3 отдел (КРО) — (комиссар гб 3 ранга Н.Г.Николаев-Журид);
4 отдел (СПО) — (майор гб А.С.Журбенко);
5 отдел (ИНО) — (старший майор гб 3.И.Пассов);
6 отдел (наблюдение за милицией, пожарной охраной, военкоматами) — (майор гб И.Д.Морозов);
7 отдел (оборонной промышленности) — (майор гб Л.И.Рейхман);
8 отдел (промышленный) — (комиссар гб 3 ранга А.М.Минаев-Цикановский);
9 отдел (сельского хозяйства) — (должность начальника отдела торговли, заготовок была вакантной).
Этим же приказом НКВД СССР в составе центрального аппарата НКВД СССР были организованы следующие самостоятельные оперативно-чекистские отделы:
Учетно-регистрационный отдел (УРО) (1 спецотдел НКВД СССР) — (старший майор гб И.И.Шапиро);
Отдел опертехники (2 спецотдел) — (врио начальника — майор гб М.С.Алехин);
Спецотдел (шифровальный) — (капитан гб А.Д.Баламутов);
Тюремный отдел — (майор гб Н.И.Антонов-Грицюк).
На основании постановления ПВС СССР от 16 апреля 1938 г., объявленного приказом НКВД СССР № 370 от 11 июня 1938 г. Центральное архивное управление из ведения бывшего ЦИК СССР было передано в ведение НКВД СССР.
На основании постановления СНК СССР от 17 апреля 1938 г. акционерное общество "Интурист" было передано в ведение НКВД СССР. Приказом НКВД СССР № 478с от 9 августа 1938 г. а/о "Интурист" было подчинено АХУ НКВД СССР, а в циркуляре НКВД СССР № 165сс от 16 августа 1938 г. было записано: "О переходе местных отделений и представительств "Интурист" в ведение НКВД должны знать только заведующие местными отделениями "Интурист". Местные отделения "Интурист" в дальнейшем сохраняют свое прежнее название и вопрос о переходе "Интуриста" в ведение НКВД разглашению не подлежит".
Но вхождение "Интуриста" в НКВД было недолгим. В структуре НКВД СССР, объявленной приказом НКВД СССР № 00641 от 29 сентября 1938 г., "Интурист" уже не значился.
НКВД СССР
сентябрь 1938, г. — февраль 1941 г
22 августа 1938 года первым заместителем наркома ВД СССР был назначен первый секретарь ЦК КП(б) Грузии Л.П.Берия, а 8 сентября 1938 года комкор М.П.Фриновский был освобожден от должности первого заместителя наркома ВД СССР и назначен наркомом Военно-Морского флота СССР. 14 сентября 1938 г. ему было присвоено воинское звание "Командарм 1 ранга".
На основании постановления СНК СССР от 5 сентября 1938 г. Главное управление мер и весов НКВД СССР и на основании постановления СНК СССР № 994 от 14 сентября 1938 г. Главное управление геодезии и картографии НКВД СССР были из системы НКВД изъяты.
29 сентября 1938 г. Л.П.Берия был назначен начальником ГУГБ НКВД СССР (11 сентября 1938 г. ему было присвоено звание комиссара гб 1 ранга), а заместителем начальника ГУГБ НКВД СССР был назначен бывший зав. отделом ЦК КП(б) Грузии В.Н.Меркулов (с 11 сентября 1938 г. — комиссар гб 3 ранга).
29 сентября 1938 г. была объявлена новая структура НКВД СССР:
ГУГБ, Главное экономическое управление (ГЭУ), Главное транспортное управление (ГТУ), Главное управление пограничных и внутренних войск (ГУПВВ), ГУРКМ, ГУЛАГ, ГУШОСДОР, ГУПО, Главное тюремное управление, Главное архивное управление (ГАУ), Управление коменданта Московского Кремля (УКМК), Административно-хозяйственное управление (АХУ), Дальстрой (ГУСДС), 1 спецотдел (учетно-регистрационный), 2 спецотдел (опертехники), 3 спецотдел (обыски, аресты, наружное наблюдение), Центральный отдел актов гражданского состояния (ЦОАГС), Центральный финансово-плановый отдел (ЦФПО), Отдел кадров (ОК), Переселенческий отдел, Особоуполномоченный НКВД СССР, Особое конструкторское бюро (ОКБ), Бюро по приему и рассмотрению жалоб, Инспекция по котлонадзору, Секретариат НКВД СССР.
В ГУГБ НКВД СССР вошли следующие отделы:
1 отдел (охраны правительства), 2 отдел (СПО), 3 отдел (КРО), 4 отдел (ОО), 5 отдел (ИНО), 6 отдел (военизированных организаций), 7 отдел (спецотдел).
Для ГЭУ была установлена следующая структура:
1 отдел (оборонной промышленности), 2 отдел (тяжелой промышленности и машиностроения), 3 отдел (легкая промышленность, лесная и местная промышленность), 4 отдел (сельское хозяйство и заготовки), 5 отдел (торговля, кооперация, финансы).
ГТУ имело следующую структуру:
1 отдел (ж.д. транспорт), 2 отдел (водный транспорт), 3 отдел (связь, гражданский воздушный флот, шоссейно-дорожное строительство).
Окончательно ГЭУ сформировалось лишь 4 сентября 1939 г., когда начальником этого главка был назначен Б.З.Кобулов.
