Заслуги командующего гвардейской армией были высоко оценены Ставкой Верховного главнокомандования – в феврале 1943 года генерала Малиновского назначили командующим Южным, а с марта того же года – Юго-Западным (переименованным в октябре 1943 года в 3-й Украинский) фронтами. Войска Малиновского оказались в центре боев за освобождение Донбасса, Левобережной и Правобережной Украины, противостоя немецкой группе армий «А».
Одной из самых крупных операций, подготовленной и проведенной полководцем Р.Я. Малиновским в годы Великой Отечественной войны, стала Запорожская. Войска фронта внезапным ночным штурмом овладели городом Запорожьем – важным узлом обороны гитлеровцев. Эта победа во многом решила судьбу мелитопольской группировки немецко-фашистских войск и способствовала изоляции частей неприятеля на Крымском полуострове, которые были отрезаны от своих главных сил.
Затем развернулись бои за дальнейшее освобождение Правобережной Украины, где 3-му Украинскому фронту пришлось действовать в тесном взаимодействии с войсками 2-го Украинского фронта. Своими наступательными усилиями эти фронты расширили плацдарм в районе днепровской излучины. После этого войска Малиновского совместно с частями 4-го Украинского фронта успешно провели Никопольско-Криворожскую операцию.
Весной 1944 года фронт Малиновского успешно провел наступление в Северном Причерноморье, Березнеговато-Снигиревскую и Одесскую операции. Советские войска форсировали реку Южный Буг и освободили крупные портовые города Николаев и Одессу, родину командующего фронтом.
Войска 3-го Украинского фронта особенно отличились при освобождении Одессы, при этом тесно взаимодействуя с Черноморским флотом. Овладев железнодорожной станцией Раздельная, командующий фронтом тем самым рассек оборонявшуюся в районе Одессы вражескую группировку на две части. Вечером 9 апреля советские войска ворвались в северные кварталы города и ночным штурмом к 10 часам утра следующего дня освободили Одессу.
В мае 1944 года Малиновского назначили командующим 2-м Украинским фронтом. Летом этого же года его войска совместно с 3-м Украинским фронтом скрытно от вражеского командования подготовили и успешно провели Ясско-Кишиневскую операцию. Ее целью были разгром вражеских войск группы армий «Южная Украина», освобождение Молдавии и вывод из войны Румынии, союзницы гитлеровской Германии. Эта операция признана одной из самых блестящих в ходе Великой Отечественной войны и в полководческой биографии Р.Я. Малиновского – за нее он получил в том же 1944 году звание Маршала Советского Союза.
Войска двух фронтов перешли в наступление 20 августа, в двухдневных кровопролитных боях взломав вражескую оборону. 22 августа советские армии замкнули кольцо окружения вокруг крупной группировки немецко-фашистских войск. После этого они продвинулись в направлении Плоешти, Бухареста и Констанцы. Ясско-Кишиневская операция была успешно завершена к 29 августа.
Всего за десять дней советские войска разгромили 22 немецкие и большинство румынских дивизий. В плен были взяты более 200 тысяч человек. При этом неприятель потерял 3,5 тысячи орудий и минометов, более 800 танков и штурмовых орудий, 300 самолетов. Потери советских войск составили 67 130 человек. За время Великой Отечественной войны это были минимальные потери советских войск в наступательной операции такого масштаба.
В ходе Ясско-Кишиневской операции советские войска добились не только больших военных, но и политических результатов. Были разгромлены основные силы немецко-фашистской группы армий «Южная Украина», освобождена Молдавия, армии фронта вышли на румыно-венгерскую и болгаро-югославскую границы. Румыния, воевавшая с начала Второй мировой войны на стороне фашистской Германии, вступила в антигитлеровскую коалицию. Таким образом, обстановка на южном крыле советско-германского фронта резко изменилась не в пользу гитлеровского командования.
После этого стратегического успеха войска 2-го Украинского фронта в начале января 1945 года завязали бои на территории хортистской Венгрии – сателлита гитлеровской Германии в годы Второй мировой войны. В ходе Дебреценской операции было нанесено серьезное поражение немецко-фашистской группе армий «Юг». В итоге неприятельские войска оставили обширные горные области Трансильвании и ушли на запад, поближе к государственной границе собственно Германии.
