В декабре 2001 возглавляемое Санакоевым правительство Южной Осетии, согласно Конституции Южной Осетии, сложило свои полномочия в связи с выборами нового президента (статья 75, часть 1. Перед вновь избранным Президентом Республики Южная Осетия Правительство Республики Южная Осетия слагает свои полномочия), которым был избран Эдуарда Кокойты. После отставки Санакоев жил в Южной Осетии, затем — в Северной Осетии.
В сентябре 2006 однофамилец Дмитрия Владимир Санакоев основал «Союз национального спасения Южной Осетии» (впоследствии — движение «Народ Южной Осетии за мир»). В его состав вошли также Майя Чигоева-Цабошвили (глава грузино-осетинского объединения «Ибер-Ирон»), Георгий Чигоев, Теймураз Джерагоев, Джемал Каркусов (бывший министр внутренних дел непризнанной РЮО) и Уразмаг Каркусов. 12 ноября 2006 «Союз национального спасения» организовал в неподконтрольных югоосетинским властям районах Южной Осетии президентские выборы, в которых участвовали пять кандидатов, в основном представлявших сам Союз (это были Майя Чигоева-Цабошвили, Георгий Чигоев, Теймураз Джерагоев, Тамара Чараева и Дмитрий Санакоев). Санакоев получил около 80 % голосов.
«Курс будущего правительства уже определен народом, избравшим нас. Я рад, что избиратели, в том числе и грузинская часть населения Южной Осетии, таким образом, участвовали в определении будущего государственного устройства Южной Осетии. Это в первую очередь установление мира в зоне конфликта. Именно с этого мы и начнем разговор с властями Грузии, а также с представителями мирового сообщества, в том числе России».
Инаугурация прошла в южноосетинском селе Курта 7 декабря 2006. По поводу этого мероприятия журнал «Профиль» отмечал: «лидер осетинского землячества Грузии, который был членом „альтернативного» ЦИК, «избравшего» Южной Осетии «альтернативного» президента Санакоева, не скрывал в беседе со мной, что его вынудили принять участие в этом мероприятии сотрудники Министерства полиции и общественной безопасности, продержавшие его у себя пять часов».
Дмитрия Санакоева грузины раскручивали по полной. Знакомили с представителями Евросоюза. Санакоев участвовал во всевозможных встречах с чиновниками НАТО, выступал на «круглых столах», докладывал о «чудовищных нарушениях прав человека» цхинвальской администрацией.
Бывший министр обороны Грузии Ираклий Окруашвили назвал Санакоева «карикатурной персоной» и «абсолютно неавторитетным среди осетинского народа», считая его появление в политике единственным результатом попыток Михаила Саакашвили «объединения страны». В 2007 году журнал «Профиль» писал, что «временная администрация» в грузинском селе Курта создана при участии грузинских спецслужб в грузинском селе Курта, называя ее главу Санакоева «проигравшимся карточным игроком». Как отмечал журнал, «вокруг него еще две-три аналогичные фигуры, которых в Цхинвале иначе как предателями никто не называет». 20 декабря 2008 года информационное агентство REGNUM сообщило об убийстве Caнакоева. 2 7 декабря МВД Грузии опровергло эту информацию. По данным южноосетинских спецслужб сейчас Санакоев находится в Тбилиси. Его правительство занимает 4-й и 5-й этажи здания на площади Свободы. За Санакоевым даже сохранили личную охрану.
Дмитрий Санакоев попался на элементарном воровстве: замечен в продаже оружия грузинской стороне, махинациях и хищениях финансовых и материальных средств. Свое состояние, все деньги, вырученные неправедным путем, он проиграл в казино. В основном, во Владикавказе и других городах России, а потом и в Грузии. Санакоев влез в очень большие долги, так что грузинским спецслужбам особо и трудиться не пришлось, вербуя Санакоева. В мае 2007года президент Грузии Саакашвили подписал указ о создании временной администрации Цхинвальского региона, назначив ее главой Д. Санакоева. Прогрузинская администрация базировалась в селе Курта. Факт страшный, но о нем нельзя молчать: сын Дмитрия Санакоева, когда узнал, что его отец стал предателем, пытался покончить жизнь самоубийством.
