Техническое управление ВМФ и органы тыла флотов принимали все меры для расширения производственных мощностей, усиления ремонтных предприятий. Во всех военно-морских базах и во многих соединениях флотов для текущего и мелкого ремонта кораблей и вспомогательных судов были созданы судоремонтные мастерские, расширена местная ремонтная база. Ко всем ремонтным работам привлекался личный состав кораблей и частей. В суровую блокадную зиму Ленинграда почти весь ремонт боевых кораблей и береговых батарей Краснознаменного Балтийского флота был выполнен их личным составом с использованием оборудования, инструмента, материалов и запасных частей ленинградских заводов.
Недостаток производственных мощностей судоремонтных предприятий вынуждал органы тыла флотов до минимума сокращать плановые ремонты, уделяя главное внимание ремонту аварийных боевых кораблей и ремонту в межоперационный период. В задачу этого ремонта входило максимальное поддержание боевых кораблей и вспомогательных судов в технически исправном состоянии. Во время ремонта аварийных боевых кораблей по возможности производился ремонт всех механизмов. В районах, где замерзали акватории, основной объем текущего ремонта планировался на зимний период. В навигационный период ограничивались только неотложным ремонтом.
В ходе продолжительных операций сил флота важное значение приобретал срочный ремонт кораблей на военно-морских базах. Например, при высадке десанта в порту Новороссийск в сентябре 1943 г. повреждения катеров, полученные ночью, устранялись в течение дня судоремонтной мастерской в Геленджике, и следующей ночью эти катера снова выходили на боевое задание. В ходе наступательных операций на приморском направлении ремонт кораблей и вооружения передовых соединений флота осуществлялся подвижными силами и средствами.
Героическими усилиями судоремонтников и личного состава флотов обеспечивалась высокая боевая способность кораблей ВМФ. Нередко даже сильно поврежденные корабли восстанавливались и вводились в строй в очень короткие сроки. Судоремонтники Кронштадта и Ленинграда вернули в строй даже ряд подорвавшихся на вражеских минах, затонувших и поднятых кораблей. В течение всей войны только на трех действующих флотах было отремонтировано 8815 боевых кораблей и вспомогательных судов, в том числе на Северном флоте — 2949, Краснознаменном Балтийском — 4357, Черноморском (до 1 сентября 1944 г.) — 1509533. Это был большой вклад судоремонтников ВМФ, Наркомата судостроительной промышленности и других наркоматов в обеспечение боевых действий сил флотов. В условиях ограниченных возможностей постройки новых боевых кораблей и вспомогательных судов ремонт их в годы войны являлся важнейшим средством сохранения корабельного состава.
Вторым по объему и сложности видом ремонтных работ на флотах и флотилиях являлся ремонт артиллерийского вооружения, занимавший 10,4 процента всех ремонтных работ. Трудности его объяснялись наличием значительного количества громоздких орудий тяжелого калибра (от 180- до 406-мм), сложностью устройства артиллерийских систем, их энергетического хозяйства, особенно автоматических приборов управления стрельбой, а также необходимостью производства работ непосредственно на кораблях (батареях). Нередко ремонт артиллерийского вооружения выполнялся в непосредственной близости от линии фронта, под огнем противника, что требовало высоких темпов работ, большого напряжения сил, мужества воинов-ремонтников и личного состава орудийных расчетов. Например, в Севастополе в период напряженных боев была произведена вручную замена стволов 305-мм орудий на башенных батареях № 30 и № 35. Новые стволы на батарею № 35 перевезли (на 1,5 км) с помощью опорных тележек козлового крана. Подъем старых стволов из люльки, погрузка и съемка с тележки, укладка в люльку новых стволов производились при помощи домкратов. Батарея № 30 находилась в 1,5–2 км от линии фронта, под обстрелом противника. С помощью тракторов и домкратов орудийные стволы сменили в течение 16 суток — в два раза быстрее, чем в обычных условиях с помощью крана. За успешное выполнение этих работ на батарее № 30 восемь человек были награждены орденами534. Такой же трудовой героизм и находчивость проявили ремонтники при восстановлении одной из береговых батарей форта «Ф» около Ораниенбаума в октябре 1941 г. и в других местах.
