Первым специальным заданием, выполненным лодками Азиатского флота, было снабжение боеприпасами и продовольствием защитников Коррехидора и эвакуация личного состава. Спасательные действия подводных лодок продолжались и тогда, когда японцы прорывались через Малайский барьер и готовились к дальнейшему продвижению к Австралии. Другим заданием была высадка разведчиков на территорию противника и доставка их обратно на базы. На островах юго-западной части Тихого океана население было или на стороне американцев, или в худшем случае относилось к ним безразлично. Следовательно, там было легко вести разведку.
Очень важными являлись сведения о кораблях противника, которые добывались наблюдателями на берегу. Многие агенты разведывательной службы союзников и голландской полевой разведки доставлялись к месту разведки и обратно на американских подводных лодках. Кроме того, лодки обстреливали береговые укрепления и спасали команды затонувших кораблей и потерпевших аварию самолетов.
Выполнение специальных заданий требовало большой выдержки особенно потому, что все это было еще ново.
Подводная лодка «Сивулф» первой участвовала в выполнении специального задания в юго-западной части Тихого океана. 16 января она погрузила на борт 37 т боеприпасов для зенитной артиллерии и ушла из Дарвина, взяв курс на остров Коррехидор. Если бы в нее попала глубинная бомба, она взорвалась бы, как гигантская граната.
Днем лодка шла в подводном положении, а ночью всплывала. Однажды ночью с лодки заметили соединение японских кораблей в составе трех или четырех крейсеров, флотилии эсминцев и семи транспортов. Обычно такая обстановка вызывала недовольство подводников специальными заданиями, так как приходилось упускать весьма заманчивые цели. Подводная лодка продолжала идти своим курсом. Когда же японские корабли скрылись за горизонтом, командир лодки приказал всплыть и передать подробное донесение о противнике командующему подводными силами.
Вскоре после этого подводной лодке «Сивулф» пришлось снова уйти под воду, так как на горизонте показался эскадренный миноносец. Корабль не обнаружил лодку, и она продолжала следовать в прежнем направлении.
Хотя японцы и блокировали Филиппинские острова, но лодке все же удалось прорваться к Коррехидору. В сопровождении торпедного катера, который помог ей пройти через минные поля, она пришла в порт.
Уходя обратно в свою базу, лодка взяла на борт 25 летчиков и 16 торпед. Еще раз лодке пришлось пройти через линию блокады, не обнаружив себя. Когда «Сивулф» ошвартовалась у причала в Сурабае, команда получила первую с 8 декабря передышку.
Второй подводной лодкой, посланной в Коррехидор с запасом боеприпасов, была «Траут», базировавшаяся на Пирл-Харбор. Из Коррехидора «Траут» должна была взять несколько тонн золота и серебра.
Для размещения боезапаса часть торпед из первого отсека разместили вне прочного корпуса в надстройке. Утром 12 января лодка вышла в море.
На острове Мидуэй лодка пополнила запасы горючего, а затем направилась на запад, держа курс севернее островов Уэйк и Маркус. Пройдя пролив Валинтанг, она 3 февраля прибыла в район Коррехидора. Лодка оставалась в подводном положении на подходах к Коррехидору до наступления ночи, с тем чтобы незаметно войти в гавань в сопровождении сторожевого катера.
Это было сделано ввиду угрозы с воздуха. Японские самолеты периодически появлялись над Коррехндором. Подводная лодка подошла к южному доку и, ошвартовавшись к стенке, начала разгрузку снарядов силами личного состава. К доку подходили грузовики и отвозили боезапас по назначению. Защитники Коррехидора получили, кроме того, продовольствие, сигареты и корреспонденцию. После выгрузки на берег снарядов торпеды из надстройки были перегружены в отсек. К 3 час. 4 февраля лодка была готова к выходу в море. Произведенный расчет показал, что для замещения груза следует принять 25 т балласта, необходимого для нормальной дифферентовки лодки.
В соответствии с этим в Коррехидоре перед выходом в море командир попросил дать на лодку балласт, в основном мешки с песком, чтобы иметь возможность в случае необходимости быстро перемещать их. Но оказалось, что мешки с песком достать нельзя. Тогда командир попросил мешки с цементом. Их тоже не оказалось. Все пошло на сооружение укреплений в Коррехидоре.