В тоже время Джамал Каркусов назвал избрание Санакоева чисто американским проектом, идея которого исходила из госдепа США. Курировали проект, рассказывает бывший министр, тбилисские спецслужбы, а точнее, начальник отдела охраны и безопасности в МВД альтернативного правительства Александр Мендзмаришвили. Даже «демократические выборы» организовывали и проводили сотрудники грузинской контрразведки. Европейские наблюдатели этого, как мы помним, не замечали. В департамент контрразведки МВД Грузии приглашали бизнесменов. Им предлагали профинансировать «альтернативное» правительство. Контрразведке никто не отказывал. А само правительство существовало на деньги МВД Грузии. Все средства контролировали финансисты того же департамента контрразведки.
Не успел Дмитрий Санакоев приступить к работе, как в Тбилиси объявили, что на него готовится покушение. Его, по заявлению грузинского МВД, планировал житель Южной Осетии Каха Багаев, «завербованный в 2005 году в Цхинвали резидентом российской разведки Русланом Куциевым». Как говорят в Тбилиси, шпион, задержанный сотрудниками грузинской контрразведки, сознался в том, что собирал информацию о стратегических объектах Грузии и должен был нанять чеченских киллеров для ликвидации Дмитрия Санакоева. Так или иначе, после формирования в Южной Осетии двух правительств Тбилиси и Цхинвали вступают в новый этап обострения отношений.
По данным осетинских спецслужб, Дмитрий Санакоев боялся быть отравленным, и продукты питания ему доставляются исключительно из Тбилиси. Его охраняют сотрудники спецслужб Грузии, а также личная вновь создаваемая охрана. Формированием этого отряда занимался Джемал Каркусов. (экс-глава МВД Южной Осетии, сбежавший при помощи грузинского МВД из цхинвальской тюрьмы, в то время «альтернативный» министр внутренних дел).
С созданием так называемого «альтернативного правительства Южной Осетии» грузинские спецслужбы начали формировать и так называемую «армию Нижней Осетии» основной костяк которой, составят боевики из Панкисского ущелья. У южноосетинских контрразведчиков есть информация о встрече представителя Аслана Масхадова в Грузии Тамары Чармаевой и Михаила Саакашвили. Официально данный факт пока не подтвержден, но о нем говорят как о весьма вероятном событии. Саакашвили и Чармаева обсуждали вопрос о возможном участии чеченских «беженцев» в вооруженном конфликте в Южной Осетии. По информации издания, достигнута негласная договоренность о совместной «справедливой борьбе с русским насилием».
Секретная война, цель которой — вербовка агентов на территории противника или проникновение туда собственной агентуры, определяется понятием «внедрение».
В ходе августовской войны южноосетинским военным удалось завладеть секретными документами, в частности, касающимися вербовки Грузией своих агентов. Из этих документов стало ясно, что сам Дмитрий Санакоев и еще несколько человек из осетинского правительства были завербованы грузинской разведкой еще в 1998 году. Изучив захваченные документы, президент Южной Осетии заявил: «Сейчас можно с уверенностью сказать, что то правительство Южной Осетии почти в полном составе было связано с грузинскими спецслужбами. Они вели дело к полному банкротству республики, чтобы потом ее просто купить за американские деньги».
Понятно, что для грузинских спецслужб жизненно важно было обзавестись агентурой среди осетин. И с уверенностью можно сказать, что в преддверии «пятидневной» войны августа 2008 года грузинской разведке удалось создать на территории Осетии хорошо отлаженную агентуру. Грузинские шпионы были практически во всех властных структурах Южной Осетии: в МВД и КГБ, в паспортных столах.
В главе «Использование секретных агентов» своей книги «Искусство войны» Сунь Цзы раскрывает основы ведения шпионажа так, как это практиковалось китайцами в четырехсотые годы до нашей эры. Автор говорит о пяти видах агентуры: местные жители; лица, имеющие доступ к секретным сведениям; двойники; перебежчики и лица, активно действующие. Многое из этого используется грузинской разведкой и в наши дни.
В феврале 2008 года на территории России был задержан уроженец и житель Южной Осетии Мартин Дзагоев, который специально был завербован грузинскими спецслужбами для проведения террористических актов на территории Южной Осетии. Мартин Дзагоев долгое время находился в международном розыске за совершение общеуголовных преступлений. Дзагоев дал показания, что в июне 2007 года на территории Грузии он был завербован грузинскими спецслужбами и представителем так называемого «альтернативного правительства Санакоева».