Большой объем ремонтных работ выполняли мастерские складов минно-торпедных отделов флотов. В 1943–1944 гг. ежемесячно на каждом флоте ремонтировалось 100–200 торпед. За годы войны мастерские трального склада № 189 Балтийского флота изготовили 5305 комплектов различных тралов и 37 тыс. запасных узлов к ним, отремонтировали 14 тыс. комплектов поврежденных тралов и 62 тыс. узлов к ним535.
В ходе боевых действий интенсивно использовалась морская авиация. На трех действующих флотах в течение всей войны она произвела 346 817 самолето-вылетов. Потребовалось организовать массовый ремонт авиационной техники и вооружения.
Эту задачу выполняли полевые авиаремонтные мастерские в частях и ремонтные базы военно-воздушных сил флотов. В отдельных случаях оказывали помощь ремонтные предприятия ВВС Советской Армии. Наиболее массовый текущий ремонт самолетов и авиационных моторов в войсковом тылу выполняли подвижные авиационные мастерские, которые имелись в каждой авиационной базе. Их количество в авиации ВМФ за время войны увеличилось в 3 раза. Общий объем работ по ремонту самолетов и авиационной техники в ВМФ составлял 4,9 процента всего объема ремонтных работ536.
Ремонт автотракторной техники осуществлялся заводами промышленности, Народного комиссариата обороны и предприятиями ВМФ. Другие службы флота также имели свои производственные предприятия, которые ремонтировали средства связи, радиолокации, гидроакустики, навигационное и гидрографическое имущество, оборудование топливных складов, кухонь и камбузов, медицинское имущество.
В целом в ходе войны заводы и специализированные ремонтные предприятия промышленности, а также предприятия Наркоматов судостроительной промышленности и Военно-Морского Флота выполнили большой объем ремонтных работ. Ежегодно на ремонте кораблей, вооружения и техники было занято около 23 тыс. рабочих. Рабочие и инженерно-технический персонал ремонтных предприятий ввели в строй большое количество боевых кораблей и различной техники, поврежденной в ходе боевых действий.
Инженерное оборудование морских театров военных действий в годы войны требовало больших сил и средств, несмотря на то что оно велось в ограниченных по сравнению с довоенным периодом масштабах. В 1941–1942 гг. в основном осуществлялось оборонительное строительство (сооружение береговых и зенитных батарей, оборонительных рубежей на подступах к военно-морским базам, противодесантной обороны). К этим работам широко привлекался личный состав частей и учреждений, гражданское население. Оборонительные рубежи под Севастополем позволили силами и средствами Черноморского флота задержать противника до подхода соединений и частей Приморской армии и подкреплений с Северо-Кавказского фронта. Они сыграли важную роль в ходе восьмимесячной героической обороны города.
В 1943 г. объем оборонительного строительства на флотах стал снижаться. Главное место заняло капитальное строительство на военно-морских базах. Если в 1942 г. оно составляло 18 процентов общего объема инженерных работ, то в 1945 г. достигло 58,6 процента. В общем объеме капитального строительства основное место занимало аэродромное. Остальные виды строительства (жилищное, складское) были сокращены, а в гаванях в основном ремонтировали гидротехнические сооружения.
В 1944–1945 гг. строительные работы были направлены на более широкое обеспечение боевой деятельности флотов и флотилий, усиление инженерного оборудования театров военных действий, развертывание восстановительных работ в освобожденных базах, усиление складского строительства.
В период войны важное значение приобрело инженерное обеспечение десантных операций, обороны военно-морских баз, наступательных операций сухопутных войск на приморских направлениях, боевых действий речных флотилий. При обороне военно-морских баз усиленно строились оборонительные рубежи сухопутных войск, различного рода убежища и укрытия. Инженерное обеспечение десантных операций включало оборудование пунктов посадки, десантных и высадочных средств, пунктов высадки и обеспечение действий десанта на берегу. В операциях по содействию наступающим сухопутным войскам основное внимание уделялось оборудованию пунктов маневренного базирования и быстрому восстановлению минимума объектов в освобожденных базах. В инженерном обеспечении речных флотилий наряду с оборудованием баз и обеспечением боевых действий необходимо было осуществить оперативный маневр речных кораблей с одного речного театра военных действий на другой и между оперативными направлениями (подъем и спуск катеров, размывка перекатов, ликвидация заграждений на реке).