Особенно тяжело пришлось сухопутной группе. Двигаясь в конце мая в самый разгар снеготаяния и высокого уровня воды в горных реках и речках, группа потеряла свыше десяти лошадей, и, вконец измученная, спустившись в Чулышманскую долину, подошла к озеру, где встретилась с группой, приплывшей водой, у которой так же имелись потери.
Обследовав большой район, экспедиция в середине лета благополучно закончила работу и вернулась в Барнаул, причем одна часть возвращалась правым берегом Бии, другая с П. Шелегиным спустилась по порожистой реке на лодках.
В лаборатории Барнаула были изучены образцы железных руд, доставленных с Чулышмана, которые оказались бедными, поэтому остались без внимания.
Большую ценность представляли сведения по географии района Телецкого озера, реки Чулышман и Башкауса. Много интересного привезла экспедиция по этнографии, в том числе описание мест, пригодных для жительства и ведения сельского хозяйства, по долинам рек, а также характеристик лесов.
В составе экспедиции был картограф и чертежник Колывано-воскресенских заводов Пимен Старцев. Ему принадлежит составление интересной географической карты, которая дает более точное представление об этом районе.
В то же время командование военной линией направляет экспедицию в верховья реки Бии с целью изучения мест для продолжения строительства острогов от Бикатунска до Кузнецка. Возглавлял экспедицию инженер Плаутин. Он первый полностью заснял весь бассейн реки Лебедь, самого крупного правого притока реки Бии.
Каждая экспедиция приносила новые сведения, что позволяло уточнять ранее составленные чертежи, карты и создавать новые более точные.
Однако почти всем экспедициям приходилось иметь дело с вооруженными отрядами джунгар, которые всячески препятствовали в продвижении и изучении местности.
В 1742 году к Телецкому озеру был послан поручик геодезии Шишков с целью составить географическое описание, но был остановлен еще в предгорьях зайсаном. Поручику в категорической форме было предложено вернуться, в противном случае против него будет применена сила.
До 1755 года здесь на юге Алтая соседом России было государство Джунгария. Государство огромное, сильное, с мощью которого русское правительство вынуждено было считаться.
Распространяя свою власть, люди Джунгарии с целью сбора ясака заходили далеко в Сибирь, не встречая особого сопротивления. Конные отряды свободно передвигались, подымая столбы пыли, по предгорной и равнинной части Алтая.
Сравнительно небольшие гарнизоны крепостей, летучие отряды не могли противостоять этим хорошо вооруженным, разбиравшимся в местности и прекрасно организованным воинам.
Учитывая это, русское правительство не принимало действенных мер, опасаясь серьезных столкновений.
Однако междоусобицы, раздиравшие эту страну, постепенно расшатывали ее устои и ослабляли ее мощь.
Это послужило причиной падения ханства в результате тяжелой войны с Китаем.
В 1756 году алтайские племена обратились к пограничному начальству с просьбой защитить, принять в подданство и пропустить их в глубь империи.
Просьба была удовлетворена, и в Бийской крепости был подписан один из актов о добровольном вхождении алтайцев в состав России. После свершения этого выдающегося события южная граница Российской империи определилась примерно там, где она ныне и проходит.
Опасаясь осложнений на границе с Китаем, в результате принятия в подданство алтайских племен и охраны Колывано-воскресенских заводов, генерал-губернатор Сибири, тайный советник Саймонов поставил перед сенатом вопрос о строительстве военной линии от Усть-Каменогорской крепости до Телецкого озера.
Сенат дал согласие, и в 1760 году в горный Алтай были посланы две военные экспедиции. Одну их этих экспедиций возглавляли майор Эйден и инженер-капитан Плутов. Эта экспедиция осталась бы без внимания, и о ней можно было бы и не говорить, так как она не выполнила поставленной задачи по причине плохого знания местности и отсутствия хороших проводников. Однако, находясь на Телецком озере, Эйдену удалось впервые провести промеры озера и определить его глубину в 288 метров, что само по себе является открытием, и именно его работа положила начало изучению гидрологического режима озера.
Присоединение Горного Алтая к России позволило относительно спокойно заниматься исследованием этого удивительного края.
Различные экспедиции в те годы занимались исследованием района Телецкого озера в первую очередь с целью поисков полезных ископаемых и подбора мест для постройки заводов.
В 1771 году Алтай посетила первая русская академическая экспедиция, которую возглавлял известный натуралист, академик П.С. Лаплас.
Необходимо отметить, что основная масса экспедиций не обошлась без помощи коренных жителей, которые всегда оказывали помощь, служа в экспедициях в первую очередь проводниками.
Благодаря им большинство экспедиций благополучно совершили путешествие, собрали ценнейший материал и в полном составе возвратились в свои исходные пункты. Будучи по характеру добрыми, отзывчивыми и сообразительными, алтайцы легко сходились с русскими и становились друзьями.
Ничего не утаивая и не скрывая, они без всякой выгоды для себя знакомили с местностью, показывая интересные места, и помогали в поисках полезных ископаемых.
С приходом первых академических экспедиций, в составе которых были натуралисты, алтайцы своими знаниями растений, животных, являясь великолепными следопытами и охотниками, оказывали неоценимую помощь в сборе коллекций и описании растительного и животного мира.
В 1826 году Телецкое озеро посетил первый ученый-естествоиспытатель. Это был молодой барнаульский врач А. А. Бунге.
Александр Андреевич Бунге (1803-1890) входил в состав экспедиции, которая работала на Алтае под руководством профессора Дерптского университета К.Ф. Ледебура. А.А. Бунге прошел самостоятельным маршрутом по довольно сложным малоизвестным местам и вышел к южной части Телецкого озера. Это была ботаническая экспедиция. А.А. Бунге собрал богатый гербарий в южной части озера и в долине реки Чулышмана. Делая описания берегов озера, А.А. Бунге был поражен обилием рыбы в озере, а главное, тем, что местные жители совершенно не умеют и не ловят ее.
Наблюдая с высоких берегов, А.А. Бунге отмечал, что огромные косяки рыб один за одним медленно плывут вдоль берега. Плотность косяков такая, что дна не видно, где проплывает очередной косяк.
В 1834 году в районе Телецкого озера путешествовал и изучал его берега крупный русский ученый, впоследствии академик Г.П. Гельмерсен.
Григорий Петрович Гельмерсен (1803 — 1885) окончил Дерптский университет, после чего был направлен на Урал.