калгою вместе с отрядом Петрика, названного «гетманом козацким ханским», вторглось на Левобережную Украину. Петрик пытался привлечь к участию в своей авантюре и казаков Запорожской Сечи, но это ему не удалось. Запорожцы решительно выступили против авантюриста и его приспешников.