КГБ обвиняют в подготовке заказных убийств. В 1995 г. лидеры белорусских националистов из БНФ Позняк и Наумчик через Польшу тайно выехали в США, где заявили, что КГБ подготовил их ликвидацию, и добились статуса политических беженцев. Далее последовали бесследные исчезновения ведущего оппозиционера Карпенко, бывшего министра внутренних дел (при Кебиче) Захарченко, бизнесмена Красовского, адвоката Аксенчика и нескольких других известных людей. Глава Национального банка Винникова исчезла и вскоре обнаружилась за границей, где также заявила о подготовке ее похищения и тайного убийства (незадолго до побега Винникову выпустили из следственного изолятора КГБ, где, по ее словам, признание в хищении бюджетных средств из нее выбивали силой). Одновременно в Белоруссии пропали боссы криминального мира, включая главного минского мафиози Щавлика. Оппозиция утверждала, что на опасных для власти бандитских лидерах спецслужба и созданный ею «эскадрон смерти» отработали схему таких операций, а затем применили ее к главным организаторам политических акций протеста по принципу «Нет человека — нет проблемы». Эти акции — утверждала оппозиция — провели начальник КГБ Мацкевич, министр внутренних дел Сиваков и глава Совбеза Шейман, личный друг Лукашенко и негласный куратор всех спецслужб.
Сведения о существовании белорусского «эскадрона смерти» при спецслужбах дал оппозиции ее секретный агент офицер КГБ Ткачев, которого в 1,999 г. арестовали, после чего он скончался в тюрьме КГБ. Некоторые другие сотрудники спецслужб также работали на оппозицию. Говорил о преступлениях спецслужб их офицер Батурин, ушедший в Польшу. В 2000 г. он заявил о попытке его похищения белорусским КГБ и попросил политического убежища в посольстве США. Перебравшиеся вслед за Батуриным в Польшу офицеры спецслужб Случек и Петрушкевич. подтвердили сведения об «эскадроне смерти». А оказавшийся в Европе в 2001 г. сотрудник антитеррористического «Управления Т» Угляница прямо заявил: близкий оппозиционным кругам коммерсант Красовский и лидер оппозиции Гончар похищены «эскадроном смерти», состоявшим из сотрудников КГБ и бойцов «Алмаза», вывезены на территорию части военного спецназа в Бегополе, убиты и закопаны под полосой препятствий.
Официального подтверждения существования при КГБ «эскадрона смерти» пока нет, но и пропавшие политики не обнаружились. В 2000 г. бесследно исчез тележурналист Завадский из минского бюро телекомпании ОРТ, критиковавший в своих репортажах Лукашенко и побывавший ранее за это в изоляторе КГБ. Расследование его исчезновения дало новый толчок «эскадронному» делу. На этот раз по обвинению в похищении, пытках и убийстве Завадского был арестован бывший боец спецназа «Алмаз» Игнатович, который после ухода из спецназа успел потренировать боевиков ультраправой группы РНЕ и повоевать в Чечне на стороне дудаевских бандформирований. Вслед за Игнатовичем арестованы и другие сотрудники «Алмаза», подозреваемые в похищениях людей, а также начальник группы «Алмаз» Павлюченко, но его спустя несколько дней выпустили из изолятора за недоказанностью. Находившийся в это время в Польше офицер спецслужб Петрушкевич утверждал, что именно Павлюченко был командиром таинственного «эскадрона», а приказы на похищения ему давали Шейман, инициатор создания ликвидационной группы Наумов, глава МВД Сиваков, а оружие для ликвидаций спецназовцам «Алмаза» выдавал начальник минской тюрьмы Алкаев. Алкаев тоже вскоре бежал из страны в Германию и здесь подтвердил факты выдачи служебного оружия бойцам «Алмаза» для неизвестных ему целей именно в дни, совпадающие с несколькими исчезновениями диссидентов. Следствие сумело доказать вину бойцов «Алмаза» Игнатовича, Малика и Гуза, остальные фигуранты по делу «эскадрона» к суду не привлекались. Суд удовлетворился версией о том, что Игнатович вместе с сообщниками похитил и убил журналиста Завадского в связи с тем, что тот видел его в Чечне среди боевиков и мог сообщить об этом органам госбезопасности. На суде весной 2002 г. Игнатович и Малик получили пожизненные сроки заключения, своей вины в убийстве Завадского они не признали. По итогам громкого скандала, привлекшего к спецслужбам Белоруссии внимание всего мира, Лукашенко был вынужден отправить в отставку главу Совбеза Шеймана и руководителя КГБ Мацкевича, с 2000 г. КГБ руководит бывший начальник Службы безопасности президента Ерин.
