За три дня до смерти, в воскресенье 14 июля, по просьбе государя в доме разрешили совершить богослужение. Впервые никто из царской семьи не пел во время службы, все молились молча. Протоиерей местного собора в Екатеринбурге отец Иоанн (Сторожев) позже вспоминал: «Когда по чину обедницы (так как мы служили не обедню, а обедницу) отец диакон должен был прочитать молитву «Со святыми упокой», он почему-то вместо того, чтобы прочесть ее, запел: «Со святыми упокой» (что обычно делается только на панихиде или похоронах). Я, хотя и заметил ошибку, стал, однако, ему подпевать. Как только мы запели, я услышал за собой шум — все присутствующие опустились на колени и горячо молились — вышла точно панихида… По окончании службы, когда подходили к кресту, отец диакон передал государю и государыне вынутые просфоры (осмотренные ранее чекистом Юровским). Когда я уходил, то, проходя возле Великих Княжон, ясно услышал их сдержанный шепот: «Спасибо, батюшка».
Государь в письме к сестре с присущей ему силой духа в дни тяжких испытаний писал: «Я твердо верю, что Господь умилосердится над Россиею и умирит страсти в конце концов. Да будет Его святая воля». Великая Княжна Ольга, обращаясь к близким, писала из заточения: «Отец просил передать всем тем, кто ему остался предан, и тем, на кого они могут иметь влияние, чтобы они не мстили за него, он всех простил и за всех молится, и чтобы помнили, что то зло, которое сейчас в мире, будет еще сильнее, но что не зло победит зло, а только любовь».
Мученическая кончина, по промыслу Божиему, настигла всю семью в один день в награду за безграничную и взаимную их любовь, при жизни они являли пример истинно православной дружной семьи, смерть же навеки скрепила их воедино. В момент мученической кончины государю было 50 лет, государыне 46 лет, великим княжнам Ольге 23 года, Татьяне 21 год, Марии 19 лет, Анастасии 17 лет, цесаревичу Алексею 14 лет. Вместе с ними были убиты горничная А. С. Демидова, лейб-медик Е. С. Боткин, повар Харитонов, лакей Трупп.
Символична и сама дата убийства — 17 июля. В этот день, в 1174 году, был мученически убит великий князь Владимирский — Андрей Боголюбский, который считал Православие основой государственности Святой Руси. После ипатьевской трагедии святейший патриарх Тихон заявил во всеуслышание в Казанском соборе в Москве: «На днях совершилось ужасное дело: расстрелян бывший государь Николай Александрович… Мы должны, повинуясь учению Слова Божия, осудить это дело, иначе кровь расстрелянного падет и на нас, а не только на тех, кто совершил его. Мы знаем, что он, отрекаясь от престола, делал это, имея в виду благо России и из любви к ней. Он мог бы после отречения найти себе безопасность и сравнительно спокойную жизнь за границей, но он не сделал этого, желая страдать вместе с Россией».
Святые Царственные МученикиМитрополиту Московскому Макарию в первые дни после революции было видение государя. Вначале ему явился Иисус Христос и повел за собой, у входа в чудный сад митрополит проснулся, затем, когда он вновь уснул, то увидел тот же сад, а в нем государя Николая II, который стоял перед Иисусом. Спаситель держал в руках две чаши: одну горькую, для русского народа, другую сладкую, для царя. Тогда царь упал пред ним на колени и стал просить горькую чашу для себя. Спаситель вынул из горькой чаши раскаленный уголь и положил царю в руку. Николай Александрович стал перекладывать уголь из одной ладони в другую и при этом все время просветлялся телом, пока не стал светлым духом… После этого Макарий увидел царя среди народа, и тот раздавал людям манну, а незримый голос в это время произнес: «Государь взял вину русского народа на себя, русский народ прощен».
