Турчин оставил один из своих полков, 18-й Огайский, для охраны небольшого города Атенс (Афины). В мае конный отряд южан совершил внезапный набег на городок и жестоко расправился с солдатами 18-го полка, не ожидавшими нападения. Мятежники не брали пленных и перебили всех северян, попавших к ним в руки.
Полковник Турчин, получив сведения о кровавой расправе над солдатами его полка, поспешил в Атенс, чтобы произвести расследование. Там он получил сведения, что жители города, сочувствовавшие конфедератом, стреляли в северян из окон домов. Турчин якобы разъярился и отдал город на расправу своим солдатам. Что там произошло, точно неизвестно. Исследователи приводят различные версии. Известно только, что жители города пострадали.
А. Ф. Степанов пишет о налете южан на город: «Атака была отбита, но многие вероломные жители города пострадали от рук разъяренных солдат 18-го Огайского полка». В таком же духе пишет Джеймс А. Трайкл. «Полковник взорвался: „Я закрываю глаза на два часа“, — провозгласил он и отдал город в полное распоряжение своих солдат». Проф. Парри также отмечает, что «были эксцессы со стороны чинов бригады», но в то же время считает, что сообщения об актах мести бригадой Турчина очень преувеличены. И наконец, один из советских исследователей, Д. И. Заславский, пишет следующее: «Сражение при городе Афины (Алабама) носило особенно жестокий характер. На зверства южан солдаты Турчанинова ответили беспощадной расправой. Это дало повод обвинить Турчанинова в жестокости».
Начальник дивизии, в составе которой находилась 8-я бригада, генерал Митчелл прибыл в Атенс и произвел там расследование. Он не нашел никакого состава преступления со стороны Турчина и был вполне удовлетворен тем, что он узнал. Во всяком случае, Митчелл отказался привлекать Турчина к ответственности. Но командующий Армией Огайо не был удовлетворен и, возможно, под давлением недругов Турчина отдал приказ о предании его военному суду (А. Парри).
На суде председательствовал бригадный генерал Джеймс А. Гарфилд, впоследствии 20-й президент США. Турчин держался на суде с большим достоинством и категорически отказался признать себя виновным во всех предъявленных обвинениях, кроме одного — присутствия в армии его жены, каковое он объяснил тем, что она находилась в его бригаде в качестве врача.
Дж. А. Трайкл отмечает, что Гарфилд в письме к другу писал о суде следующее: «Мы ожидали увидеть неотесанного мужика, типичный продукт царской власти… Однако он держался как человек глубоко благородной души и тем самым покорил наши сердца». Турчину инкриминировали молчаливое согласие на ряд расправ, учиненных его солдатами над мирным населением, поведение, недостойное офицера и джентльмена и неподчинение приказам.
Сторонники Турчина утверждали, что военный суд состоял из офицеров, тайно сочувствующих конфедератам и бывших сторонников рабовладельчества. Так это было или нет, но суд признал Турчина виновным. Решением суда полковник Джон Базиль Турчин подлежал исключению из армии США.
Однако этим дело не кончилось. Газеты Севера, особенно в Чикаго, подняли шум, требуя восстановления в правах офицера Турчина, геройски командовавшего Иллинойским полком, а затем и бригадой на полях сражений. Мало того, из Чикаго в Вашингтон во главе с Надин Турчиной отправилась депутация с тем, чтобы вручить президенту Линкольну петицию. Результаты этой акции превзошли все ожидания. Как видно, Линкольн, еще до этих событий имевший намерение повысить Турчина в чине, быстро во всем разобрался и не только восстановил Турчина в правах, но и даровал ему следующий чин — бригадного генерала. Это решение президента, подписанное 17 июня 1862 г., конечно, остановило происки недоброжелателей Турчина.
Теперь Турчин мог вернуться к своим частям, но он медлил. Ему не хотелось возвращаться в свою бригаду опять под команду генерала Бьюэлла, отдавшего его под суд. Он решил выжидать и вернулся в Чикаго, где ему была устроена триумфальная встреча. Жители города преподнесли ему почетный меч.
Генерал Турчин вернулся в армию только в марте 1863 г. и следующие полтора года были, вероятно, самыми блестящими в его военной, боевой карьере. К этому времени генерал Бьюэлл, предавший Турчина суду, сам лишился командования армией за неудачную операцию при Перривилле. Его пост занял генерал майор-Уильямс С. Розекранс. Произошла реорганизация Армии Огайо, и она получила новое название Армии Кумберленда. Этой армии сразу же пришлось вести кровопролитные бои при Стони-Ривер. По сведениям проф. А. Парри в этих боях особенно отличился 19-й Иллинойский полк, командование которым принял бывший помощник Турчина полковник Скотт. Полк понес большие потери и сам Скотт, друг Турчина, погиб в этом бою.