После выхода из СССР в 1991 г. молдавское руководство во главе с президентом Снегуром создало Министерство национальной безопасности (МНБ). Его первым руководителем стал ветеран советского КГБ генерал Косташ. По инициативе Косташа возник молдавский спецназ — отряд ОПОН и специальный легион «Тирас-Тигина» при частях молдавских карабинеров (внутренних войск).
Тогда же по весне молдавские спецслужбы были брошены на подавление выступлений русскоязычного населения Приднестровья на востоке страны и тюркоязычного меньшинства гагаузов в Буджакской степи на юге Молдовы. Первый усмирительный поход карабинерского спецназа «Тирас-Тигина» На гагаузов возглавил генерал Косташ, ставший символом гражданской войны в Молдове 1992 г. и непримиримым врагом сепаратистов в Буджаке и за Днестром. МНБ совершало диверсии в тылу гагаузов и приднестровцев. В ходе такой операции в тылу гагаузов группой МНБ похищен из дома и доставлен в Кишенев премьер-министр самопровозглашенного гагаузского государства Топал. После возникшего скандала гагаузского лидера пришлось отпустить. Захвачен отрядом ОПОН лидер гагаузской партии «Аркалык» Бургуджи. После нападений гагаузов на полицейские участки в мае 1992 г. сотрудники ОПОН при усмирении беспорядков в селах Чадыр-Лунге и Вулканешти застрелили более десяти гагаузов. Такие же действия совершали и в Приднестровье; при попытке похищения сотрудниками МНБ был избит приднестровский лидер Пологов. Во время ожесточенных боев на Днестре весной и летом 1992 г. особенную жестокость к приднестровцам проявили спецназовцы из «Тирас-Тигина» и полицейского антитеррористического отряда ОПОН. В ходе их рейдов на Дубоссары, Кучиеры, Бендеры карабинеры и сотрудники ОПОН убивали захваченных в плен приднестровцев и воевавших на их стороне добровольцев из России. Нападения спецназа на Бендеры и Дубоссары также возглавляли Косташ и другие руководители МНБ, начальник МНБ по Бендерскому району Анточ был ранен в бою с приднестровскими гвардейцами.
В тылу приднестровцев молдавские спецслужбы создали тайные террористические группы из местных молдаван. Отряды террористов «Бужор», «Бурундуки», «Скорпион» нелегально действовали в 1992–1993 гг. в Приднестровье. Особенно активной была группировка «Бужор», возглавляемая агентами МНБ Илашку и Урыту, прошедшими спецподготовку в разведке румынской армии. После серии громких убийств в Приднестровье, включая похищение и ликвидацию командира приднестровской гвардии Гусара, часть членов этой организации арестована приднестровцами. В их числе был осужден в Тирасполе и Илашку, Урыту успел уйти через Днестр в Молдову.
В 1993 г. после спада националистических настроений в Молдове и отказа от курса на воссоединение с Румынией режим Снегура занял более либеральную позицию к русским в республике и к Приднестровью. Из МНБ и спецназа были уволены многие националисты и наиболее скомпрометировавшие себя сотрудники. Вслед за уходом с поста премьер-министра националиста Мошану в отставку подали и другие «ястребы», включая главу МНБ Пулгару, главу МВД Косташа, командира карабинерского спецназа Кертаке и начальника отряда ОПОН Басараба. Они протестовали против переговоров с приднестровцами и участия Молдовы в СНГ. Во главе МНБ был поставлен более умеренный министр Ботнарь. А вскоре и самого Снегура сменил умеренный социалист Лучинский, а затем и сторонник союза с Россией коммунист Воронин. С Приднестровьем начались переговоры о конфедерации. Для МНБ времена тайных акций, создания диверсионных групп и карабинерских карательных походов отошли в прошлое.
Главным отличием спецслужб Молдовы является их направленность на пресечение сепаратизма и тесная связь со спецслужбами Румынии.
До включения в 1940 г. в состав СССР, а затем и в период германской оккупации роль спецслужбы в Литве исполняла Полиция безопасности. При немцах она помогала СД и гестапо в охоте на коммунистов и подпольщиков. Возглавлявший Полицию безопасности в годы войны Лелейкис ушёл с немцами. Уже в конце XX века власти США выдали его в Литву, в 1999 г. ему предъявили обвинение в массовых казнях литовских евреев.
После событий 1991 г. Литва, получив независимость, в СНГ не вошла, взяв курс на сближение с Евросоюзом и НАТО. С 1991 г. президент Ландсбергис учредил три спецслужбы: ДГБ (Департамент государственной безопасности, в Литве по традиции его называют просто ГБ) отвечает за внешнюю разведку и контрразведку, ДОК (Департамент охраны края) является органом госбезопасности, тайной полиции, госохраиы и охраны границ, ДРК (Департамент разведки и контрразведки) при Генштабе — служба военной разведки и контрразведки.
