Великая Отечественная война со всей очевидностью подтвердила правильность линии Коммунистической партии на осуществление в Тылу Вооруженных Сил принципа единоначалия. Сущность его как принципа управления тылом заключалась в единоличной ответственности командующих и командиров всех степеней за все стороны жизни и деятельности подчиненных войск (сил), в том числе и за их тыловое обеспечение. От начала и до конца войны при подготовке и в ходе операций организация тылового обеспечения являлась неотъемлемой, важнейшей областью работы всех командующих и командиров по руководству войсками (силами). Единоначалие командующих и командиров сочеталось с инициативой их заместителей по тылу, начальников штабов тыла, начальников родов войск, специальных войск и служб, а также всех офицеров органов управления тылом при выполнении ими решений единоначальников. Последние принимали решения только по важнейшим вопросам организации тылового обеспечения. Их заместители по тылу, начальники штабов тыла, родов войск, специальных войск и служб на основе прав, предоставленных им законами и регламентируемых уставами и приказами вышестоящих начальников, в пределах своих функций и полученных задач непосредственно решали все конкретные вопросы организации тылового обеспечения войск (сил).
Огромную роль в успешном выполнении большого комплекса сложных задач тылового обеспечения Вооруженных Сил в ходе войны сыграло осуществление принципа централизации управления тылом. Этот принцип проводился в жизнь по двум направлениям.
Первое направление выражалось в объединении командованием и органами управления тылом вышестоящей инстанции деятельности не только непосредственно подчиненных, но и всех нижестоящих тыловых соединений, частей, учреждений и органов управления тылом, в сосредоточении по единому плану их усилий в целях полного и бесперебойного тылового обеспечения войск (сил). Такую централизацию руководства тыловым обеспечением Вооруженных Сил В. И. Ленин считал непременным условием победы. Еще в годы гражданской войны в «Проекте директивы ЦК о военном единстве» он рекомендовал «признать безусловно необходимым на все время социалистической оборонительной войны объединение всего дела снабжения Красной Армии под единым руководством Совета Обороны и других центральных учреждений РСФСР»660.
Данное требование партии соблюдалось на всех этапах развития Тыла Вооруженных Сил, особенно в военные годы. В Великую Отечественную войну все важнейшие вопросы мобилизации людских и материальных ресурсов страны решал высший военно-политический орган — Государственный Комитет Обороны, а выполнение его решений осуществлялось через Генеральный штаб, аппарат заместителя Народного комиссара обороны — начальника Тыла Советской Армии и другие центральные органы управления Вооруженных Сил. Централизация управления тылом проводилась и в его нижестоящих звеньях. Это позволяло соответствующему командованию и его органам управления оперативно и экономно использовать имеющиеся в их распоряжении силы и средства тылового обеспечения, быстро переносить усилия тыла с одних направлений на другие и решительно влиять на ход военных действий. Однако вышестоящим командованием и органами управления решались не все вопросы тылового обеспечения войск (сил). Централизация управления сочеталась с предоставлением подчиненным самостоятельности и возможности проявлять инициативу и творчество, особенно при выборе способов выполнения полученных задач.
Второе направление централизации управления Тылом Вооруженных Сил выражалось во все большем сосредоточении функций руководства тыловым обеспечением войск (сил) в единых органах управления различных звеньев тыла. Объективная необходимость в этом проявлялась уже в первом периоде войны. Тогда по решению Государственного Комитета Обороны заместитель Народного комиссара обороны — начальник Тыла Советской Армии и соответственно начальники тыла оперативных объединений, соединений и частей сосредоточивали в своих руках решение всех основных вопросов, связанных с построением тыла, подготовкой и использованием транспортных коммуникаций, подвозом материальных средств, руководством большинством видов тылового обеспечения войск (сил), организацией охраны, обороны тыла, связи и управления им. Следовательно, фактически в ходе всей Великой Отечественной войны начальники тыла всех степеней являлись основными организаторами тылового обеспечения войск и сил флота.