Когда началась война, на банковском складе в Маниле хранился большой запас золота. Чтобы оно не попало в руки японцев, его успели переправить на Коррехидор. И вот командиру лодки предложили взять 2 т золота в слитках, 18 т серебра в монетах и, кроме того, ценные бумаги. Надобность в балласте отпадала. Ночью 4 февраля ценный груз был перенесен на борт лодки. После этого лодка вышла в море и, пройдя через минные поля, взяла курс на юг.
В Восточно-Китайском море лодка дважды обнаруживала корабли противника. Командир лодки стремился к боевым действиям, несмотря на наличие такого ценного груза. По одному из обнаруженных японских транспортов произвели залп тремя торпедами. Были слышны два взрыва, и корабль пошел ко дну. После войны выяснилось, что это был транспорт «ТюваМару» (2718 т).
В эту же ночь подводная лодка «Траут» получила приказ возвращаться в Пирл-Харбор. На пути в базу она заметила японский сторожевой корабль в районе островов Бонин и атаковала его. Было выпущено три торпеды, одна из них попала в цель: корабль взорвался и затонул.
Остальную часть пути лодка прошла без всяких происшествий. В Пирл-Харборе ценный груз с лодки был выгружен и направлен на корабле в Соединенные Штаты.
Подводная лодка «Сидрэгон», действуя как транспорт, доставила в Сурабаю 19 человек — специалистов отряда радиоразведки, трех офицеров, 23 торпеды, 1400 кг радиооборудования и 2 т запасных частей для подводных лодок. Все это было доставлено в Сурабаю в срок.
В период с 5–22 февраля 1942 года подводная лодка «Сарго» доставила из Сурабаи защитникам острова Минданао миллион снарядов калибра 30 мм и эвакуировала 24 солдата. Для командира «Сарго» выполнение специальных заданий было особенно нежелательно, так как во время первого боевого похода лодке не удалось потопить ни одного судна противника: из 13 торпед, выпущенных во время восьми атак, ни одна не попала в цель.
Специальное задание лодка выполнила успешно, доставив боезапас по назначению и в срок. Успешно пройдя воды противника, лодка направилась в Голландскую Индиго.
В конце февраля лодка вышла из Голландской Индии в Фримантл (Западная Австралия). 4 марта в 13 час. 38 мин. наблюдатель заметил сухопутный самолет, до которого было приблизительно пять миль. Лодка сразу же начала погружаться. Это был австралийский самолет, преследовавший японскую подводную лодку, обнаруженную эскадренным миноносцем «Уипл».
Хотя командование американскими подводными лодками информировало командование австралийских воздушных сил об американской лодке, находящейся в этом районе, летчик этого не знал. Увидев подводную лодку, он ее атаковал.
В донесении командира лодки говорится:
«Около 13 час. 41 мин. послышался взрыв первой бомбы. Лодка успела погрузиться на глубину 15 м, когда вторая бомба взорвалась над боевой рубкой. Взрыв был очень сильный, в результате погас свет, вышла из строя часть приборов, имелись и другие повреждения».
В кормовой части боевой рубки появилась течь, вода проникала в центральный пост. Были разбиты призмы и стекла перископа. Лодка оказалась в очень тяжелом положении. Только искусное управление и дружные действия команды спасли ее от катастрофы. В ту же ночь лодка всплыла и на следующий день прибыла в порт. Команда заявила, что предпочла бы еще одно специальное задание, чем попасть под бомбы своего же самолета.
В этот период специальное задание выполняла подводная лодка «Свордфиш», прорываясь к Коррехидору, где 19 февраля приняла на борт президента Филиппин Эмануила Квезона и девять представителей правительства; 22 февраля она доставила их в Сан-Хосе (остров Панаи).
Затем «Свордфиш» снова вернулась к Коррехидору и 24 февраля эвакуировала нескольких американцев, в том числе американского верховного комиссара в Фримантле.
Подводная лодка «S-39», как и другие лодки, также участвовала в борьбе против японцев в районе Филиппинских островов и Голландской Индии. В первую неделю войны она атаковала большой грузовой транспорт противника, но безрезультатно. Во время второго боевого похода в январе «S-39» атаковала японскую подводную лодку и тоже безрезультатно.
В это время Сурабая подвергалась беспрерывным налетам противника; 15 февраля Сингапур пал. Только Батан и Коррехидор держались, когда японские клещи сжимались у острова Явы.
Тогда подводная лодка «S-39» и получила специальное задание. Нужно было эвакуировать английского контр-адмирала Спурера и большую группу беженцев из Сингапура, которые высадились на острове Чемба в Южно-Китайском море.