Генерал Турчин, вернувшись в армию, получил под свою команду 3-ю бригаду 4-й дивизии. Это был год, принесший победы Турчину и его бригаде. Замечательными были его участие в сражениях под Чикамогой и за Миссионерский кряж. Своими стремительными и лихими атаками в этих сражениях генерал Турчин открыл путь и дал возможность армии северян войти в Чаттанугу и Ноксвилль.
Год 1863 и особенно сражения под Чикамогой и на Миссионерском кряже явились переломными в этой войне. Первое сражение под Чикамогой произошло 19–20 сентября, когда армия северян встретилась лицом к лицу с главными силами южан. Как всегда в бою, впереди всех шла бригада генерала Турчина. Перед лицом страшного огня южан Турчин приказал бригаде примкнуть штыки и повел своих бойцов в штыковую атаку на позиции южан. Атака была настолько стремительной, что бригада прорвалась сквозь передовые линии южан и оказалась у них в тылу, окруженная явно превосходящими силами противника. Тогда Турчин повернул бригаду и снова отдал приказ «в штыки», на этот раз в обратном направлении. Эта неожиданная новая атака стала известна в истории гражданской войны как Турчинская атака в тылу. Бригада не только вышла из окружения, но еще захватила более трехсот пленных и несколько орудий. Во время этих атак под Турчиным была убита лошадь.
В «Турчинской атаке» погиб русский сержант 19-го Иллинойского полка Александр Смирнов, поступивший в армию северян, чтобы служить под командой Турчина.
В сражении за Миссионерский кряж генерал Турчин командовал 1-й бригадой 3-й дивизии 14-го армейского корпуса. Состав его бригады известен из официального рапорта, в котором Турчин описывал сражение и отмечал отличившихся солдат и офицеров. В бою бригада была в усиленном составе и состояла из следующих полков: 11-го, 17-го, 31-го Огайских, а также 32-го Индианского.
Бригада получила приказ 25 ноября пойти на штурм Миссионерского кряжа вместе с другими бригадами корпуса. Бригады слева и справа, будучи не в состоянии вести наступление под губительным огнем южан, залегли и стали окапываться. Тогда Турчин вскочил, поднял свою бригаду и бросился вверх г. о склону горы. Три полка — 11-й, 31-й и 36-й — были первыми, ворвавшимися на вершину кряжа, в то время как остальные бригады все еще оставались внизу. Вскоре подошли остальные полки Турчина. На вершине бригадой были захвачены три неприятельских орудия.
А. Ф. Долгополов так описывает подвиг Турчина в штурме Миссионерских высот: «Армия северян, прижатая к реке у города Чаттануги, была в опасном положении. Бригадный генерал Турчин лично повел свои войска на штурм Миссионерских высот. Внезапной безумной атакой были захвачены неприступные пэзиции конфедератов. Была захвачена вся артиллерия противника, знамена, пленные, обозы».
Историки отмечают, что в результате захвата Миссионерского кряжа бригадой Турчина для армии генерала Шермана открылся путь к основным базам противника. Судьба гражданской войны была решена.
Генерал Турчин в своем рапорте о сражении особенно отмечал решительность и смелость полковых командиров своей бригады и представлял их к наградам и повышению. Он также отметил, что было захвачено много пленных, которые были им отправлены в тыл без счета из-за недостатка времени. Потери бригады были существенные: убито 6 офицеров и 51 солдат, ранено 11 офицеров и 211 солдат. Четыре солдата пропали без вести.
В архиве есть еще один рапорт генерала Турчина, от 1 марта 1864 г., в котором он сообщал, что его бригада, состоящая из полков: 11-го, 89-го и 92-го Огайских и 82-го Индианского, выступила 22 февраля из Чаттануги в Ринггольд, в штате Джорджия. Пройдя Ринггольд, бригада 25 февраля попала под артиллерийский огонь неприятеля, находившегося на вершине холма. Полки Турчина с ходу пошли в атаку и захватили позиции после ожесточенного боя. В этом неожиданном бою бригада потеряла 10 человек убитыми и 77 ранеными. Среди раненых было два офицера.
После этих серьезных боев бригада на пути к Атлантическому океану участвовала только в небольших стычках. Неприятель явно уклонялся от серьезных боев и отступал. Турчин дошел со своей бригадой до реки Чаттахучи, от которой оставалось всего шесть миль до пункта, с которого можно было видеть океан. Но до океана Турчин не дошел.