Господь в Священном Писании подчеркнул: «Прости им грехи их; а если нет, то изгладь и меня из книги Твоей, в которую Ты вписал» (Исх. 32, 32). «Быть может, необходима искупительная жертва для спасения России: я буду этой жертвой — да свершится воля Божия!» — говорил Николай Александрович. В 1917 году игумен Герман (Подмошенский) видел сон: все небо было черное, страшное. И посреди его был свет и там Христос распятый. Он умирал! Глава Его склонилась, и мускулы Его рук дрожали от страдания. И я слышал голос: «Молитесь, Россия распята». Вслед за царем на Голгофу взошли духовные лица, верующие христиане, а святые места были уничтожены и разорены.
Серафим Саровский в 1832 году предсказал не только трагическое падение царской власти, но и ее восстановление и воскрешение России: «…но когда Земля Русская разделится и одна сторона явно останется с бунтовщиками, другая же явно станет за государя и Отечество и Святую Церковь, а государя и всю царскую фамилию сохранит Господь невидимою десницею Своею и даст полную победу поднявшим оружие за него, за Церковь и за благо неразделенности земли Русской, но не столько и тут крови прольется, сколько, когда правая за государя ставшая сторона получит победу и переловит всех изменников и предаст их в руки правосудия, тогда уже никого в Сибирь не пошлют, а всех казнят, и вот тут-то еще более прежнего крови прольется, но эта кровь будет последняя, очистительная кровь, ибо после того Господь благословит люди Свои миром и превознесет помазанного Своего Давида, раба Своего, мужа по сердцу Своему».
Многие подвижники свидетельствовали, что исцеление России начнется тогда, когда будут прославлены царственные мученики в своем Отечестве. Среди пророчествующих были преподобный Кукша Одесский, святитель Иоанн Шанхайский, блаженная Паша Саровская и митрополит Макарий Московский, сербский святитель Николай Велимирович и почитаемый в Болгарии архиепископ Серафим Соболев, в наши дни о том свидетельствуют иеромонах Серафим Роуз и другие отцы Православной Церкви.
Вопрос о причислении царя-мученика к лику святых первой подняла Сербская Православная Церковь в 30-е годы двадцатого столетия. Сербский народ всем сердцем любил царя Николая II.
В 1925 году в сербской печати появилась статья, описывающая, как одной пожилой сербке, у которой на войне погибли два сына, а один пропал без вести, после долгой молитвы за всех погибших на минувшей войне было видение. Несчастная мать заснула и во сне увидела государя Николая II; он сказал ей, что ее сын жив и находится в России, где боролся за славянское дело вместе со своими братьями. Еще царь сказал: «Ты не умрешь, пока не увидишь своего сына». И вскоре после этого сна мать получила известие, что сын ее жив, а через несколько месяцев она уже смогла обнять его — живого и невредимого.
В 1927 году в газетах Белграда было напечатано сообщение о «лике Николая II в сербском монастыре Святого Наума на Охридском острове». В этом сообщении рассказывалось, как художник и академик живописи С. Ф. Колесников, приглашенный расписывать новый храм в древнем сербском монастыре, должен был написать лики святых, размещенных в пятнадцати овалах. Ближе к завершению работы, когда лики четырнадцати святых уже были написаны, художник засомневался и никак не мог решиться с выбором последнего. Но однажды во время раздумий храм вдруг озарился чудным светом, а овал, который художник подготовил для пятнадцатого лика, вдруг ожил и на нем стал проявляться скорбный образ Николая II. Художник был так удивлен, что некоторое время стоял пораженный, но затем начал писать по увиденному, обводя контуры лика не углем, как это обычно делалось, а сразу кистями. Он работал без всяких фотографий, лишь по воспоминаниям, когда несколько раз видел покойного государя, и созданный лик восхищал затем многих своим чудесным появлением.
Отпевание царя-мученика и всех, кто пострадал вслед за ним, но не был отпет, совершилось спустя пятьдесят лет после злодеяния — 4 (17) июля 1968 года.
В 1981 году царственные мученики были прославлены Русской Православной Церковью за границей.
В России в день 80-летия мученической кончины царской семьи в Петербурге совершилось торжественное захоронение «екатеринбургских останков». В Троице-Сергиевой лавре святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II призвал весь народ покаяться в великом грехе цареубийства. По всей стране, а также в Москве, Санкт-Петербурге, Екатеринбурге прошли покаянные крестные ходы.
