советником губернатора Кировской области Никиты Белых на общественных началах, с которым он познакомился, ещё будучи в «Яблоке». 18 марта 2009 года предприниматель Пётр Офицеров зарегистрировал ООО «Вятская лесная компания» («ВЛК»), 15 апреля был заключён договор между «ВЛК» и кировским государственным предприятием «Кировлес». От имени «Кировлеса» договор был подписан его генеральным директором Вячеславом Опалевым. Согласно договору, «Кировлес» обязался поставлять лесопродукцию для «ВЛК». Общий объём поставленной «Кировлесом» лесопродукции контрагентам «ВЛК» составил 10 тыс. кубометров.
В июле 2009 года департамент госсобственности Кировской области, являющийся учредителем «Кировлеса», инициировал проверку деятельности предприятия. Для этого была нанята аудиторская компания «Вятка-Академаудит», которой было поручено провести анализ работы «Кировлеса» за 2008 год и первое полугодие 2009 года. Согласно аудиторскому отчёту, договор между «Кировлесом» и ВЛК был заранее убыточным для «Кировлеса». В итоге департамент госсобственности принял решение о расторжении договора между «Кировлесом» и ВЛК.
В августе правоохранительные органы начали проверять возможные факты хищения в «Кировлесе». 3 декабря 2010 года оно было передано из Главного управления МВД по Приволжскому федеральному округу в местное управление СКП. По версии следствия, будучи советником губернатора Кировской области, Навальный «путем обмана и злоупотребления доверием» принудил экс-директора КОГУП «Кировлес» (учредитель — департамент лесного хозяйства Кировской обл.) Вячеслава Опалева заключить невыгодный договор на поставку древесины, который якобы принес предприятию убыток в 1,3 млн руб.
Позиция государственного обвинения заключалась в том, что фигуранты дела совместными усилиями создали «Вятскую лесную компанию», сыгравшую роль «фирмы-прокладки» между государственным предприятием «Кировлес» и конечными получателями лесопродукции «Кировлеса». Позиция защиты сводилась к тому, что «ВЛК» была обычной фирмой, которая занималась легальной торговлей лесопродукцией. Закупка лесопродукции у «Кировлеса» со стороны «ВЛК» производилась по рыночным ценам. Соответственно Навальный и Офицеров не совершали тех преступлений, которые им инкриминируют, а следствие использовало неправомерное, расширительное толкование ст. 160 УК РФ («Присвоение или растрата»).
В январе 2011 года стало известно о завершении проверки по делу «Кировлеса». Согласно заявлению помощника руководителя СУ СК РФ по Кировской области, «Навальный сотрудничал со следствием, давал объективные показания». Состава преступления выявлено не было, а в возбуждении уголовного дела — отказано. Это постановление было отменено Центральным аппаратом СК РФ, материалы были переданы в СК по Приволжскому федеральному округу. Позже, 3 марта 2011 года, Следственный комитет по Приволжскому федеральному округу также отказал в возбуждении дела в связи с отсутствием в действиях Навального состава преступления.
Таким образом, Навальный был признан судом невиновным. До того, как Навальный стал одним из лидеров протестного движения.
Сначала началась информационная кампания в блогах и СМИ под лозунгом «Навальный украл весь Кировский лес». 29 мая 2012 года по распоряжению руководства СК России было отменено постановление о прекращении уголовного дела в отношении Алексея Навального. 31 июля Навальному были предъявлены обвинения по ч. 3 ст. 33, ч. 4 ст. 160 УК РФ (организация растраты чужого имущества в особо крупном размере). Таким образом, Следственный комитет РФ предъявил адвокату и борцу с коррупцией Алексею Навальному обвинение по делу о хищениях в «Кировлесе».
Алексей Навальный приобрел всеобщую известность как борец с коррупцией и обличитель «Единой России». После того, как в России начались многочисленные протестные митинги, лидерам протеста один за другим стали предъявлять уголовные обвинения. Это и «узники Ботолной», и обвинения Удальцова в «организации массовых беспорядков», и многие другие. Не избежал этой участи и Навальный.
Началось все с мелких претензий, как иски о защите чести и достоинства единороссами, которых не устраивало определение партии как «партии жуликов и воров». Кроме того, изображение двуглавого орла с двумя пилами в лапах на логотипе проекта «РосПил» стало причиной заявлений в правоохранительные органы о предполагаемом «надругательстве над гербом России». Были обыски в квартире Навального в Марьино, были обыски на Кобяковской фабрике по ло-зоплетению его родителей. Муж фигурантки «списка Магнитского» Владлен Степанов подал на Навального в суд иск о защите чести, достоинства и деловой репутации, компенсации морального вреда и потребовал компенсации в размере одного миллиона рублей (суд, кстати, Степанов выиграл).
Однако в 2012 года началась настоящая травля. Уже после возобновления «дела Кировлеса», 4 декабря Следственный комитет России разместил на своём сайте информацию о том, что в отношении Алексея Навального и его родного брата Олега Навального возбуждено уголовное дело по факту совершения преступлений, предусмотренных ч. 4 ст. 159, п.п. «а», «б» ч. 2 ст. 174.1 УК РФ (мошенничество, совершенное организованной группой в особо крупном размере и легализация денежных средств, приобретенных в результате совершения преступления, группой лиц по предварительному сговору и с использованием своего служебного положения). По версии следствия, Навальным была создана фирма ООО «Главное подписное агентство», с которой весной 2008 года неназванная торговая компания заключила договор на осуществление грузовых перевозок почты. Как утверждает следствие, договор был заключён при участии Олега Навального, работавшего в то время руководителем Департамента внутренних почтовых отправлений филиала ФГУП «Почта России» — Автоматизированные сортировочные центры, который убедил руководителей компании заключить договор по заведомо завышенной стоимости. При этом «Главное подписное агентство» не имело собственной материальной базы для осуществления перевозок, и фактически ими занималось другое предприятие, которым руководил знакомый Олега Навального.
Сам Навальный назвал выдвинутые обвинения «полным бредом», а возбуждённое дело — «виртуальным». В свою очередь мать Алексея Навального Людмила заявила, что считает действия Следственного комитета попыткой давления на семью и попыткой не дать возможности её сыну участвовать в акции оппозиции, которая была намечена на 15 декабря. 6 мая 2013 года Мосгорсуд отменил решение Басманного суда о признании законным возбуждения уголовного дела против оппозиционера Алексея Навального и его брата Олега, отправив на повторное рассмотрение жалобу о его законности.
Менее, чем через три недели после обвинения по делу фирмы «Главное подписное агентство», 24 декабря, Следственный комитет России разместил на своём сайте информацию о том, что в отдельное производство выделены материалы о хищении в 2007 году возглавляемой Навальным компанией «Аллект» денежных средств, принадлежащих политической партии «Союз правых сил», в связи с чем было возбуждено уголовное дело по признакам преступления, предусмотренного ч. 4 ст. 159 УК РФ (мошенничество). Утверждалось, что в апреле 2007 года между политической партией «Союз правых сил» и компанией «Аллект» был заключен договор на оказание рекламных услуг. В общей сложности от политической партии на расчетный счет компании «Аллект» по договору поступило около 100 млн рублей. В свою очередь компания «Аллект» перечисляла полученные денежные средства на счета фирм, большая часть из которых имела, по словам Следственного комитета, признаки так называемых фирм-однодневок.
Сам Навальный