Вместе с тем такая централизация управления тылом не умаляла роли начальников родов войск, специальных войск и служб, которые непосредственно организовывали соответствующие виды тылового обеспечения объединений, соединений и частей по специальностям. При этом по вопросам размещения и перемещения, охраны и обороны тыловых соединений, частей и учреждений, использования местных материальных ресурсов, подвоза материальных средств и эвакуации они взаимодействовали с начальниками тыла и выполняли их указания.
Принципы научности управления тылом и предвидения в условиях прошлой войны приобрели весьма важное значение. Это обусловливалось сложным ее характером, оснащением всех звеньев тыла большим количеством разнообразной техники, огромным объемом стоящих перед ним задач и необходимостью предвидения хода событий. От руководящих кадров и личного состава органов управления тылом требовались глубокие знания и неуклонное соблюдение марксистско-ленинской методологии, объективных законов войны, принципов советского военного искусства, и в частности принципов организации тылового обеспечения войск (сил), применение новейших технических средств и научных методов управления тылом, постоянное знание, глубокий анализ и правильная оценка конкретной обстановки, умение находить в ней главное. Подавляющее большинство руководящих кадров и личного состава органов управления Тылом Вооруженных Сил обладало этими качествами, что позволило им успешно справиться с возложенными на них обязанностями.
Опыт Великой Отечественной войны внес много нового и в методы работы органов управления тылом. Прежде всего выявилась необходимость в приближении (при определенных условиях) центральных органов управления к стратегическим группировкам Вооруженных Сил и в организации промежуточных звеньев руководства силами и средствами тыла стратегического звена. Это достигалось путем выделения на определенные направления оперативных групп из состава центрального аппарата и созданием специальных органов управления. Они контролировали состояние тылового обеспечения соответствующих группировок войск и сил флота, перераспределяли между оперативными объединениями запасы материальных средств и прибывающие транспорты и выполняли другие присущие им функции. Промежуточные органы управления тылом центра создавались при главнокомандующем советскими войсками на Дальнем Востоке, для обеспечения войск Ленинградского фронта и населения Ленинграда в период блокады и в ряде других случаев.
Большое значение в успешном тыловом обеспечении Вооруженных Сил в ходе войны имело четкое его планирование во всех звеньях управления тылом, особенно в центральном. В условиях ограниченного времени процесс планирования в центральном аппарате, как правило, сливался с доведением задач до основных исполнителей. Переписка между штабом Тыла Советской Армии и центральными управлениями, подчиненными начальнику тыла, обычно не велась. Указания начальника Тыла Советской Армии, даваемые им лично или через начальника штаба Тыла, записывались должностными лицами в рабочие тетради, и немедленно организовывалось их исполнение. Для планирования тылового обеспечения группировок Вооруженных Сил в операциях привлекались только штаб Тыла и некоторые специалисты главных и центральных управлений. Директивы по тылу фронтам и флотам высылались, как правило, при перенесении тыловых границ и назначении новых распорядительных станций. Они разрабатывались в штабе Тыла, согласовывались с Генеральным штабом и подписывались начальником Генерального штаба и начальником Тыла Советской Армии. По мере необходимости фронтам и флотам отдавались также распоряжения по отдельным вопросам их тылового обеспечения. Это способствовало повышению оперативности в управлении тылом.
Правильное планирование работы тыла и четкое руководство тыловым обеспечением Вооруженных Сил достигались постоянным знанием начальниками тыла всех степеней, их штабами, начальниками родов войск, специальных войск и служб в части, их касающейся, оперативно-стратегической (оперативной, боевой) обстановки и задач, выполняемых войсками (силами) в операциях. В решении этого вопроса очень важно было поддержание тесного взаимодействия между Генеральным штабом (штабами объединений, соединений, частей) и соответствующими штабами тыла (должностными лицами).