Разгром Белого движения на Дальнем Востоке поставил перед союзными державами Антанты вопрос о перспективах интервенции и оккупации этой окраинной части России.
В ноте правительства САСШ от 9 января 1920 года послу Японии в Вашингтоне Шидехара в частности указывалось, что Америка «не собирается создавать каких-либо препятствий, которые японское правительство может найти необходимым для достижения целей, являвшихся основой взаимодействия американского и японского правительств в Сибири». Вскоре премьер-министр Японии Хара публично заявил, что «его страна намерена оказывать сопротивление большевистскому движению и никогда не примирится с таким политическим режимом в Восточной Сибири, который бы противоречил ее интересам». 30 января 1920 года во Владивостоке состоялось секретное совещание представителей миссий Антанты и командования оккупационных войск на Российском Дальнем Востоке. На совещании было решено передать «представительство и охрану интересов союзников на русском Дальнем Востоке Японии». Данное предложение было принято японским военным командованием с благодарностью. В январе — начале апреля т. г. все войска интервентов, кроме японских и чехословацких (французских) покинули Владивосток. Последний транспорт с чехословаками ушел из Владивостокского порта 2 сентября 1920 г.
В апреле т.г. после эвакуации главных сил с Дальнего Востока японское военное командование объявило о своем нейтралитете в отношениях между красными силами и Дальне-Восточной Республики, «столица» которой находилась в Верхнеудинске. В действительности Япония поддерживала военные формирования атамана Семёнова в его действиях против РККА. Отметим, что 4 января 1920 года адмирал Колчак передал генерал-майору (атаману) Г. М. Семёнову «всю полноту военной и государственной власти на территории Российской восточной окраины». Японские войска постоянно участвовали в акциях против партизанских районов в Приамурье и Приморье, где несли особо большие потери. Наконец, в сентябре 1920 года японские войска оккупируют Камчатку, занимая Петропавловск и другие опорные пункты, чего не смогли сделать летом 1905 года.
Весной 1920 года в Приамурье произошло очередное столкновение партизан и японских оккупантов, которое стало вехой в японской внешнеполитической истории.
Этот инцидент, Николаевский инцидент, произошел 12–14 марта 1920 года. Еще в начале февраля отряды красных партизан блокировали японский гарнизон в Николаевске-на-Амуре. Японцы объявили 28 февраля свой нейтралитет в обмен на разблокирование гарнизона, что и было выполнено партизанами. Однако в ночь на 12 марта начальник японского гарнизона майор Исикава нарушает договор и атакует подчиненными ему подразделениями штаб и казармы партизан. В результате последовавших трехдневных боев японский гарнизон был разгромлен.
Николаевский «инцидент» был использован Японией для установления прямого режима оккупации. В ночь на 5 апреля 1920 года японские войска разгромили русские органы местной власти и военные гарнизоны во Владивостоке, Никольск-Уссурийском, Хабаровске, Раздольном, Спасске и ряде других пунктов.
Факты разрушения русских таможенных постов японцами на государственной границе России и Манчжурии свидетельствуют об истинной подоплеке событий 5 апреля: попытки присоединения Японией Русского Дальнего Востока к сфере своего влияния на Азиатском континенте. Соответственно, во всех городах и населенных пунктах на правительственных и муниципальных зданиях вывешивался флаг Японии. В ходе этих событий японские войска захватили северную часть Сахалина.
С конца 1920 года по март 1921 года при посредничестве Франции велись переговоры с Японией о доставке во Владивосток эвакуированной из Крыма армии Врангеля. Токио дал свое согласие и обязался обеспечить ее материально — обмундированием, питанием и вооружением. При этом Японское правительство поставило условием, чтобы по свержению Советской власти вся Сибирь с Дальним Востоком, а также все иностранные концессии на Востоке России и контроль над КВЖД перешли во владение Японии. Франция обязалась выполнить это требование.
В мае 1921 года Япония перевооружает вооруженные части Семенова и лучшие части Колчака, ранее служившие под командованием генерала В.О. Каппеля, погибшего от обморожения в декабре 1919 близ Иркутска, и бросает их на уничтожение Дальне-Восточной Республики, последнего своего конкурента к власти на всем Востоке России.
Народно-Революционная Армия ДВР, контролируемая Москвой, не только разгромила семеновские и каппелевские части, но к сентябрю 1922 года изгнала японские войска из Приморья, которые сконцентрировались во Владивостоке.
В течение всего периода интервенции и оккупации Востока России ведущие державы Антанты предпринимали попытки выработать на международном уровне общие позиции по вопросам отношений с Москвой.
