В числе первых научных сотрудников, занимающихся исследованием флоры и фауны заповедника, были М.В. Золотовский, М.С. Хомутова, А.Н. Гончарова.
Орнитологи С.С. Туров, С.С. Фолитарек, Г.П. Дементьев провели большую работу по изучению орнитофауны бассейна озера. Ими была собрана большая коллекция птиц.
Вопросами геоморфологии занимались М.С. Калецкая, Е.М. Щербакова. Зоолог В.В. Дмитриев выполнил большую работу по изучению копытных животных заповедника.
Исследованием млекопитающих занимались П.Б. Юргенсон, Ф.Д. Шапошников, Г.Д. Дулькейт.
Свыше десяти лет возглавлял научный отдел заповедника Г.Д. Дулькейт, который изо дня в день вел подробную летопись природы заповедника. В 1949 году им был впервые описан неизвестный науке небольшой сижок, являющийся самым маленьким представителем сиговых рыб, обитающих в России. Сижок был назван «Сиг Правдина», в честь академика Правдина.
Несколько позднее сотрудники заповедника В.В. Криницкий, Л.П. Брысова, И.А. Короткое занимались изучением кедровых лесов. Геоботаник А.В. Куминова в течение нескольких лет проводила исследования флоры горного Алтая.
Многие годы кафедра ихтиологии и гидробиологии Томского университета проводила на Телецком озере и его притоках большую работу по изучению рыб. Возглавляли исследования Б.Г. Иоганзен, А.Н. Гундризер, С.Д. Титова и другие.
В течение нескольких лет работниками заповедника Ю.И. Запекина-Дулькейт и Г.Д. Дулькейт была подробно изучена донная фауна (зообентос) Камгинского залива и ее роль в питании рыб.
Заповедник сыграл огромную роль в восстановлении численности многих видов животных. Особо следует сказать о соболе, которого к 1930 году практически не стало. Благодаря охране животные размножились и уже десятки лет занимают всю таежную часть бассейна озера, являясь основным объектом промысловой охоты.
Но случилось непредвиденное. В 1951 году постановлением совета Министров Алтайский заповедник был ликвидирован. Это был страшный удар, нанесенный природе. Этим постановлением было ликвидировано в СССР сто заповедников из 128. Как могло такое случиться? Так необдуманно, не заглядывая вперед, могли поступить, мягко говоря, малограмотные люди.
В 1958 году по настоянию ученого мира заповедник восстановили, но его площадь была сокращена. Верховья Б. Абакана остались за пределами заповедника.
А в 1961 году, как гром среди ясного неба, после заявления Н.С. Хрущева, когда он сказал, - «заповедники, по-моему, это надуманное дело», заповедник, решением Алтайского Крайисполкома моментально ликвидировали, и опять получилось - «что хочу, то и ворочу». И вновь ученый мир встал на дыбы и добился, наконец, разумного решения. Заповедник в 1968 году восстановили. Но теперь, будем надеяться, навсегда.
Ликвидацией заповедника не замедлили воспользоваться лесопромышленники и в эти промежутки вседозволенности вырубили кедровники на бывшей его территории по реке Ойор на огромной площади, где было одно из крупных стойбищ копытных в зимнее время.
С целью подробного изучения Телецкого озера в 1965 году была организована Телецкая озерная станция с центром в поселке .Яйлю,
В программу исследования были поставлены задачи изучения гидрометеорологического режима, ледовой и ветро-волновой обстановки и другие задачи, касающиеся исследования озера.
Много лет коллектив гидрологов возглавлял талантливый ученый Валентин Васильевич Селегей. Этому молодому исследователю принадлежит интересное открытие. В 1969 году на стыке меридиальной и широтной частей озера им был обнаружен подводный хребет, вершина которого поднимается над дном озера на 211 метров.
В.В. Селегей предложил назвать хребет именем С.Г. Лепневой, и в 1971 году комиссия топонимики и транскрипции географических названий географического общества СССР утвердила это название - «Хребет Лепневой».
Таким образом, на карте мира появился горный хребет, который никто никогда не видел.
На основе многолетних наблюдений и исследований этого уникального водоема супруги В.В. Селегей и Т.С. Селегей в 1978 году издали монографию «Телецкое озеро». Это первое обобщение исследовательских работ прошлого и результаты работ Телецкой озерной станции, которая долгое время работала под руководством и при непосредственном участии начальника станции В.В. Селегея.
Можно с уверенностью сказать, что на сегодня В.В. Селегей является самым крупным знатоком и исследователем этого уникального водоема.
Изучение Телецкого озера, преподносящего сюрпризы науке, продолжается.
Но не только ученые интересуются Телецким озером. Сюда устремляются художники, поэты, писатели и просто любители природы. Всем хочется побывать на озере, посидеть на его берегу с чистой, как хрусталь, водой в окружении первобытной природы.
Талантливый художник Алтая Г.И. Гуркин, ученик знаменитого художника И.И. Шишкина, неоднократно бывал на Телецком озере. Он в своих произведениях воспел красоту и мощь седого Алтая. Его великолепные полотна «Хан Алтай», «Корона Катуни», «Озеро горных духов», «Катунь весной» и многие другие отличаются самобытностью письма и вызывают восхищение. Другой талантливый алтайский художник Н.И. Чевалков создает полотна, среди которых особенно выделяются «Телецкое озеро», «Алтайцы на Телецком озере». Оба художника бесконечно любили этот прекрасный уголок земли.
Побывали на Телецком озере известные советские писатели В.Я. Шишков и В.В. Бианки.
В 1894 году в город Томск приехал молодой техник В.Я. Шишков, а незадолго до этого здесь был организован «Томский округ путей сообщений по рекам Западной Сибири».
Работая в округе, В.Я. Шишков надолго связал свою судьбу с Сибирью и Алтаем. Он принимает участие в изыскательских работах по рекам Оби, Иртышу, Енисею, Лене, Нижней Тунгуске.
В 1910 году он возглавляет партию по изучению реки Бии от истока до устья на предмет судоходства. Им обследованы низовья реки Чулышмана, Телецкое озеро, и при сплаве по реке Бии от Телецкого озера до города Бийска была составлена лоция этой реки.
Сплавляясь по реке Бии на плотах, экспедиция устроила небольшой отдых около деревни Куют, откуда В.Я. Шишков и его товарищи совершили двухдневную экскурсию в тайгу к местному садоводу П.Я. Глаголеву. Это был один из первых новаторов садоводства в этом районе. Яблочки, по всеобщему признанию, были превосходные, да и сам сад вызывал удивление.
Много пришлось путешествовать В.Я. Шишкову по Горному Алтаю, возглавляя довольно большую партию по изысканию трассы Чуйского тракта.
Его чудесные рассказы об Алтае и заметки появились после этих путешествий. В.Я. Шишков впоследствии писал:«.. .Алтай очень хорош, я давно люблю его, но где мне взять звучных струн, где взять мощь и красоту слова».