Организационный период для ГТУ продлился до 31 марта 1939 г., когда начальником главка был назначен С.Р.Мильштейн.
4 октября 1938 г. заместителем наркома ВД СССР по хозяйству был назначен бывший нарком местной промышленности РСФСР Г.В.Филаретов. 16 ноября 1938 г. он стал также (по совместительству) и начальником ГУЛАГа НКВД СССР, но проработал в этой должности недолго: 17 февраля 1939 г. Г.В.Филаретов был освобожден от всех должностей в НКВД СССР и откомандирован в распоряжение ЦК ВКП(Б), а начальником ГУЛАГа НКВД СССР был назначен бывший начальник ГУРКМ НКВД СССР и заместитель наркома ВД СССР комдив В.В.Чернышев.
17 ноября 1938 г. В.М.Молотов и И.В.Сталин подписали совместное постановление СНК СССР и ЦК ВКП(б) "Об арестах, прокурорском надзоре и ведении следствия", в котором были отмечены крупные недостатки и извращения в работе органов НКВД.
23 ноября того же года Н.И.Ежов пишет письмо в Политбюро ЦК ВКП(б) на имя И.В.Сталина, в котором просит освободить его от работы наркомом внутренних дел СССР из-за целого ряда ошибок и промахов, допущенных им на этом посту.
24 ноября 1938 г. последовало решение Политбюро ЦК ВКП(б) об удовлетворении просьбы Ежова об освобождении его от обязанностей народного комиссара внутренних дел СССР ввиду изложенных в заявлении Ежова мотивов, и также принимая во внимание его болезненное состояние.
За Ежовым решено было оставить должности секретаря ЦК ВКП(б), председателя Комиссии партийного контроля и наркома водного транспорта СССР.
25 ноября 1938 г. Указом ПВС СССР Н.И.Ежов был освобожден от должности наркома внутренних дел СССР. Тогда же на эту должность был назначен Л.П.Берия. Однако в газетах опубликован этот Указ был лишь 8 декабря 1938 г.
Заместителей наркома ВД СССР постигла та же участь, что и самого "железного наркома". Агранов, Фриновский, Берман, Прокофьев, Бельский, Жуковский и Заковский были расстреляны, Курский застрелился сам, Рыжов умер в тюрьме, находясь под следствием. Только одному В.В.Чернышеву каким-то образом удалось избежать участи своих коллег-заместителей наркома ВД СССР: 18 февраля 1939 г. он был назначен начальником ГУЛАГа по совместительству с должностью заместителя наркома ВД СССР, а с 26 февраля 1941 г. и до своей смерти 12 сентября 1952 г. В.В.Чернышев работал заместителем наркома (министра) внутренних дел СССР и курировал в основном работу лагерных управлений НКВД (МВД) СССР, таких, как ГУЛАГ, Главгид-рострой, ГУЛЖДС, Главпромстрой и других.
Выступая перед слушателями Высшей школы НКВД СССР в 1939 г., научный сотрудник 1 спецотдела НКВД СССР, а со 2 августа 1939 г. — заместитель начальника Особого бюро при НКВД СССР, А.И.Коссой говорил, что с приходом в НКВД Л.П.Берия и под руководством партии советская разведка очистилась от банды предателей и шпионов, пролезших в ее ряды, и что ряды советской разведки обновились и пополнились новыми кадрами, посланными на этот решающий участок охраны государственной безопасности страны социализма, и что под руководством своего наркома товарища Берия, верного ученика и соратника товарища Сталина, советская разведка, очистившись от врагов народа, от шпионов иностранных разведок, стоит на страже нашей социалистической Родины.
С приходом в НКВД СССР Л.П.Берия и после проведения чистки ежовских кадров как в центре, так и на местах, расстановка руководства НКВД СССР была следующей:
Л.П.Берия — нарком внутренних дел СССР;
В.Н.Меркулов — 1 зам. НКВД СССР и начальника ГУГБ НКВД СССР;
И.И.Масленников — зам. НКВД СССР по войскам;
В.В.Чернышев — зам. НКВД СССР и нач. ГУЛАГА;
С.Н.Круглов — зам. НКВД СССР по кадрам.
16 декабря 1938 г. первым заместителем наркома ВД СССР был назначен комиссар гб 3 ранга В.Н.Меркулов, а 17 декабря 1938 г. он стал начальником ГУГБ НКВД СССР. Его заместителями были назначены комиссар гб 3 ранга В.Г.Деканозов (начальник 3 и5 отделов ГУГБ) и старший майор гб Б.З.Кобулов (начальник 2 отдела ГУГБ).
22 декабря 1938 г. была организована Следственная часть (Следчасть) НКВД СССР. Начальником стал по совместительству Б.З.Кобулов
20 февраля 1939 г. 2 спецотдел НКВД СССР был разделен на два самостоятельных отдела:
Отдел оперативной техники (2 спецотдел НКВД СССР, начальник — Е.П.Лапшин);
Отдел лабораторий (4 спецотдел НКВД СССР, начальник — М.П.Филимонов).
Постановлением СНК СССР № 245 от 28 февраля 1939 г. заместителями наркома внутренних дел СССР были назначены: комбриг И.И.Масленников (по войскам); майор гб С.Н.Круглов (по кадрам).