В 1956 году центральный аппарат КГБ имел такую структуру:
Первое Главное управление (разведка), Второе Главное управление (контрразведка), Третье Главное управление (военная контрразведка), Четвертое управление (антисоветское подполье, националистические формирования и враждебные элементы),
Пятое управление (контрразведка на особо важных государственных объектах),
Шестое управление (контрразведка на транспорте), Седьмое управление (наружное наблюдение), Восьмое Главное управление (криптография), Девятое управление (охрана руководителей партии и правительства),
Десятое управление (Управление коменданта Московского Кремля),
Управление кадров, Следственное управление,
Первый спецотдел (контрразведка в атомной промышленности),
Второй спецотдел (применение оперативной техники), Третий спецотдел (документов), Четвертый спецотдел (радиоконтрразведка), Пятый спецотдел (изготовление оперативной техники), Отдел «С» (правительственная связь), Учетно-архивный отдел (УАО), Тюремный отдел, Хозяйственное управление, Финансово-плановый отдел, Бухгалтерия,
Мобилизационный отдел,
Управление учебных заведений,
Секретариат,
Инспекция.
В подчинение у трех управлений находились региональные подразделения. Схематично это выглядело так:
Второе Главное управление КГБ СССР — КГБ при СМ союзных и автономных республик — У КГБ краев и областей — аппараты уполномоченных УКГБ городов и районов.
Третье главное управление — Управление особых отделов родов войск и Особые отделы округов и флотов — Особые отделы армий и флотов — Особые отделы и отделения дивизий и бригад.
Шестое управление — Отделы КГБ на ж.д. и водных бассейнах — Аппараты уполномоченных КГБ на ж.д. станциях и в портах.
Как уже было сказано выше, за первые два года руководства КГБ Иван Серов уволил из органов 18 тысяч человек. Было дано указание о повышение общего и специального образования всех кадровых сотрудников КГБ. Это требование означало новые веянья, оно ставило в затруднительное положение многих сотрудников и нередко признавалось ими никчемным. Тем не менее началось лавинообразное поступление работников на вечерние и заочные факультеты различных вузов (в основном — на исторические факультеты пединститутов).
На партийных и комсомольских собраниях с одобрением отмечали тех, кто учился в институтах, и безжалостно ругали других — тех, кому эти занятия представлялись обременительными. Хотя важно было не это, а утверждение на заседание Президиума ЦК КПСС 9 января 1959 года и введение в тот же день постановлением Совета Министров СССР «Положения о КГБ при СМ при СССР», так как этот документ до 16 мая 1991 года (в тот день был принят «Закон СССР об органах государственной безопасности») регламентировал различные сферы деятельности КГБ.
В нем была указана приоритетная роль КПСС (1-я и 3-я статьи Положения):
«Комитет государственной безопасности при Совете Министров СССР и его органы на местах являются политическими органами, осуществляющими мероприятия Центрального Комитета партии и Правительства по защите социалистического государства от посягательств со стороны внешних и внутренних врагов, а также по охране государственных границ СССР. Они призваны бдительно следить за тайными происками врагов советской страны, разоблачать их замыслы, пресекать преступную деятельность империалистических разведок против Советского государства. (…) Комитет государственной безопасности работает под непосредственным руководством и контролем Центрального Комитета КПСС».[8]
А еще были четко сформулированы задачи и обязанности центрального аппарата и его местных органов:
«…а) разведывательная работа в капиталистических странах;
б) борьба со шпионской, диверсионной, террористической и иной подрывной деятельностью иностранных разведывательных органов, зарубежных антисоветских центров и с их агентурой внутри страны;
в) борьба с вражеской деятельностью антисоветских и националистических элементов внутри СССР;
г) контрразведывательная работа в Советской Армии, Военно-Морском Флоте, ГВФ (Гражданский воздушный флот — Авт.), пограничных войсках и войсках МВД с целью предупреждения проникновения в их ряды агентуры иностранной разведок и иных вражеских элементов;
д) контрразведывательная работа на специальных объектах, особо важных объектах и на транспорте;
е) охрана государственной границы Союза ССР;
ж) охрана руководителей Партии и Правительства;
з) организация и обеспечение Правительственной связи;
и) организация радиоконтрразведывательной работы и учет необходимых данных действующих на территории страны ведомственных радиостанций;
к) разработка мобилизационных планов по развертыванию органов госбезопасности и войсковых частей Комитета и выполнение других поручений ЦК КПСС и Правительства Союза ССР» К
В этом документе были определены права органов государственной безопасности:
«… а) вести агентурно-оперативную работу в целях выявления и пресечения враждебной деятельности, направленной против Советского Союза, для чего иметь необходимую агентуру, создавать конспиративные и явочные квартиры для работы с агентурой;
б) производить и устанавливать в законном порядке обыски, задержания и аресты лиц, изобличенных или подозреваемых в преступной деятельности;
в) вести следствие по делам о государственных преступлениях с последующей передачей дел по подсудности;
г) проводить специальные мероприятия, направленные на пресечение и выявление преступной деятельности агентуры иностранных разведок и антисоветских элементов;
д) в случаях необходимости по согласованию с начальниками милиции привлекать работников милиции для обеспечения выполнения заданий органов государственной безопасности;
е) вести оперативный учет государственных преступников и лиц, разрабатываемых по подозрению в принадлежности к агентуре иностранных разведок, участии в антисоветских организациях и иной враждебной деятельности;
ж) производить проверку состояния шифровальной службы и секретного делопроизводства в министерствах и ведомствах, а также подчиненных им предприятиях и учреждениях;
з) производить специальную проверку лиц, имеющих по службе отношение к государственной и военной тайны, а также выезжающих за границу и въезжающих из-за границы в СССР;
и) вести под надзором органов прокуратуры следствие по делам о преступлениях, совершаемых офицерским, сержантским составом, служащими и рабочими органов КГБ, если совершенные преступления связаны с оперативной деятельностью органов госбезопасности, с последующей передачей дел по подсудности;