После этого армии Малиновского заняли более выгодное положение на театре военных действий и оказали большую помощь 4-му Украинскому фронту в преодолении Карпатских гор и освобождении Закарпатской Украины. Начались бои на Венгерской равнине и берегах Дуная, близ озера Балатон.
Войска 2-го и 3-го Украинских фронтов в октябре 1944 – феврале 1945 годов успешно провели Будапештскую операцию. Войска 2-го Украинского фронта вели бои на подступах к Будапешту, а войска Малиновского – непосредственно за сам город.
При овладении венгерской столицей маршал Малиновский проявил себя как выдающийся полководец. 17 января советские войска расчленили вражескую оборону в Пеште на три части. На следующий день почти 100-тысячная группировка оборонявшихся перестала существовать. В плен сдались около 63 тысяч солдат и офицеров. Однако на противоположном берегу Дуная – в западной части венгерской столицы, Буде – сражение продолжалось до 13 февраля. Многие отличившиеся полки и дивизии получили почетное наименование Будапештских. В боях за город приняли участие и венгерские добровольцы-антифашисты.
Наступил заключительный этап Великой Отечественной войны. Фронт маршала Малиновского окончательно разгромил неприятельские силы на венгерской территории и в восточной части Австрии. Вновь два фронта – 2-й и 3-й Украинские – успешно провели Венскую операцию. Немецким частям не помогли оборонительные рубежи, созданные на восточных границах Австрии, в предгорьях Австрийских Альп.
5 апреля советские дивизии вышли на ближние подступы к Вене и завязали ожесточенные бои. В целях сохранения города от разрушения и спасения его жителей советские войска не стали штурмовать Вену, а обошли ее с юга, севера и запада. 13 апреля австрийская столица была освобождена, советские войска очистили от немецко-фашистских войск значительную часть соседней Чехословакии.
Успешно проведенная Венская операция ускорила капитуляцию германских войск в Северной Италии.
Однако на этом Вторая мировая война для Маршала Советского Союза Р.Я. Малиновского не закончилась. Вскоре полководец оказался на Дальнем Востоке. На Ялтинской конференции руководитель Советского государства И.В. Сталин заявил союзникам, что СССР объявит войну милитаристской Японии ровно через три месяца после ее окончания в Европе, то есть 8 августа.
Для разгрома Квантунской армии Японии была задумана быстротечная стратегическая наступательная операция. Для участия в ней из европейской части страны были переброшены значительные силы. К руководству операцией Ставка Верховного главнокомандования привлекла большое число опытных военачальников. Среди них был и Маршал Советского Союза Р.Я. Малиновский.
В ходе советско-японской войны 1945 года он вновь проявил себя как талантливый полководец, командуя войсками Забайкальского фронта. Именно они нанесли главный удар в стратегической наступательной Маньчжурской операции, которая завершилась полным разгромом и капитуляцией почти миллионной японской Квантунской армии.
Боевые действия Забайкальского фронта отличались исключительно высокими для того времени темпами наступления по нескольким направлениям одновременно. Советские войска успешно перешли Хинган, с ходу форсировали немало рек. Командующий фронтом умело выбрал направление главного удара, смело применил в первом эшелоне наступления танковые армии.
2 сентября на американском линейном корабле «Миссури» состоялась официальная церемония подписания акта о безоговорочной капитуляции Японии. На этом Вторая мировая война завершилась.
За победу в советско-японской войне 1945 года маршал Малиновский был удостоен звания Героя Советского Союза и награжден высшим советским военным орденом Победы.
После победного окончания войны с Японией Малиновский командовал войсками Забайкальско-Амурского военного округа. С 1947 года – войсками Дальнего Востока. С 1953 года – войсками Дальневосточного военного округа. С 1956 года он был первым заместителем министра обороны СССР и главнокомандующим Сухопутными войсками. С 1957 года и до конца жизни – министром обороны СССР, сменив на этом посту маршала Г.К. Жукова. Родион Яковлевич Малиновский – дважды Герой Советского Союза, Народный герой Югославии. Шесть раз избирался депутатом Верховного Совета СССР. Автор мемуаров «Солдаты России». Имя советского полководца было присвоено Военной академии бронетанковых войск и гвардейской танковой дивизии. Похоронен на Красной площади, у Кремлевской стены.
