желудочного сока), но и несколько таких, чьи эффекты удивительно малы (скажем, аспирин для профилактики сердечно-сосудистых заболеваний). Разумеется, даже лекарства, оказывающие скромный эффект, могут приносить огромную пользу в масштабах общества – позволяя экономить громадные деньги на медицинском обслуживании, когда такие лекарства прописывают миллионам людей, кому они нужны. Тем не менее авторы исследования считают, что “нам стоит адекватнее оценивать эффективность лекарств”. Про величину эффекта для трех препаратов, упомянутых мною в тексте, сказано, что ей соответствует
d-значение Коэна, равное 0,55. См. также Pereira T. V. et al.
Empirical Evaluation of Very Large Treatment Effects of Medical Interventions. JAMA. 308, no. 16 (2012): 1676–84.
См., например: Gignac G. E., Szodorai E. T. Effect Size Guidelines for Individual Differences Researchers. Personality and Individual Differences. 102 (2016): 74–8.
Благо, со времен Сирила Бёрта проведено было множество надежных близнецовых исследований. См. обзор: Polderman T. J. C. et al. Meta-Analysis of the Heritability of Human Traits Based on Fifty Years of Twin Studies. Nature Genetics. 47, no. 7 (2015): 702–9.
О связи генов-кандидатов с когнитивными способностями см. обзор: Payton A. The Impact of Genetic Research on Our Understanding of Normal Cognitive Ageing: 1995 to 2009. Neuropsychology Review. 19, no. 4 (2009): 451–77.
De Quervain D. J.-F. et al. A Functional Genetic Variation of the 5-HT2a Receptor Affects Human Memory. Nature Neuroscience. 6, no. 11 (2003): 1141–2.
Munafo M. R. et al. Serotonin Transporter (5-HTTLPR) Genotype and Amygdala Activation: A Meta-Analysis. Biological Psychiatry. 63, no. 9 (2008): 852–7.
Сегодня фунтов за сто вы можете отослать пробу слюны напрямую компании, занимающейся генотипированием, и через несколько недель узнать, какие генетические варианты есть в вашем геноме.
Возможно, вы задаетесь вопросом, не страдает ли полногеномный поиск ассоциаций, раз проверяется потенциальная связь какого-то признака со многими тысячами генетических вариантов, от проблемы множественных сравнений, которую мы обсуждали в предыдущей главе, – когда вместе с количеством вычисляемых p-значений возрастает риск ложноположительного результата. Исследователи, пользующиеся этим методом, хорошо осведомлены об опасности – и соответствующим образом резко понизили критерий для p-значений. Отказавшись от порога в 0,05, они считают значимыми только те p-значения, которые оказываются меньше 5 × 10– 8 (или 0,00000005).
Duncan L. E. et al. How Genome-Wide Association Studies (GWAS) Made Traditional Candidate Gene Studies Obsolete. Neuropsychopharmacology. 44, no. 9 (2019): 1518–23.
Слово “редкие” здесь ключевое. Так, ученым известно о многих редких мутациях, связанных с пониженной обучаемостью и некоторыми формами расстройств аутистического спектра. Например, см. Niemi M. E. K. et al. Common Genetic Variants Contribute to Risk of Rare Severe Neurodevelopmental Disorders. Nature. 562, no. 7726 (2018): 268–71. Насколько мне известно, единственный наиболее распространенный “ген-кандидат”, выстоявший под натиском полногеномного поиска ассоциаций, – это вариация в гене APOE, которая, похоже, действительно надежно связана с риском развития болезни Альцгеймера. См. Marioni R. E. et al. GWAS on Family History of Alzheimer’s Disease. Translational Psychiatry. 8, no. 1 (2018): 99.
Коэффициент интеллекта: Chabris C. F. et al. Most Reported Genetic Associations with General Intelligence Are Probably False Positives. Psychological Science. 23, no. 11 (2012): 1314–23. Депрессия: Border R. et al. No Support for Historical Candidate Gene or Candidate Gene-by-Interaction Hypotheses for Major Depression Across Multiple Large Samples. American Journal of Psychiatry. 176, no. 5 (2019): 376–87. Шизофрения: Farrell M. S. et al. Evaluating Historical Candidate Genes for Schizophrenia. Molecular Psychiatry. 20, no. 5 (2015): 555–62.
Alexander S. 5-HTTLPR: A Pointed Review. Slate Star Codex. 7 May 2019.
Например, низкая статистическая мощность упоминается в аннотации этой статьи: Clarke H. et al. Association of the 5-HTTLPR Genotype and Unipolar Depression: A Meta-Analysis. Psychological Medicine. 40, no. 11 (2010): 1767–78. Кстати, готов поспорить, что в статьях о генах-кандидатах просто царило публикационное смещение. О некоторых свидетельствах в пользу моей гипотезы применительно к исследованиям взаимодействия генов-кандидатов с окружающей средой см. Duncan L. E., Keller M. C. A Critical Review of the First 10 Years of Candidate Gene-by-Environment Interaction Research in Psychiatry. American Journal of Psychiatry. 168, no. 10 (2011): 1041–9.
Fisher R. A. XV. – The Correlation between Relatives on the Supposition of Mendelian Inheritance. Transactions of the Royal Society of Edinburgh. 52, no. 2 (1919): 399–433. См. историческую дискуссию: Visscher P. M. et al. 10 Years of GWAS Discovery: Biology, Function, and Translation. American Journal of Human Genetics. 101, no. 1 (2017): 5–22.
Что не означает, будто генетики близки к полному пониманию генетических основ сложных признаков. Они просто отбросили ущербный старый метод и заменили его на методы получше. Впереди еще громадный объем работы по выяснению того, какие гены вовлечены, как находить их среди различных групп людей, как наш анализ может расстроиться из-за трудностей, связанных с социальными или демографическими различиями, как именно гены оказывают свое влияние, что нам делать с нашими знаниями о генетике в контексте помощи людям, страдающим от заболеваний, и так далее. См. полезный обзор: Tam V. et al. Benefits and Limitations of Genome-Wide Association Studies. Nature Reviews Genetics. 20, no. 8 (2019): 467–84.
В исследованиях на животных существует интересный парадокс статистической мощности. Это может показаться нелогичным, но нам, вероятно, лучше использовать побольше животных в своих исследованиях, по крайней мере в краткосрочной перспективе. Увеличение размера выборки, а следовательно, и статистической мощности означает, что мы будем получать более надежные результаты – которые выдержат проверку временем и воспроизведением – и избежим длительных циклов неоднозначных, не дающих ничего нового экспериментов, а вероятно, и гибели большего числа животных в долгосрочной перспективе.
Например, см. Critchley C. R. Public Opinion and Trust in Scientists: The Role of the Research Context, and the Perceived Motivation of Stem Cell Researchers. Public Understanding of Science. 17, no. 3 (2008): 309–27.
Harrison R. The Springfield Files // The Simpsons. Moore S. D. (dir.) Season 8. Episode 10. 12 Jan. 1997.