Николаевский «инцидент» приводился Японией на международных конференциях в Вашингтоне, Дайрене и Чаньчуне в качестве доказательной основы для ведения отношений с Россией с позиций права силы. Получив отпор на Вашингтонской конференции (июль 1921 г.) от англосаксонских держав по поводу равенства американского и японского флотов, Япония стала действовать более тонко, без предъявления прямых упреков Москве. Америка хотела рассматривать проблемы Азии и регионов Тихого океана в контексте разоружения, что не совпадало с интересами Токио.
Так на Дайренской конференции (26 августа 1921 г. — 16 апреля 1922 г.) Япония вела переговоры с ДВР, делегацию которой возглавлял премьер-министр Ф. Петров и помогавший ему эмиссар СНК РСФСР Ю. Мархлевский. В состав ДВР входили Амурская, Забайкальская, Приамурская, Прибайкальская, Приморская, Сахалинская и Камчатская области, которые были оккупированы японцами. В конце 1920 года Камчатская область была передана из состава ДВР в РСФСР и японцы вынуждены были покинуть ее пределы.
Еще в июне 1922 года в Токио произошла смена правительства; микадо назначил премьер-министром адмирала Като, одного из инициаторов военной интервенции Антанты на Дальнем Востоке. 24 июня т.г. новое правительство принимает предварительное решение о выводе японских войск из Приморья к 1 ноября т. г. При этом вопрос об эвакуации японцами Северного Сахалина не поднимался.
На Чанчуньской мирной конференции (сентябрь 1922 г.) обсуждались вопросы заключения мира между Японией, РСФСР и ДВР. Камнем преткновения стал Северный Сахалин, отчуждение которого в свою пользу требовала Япония в качестве «компенсации» за «Николаевский инцидент». Как и предыдущая, данная конференция закончилась безрезультатно.
Сразу после того, как делегации ДВР и РСФСР в знак протеста покинули Чанчунь, началось наступление НРА на Владивосток, части которой подошли 19 октября т. г. к окраинам города. В переговорах о сдаче японцами города, чтобы избежать жертв среди мирного населения при его штурме, приняли участие американский и британский консулы. Соглашение было достигнуто 23 октября. В 14.00 25 октября 1922 года японская эскадра покинула бухту Золотой Рог и направилась в открытое море; в 16.00 НРА взяла г. Владивосток под свой контроль. 14 ноября ДВР прекращает свое существование, а 15 ноября 1922 года ВЦИК РСФСР принимает декрет о включении всей территории ДВР (за исключением оккупированного японцами Северного Сахалина) в состав России.
К этому времени внешняя политика Японии начинает испытывать затруднения. Результаты Вашингтонской конференции 1921 года и иммиграционные законы в САСШ, которые практически исключили японцев из числа лиц, имеющих право въезда в Америку, вызвали шок в японском обществе и растерянность среди японских политиков. Кроме того, САСШ заявили о своем несогласии с Версальской системой мира, выстраиваемой Францией и Англией, и объявили о своем уходе из мировой политике и нейтралитете в мировых делах, а также желании заняться собственными внутренними проблемами. Именно этими обстоятельствами объясняется отклонение вплоть до 1933 года Вашингтоном предложений Москвы об установлении дипломатических отношений.
Россия в период 1923–1925 годов также предлагает Японии урегулировать вопрос об оккупации ее войсками Северного Сахалина и установлении дипломатических отношений. Кроме того, мировая пресса постоянно обвиняет Японию в колониальном характере ее действий в Кореи и Маньчжурии, а также растущем милитаризме.
В 1912 году императором стал Ёсихито (Иошихи-то), сын императора Муцухито: эпоха Мэйдзи сменилась эпохой Тайсё (Тайшо). Однако еще в 1889 году Иошихито был объявлен наследником престола и сделал для Японии великое дело: вместе с главным ее архитектором — маркизом Ито создал для страны ее конституцию. Поэтому объявление 25 ноября 1921 года наследником престола принца Хирохито было знаковым событием, которое давало понять, что Япония готова к изменению внешнеполитического курса, в т. ч. по причине невозможности разрешить трудности, появившиеся вследствие антияпонской позиции США. К 1925 году ведущие державы Версальской системы мира — Франция и Англия — уже признали Россию. В этих условиях, когда Япония всячески демонстрировала миру свое желание действовать согласно западной модели внешней и внутренней политики, Токио пошел на урегулирование отношений с Москвой и восстановление дипломатических отношений в 1925 году. В мае 1925 года японские войска покидают Северный Сахалин. Токио тогда указал Москве, что согласно Санкт-Петербургского договора 1875 года о полной передаче острова России Япония сохраняла право на рыбную ловлю в водах Сахалина, захода в его порты и пополнения запасов угля из месторождений на острове. Москва пошла навстречу и согласилась передать Японии рыбные, угольные и нефтяные концессии на Северном Сахалине при условии восстановления российского суверенитета в этой части острова.