Союзники полагали, что они теперь добьются полной победы сами, и стремились избавиться от русских кораблей и русских войск.
В конце концов и Павлу I и его министрам стала ясной двуличная политика австрийского и английского правительств. Предав Суворова, они хотели предать и Ушакова, с тем чтобы лишить Россию флота и устранить ее влияние на Балканах и в Средиземном море.
21 декабря 1799 года адмирал Ушаков, находясь в Мессине, получил высочайший указ вернуться со всеми кораблями и войсками в Черное море. Но еще долгих 10 месяцев, преодолевая штормы и интриги, добирался Ушаков с русской эскадрой до родного Севастополя-Ахтиара. Он испытывал горечь оттого, что добрые семена, оставленные им на Ионических островах, стремились не без успеха растоптать люди, называющие себя первым сословием, и что эти их стремления поддерживает не только султан Селим, но и император российский.
Целый год затем заняло составление отчета об экспедиции. К этому времени ушел из Черноморского флота с повышением в Петербург Мордвинов. На его место Павел I назначил такого же царедворца и бездарного моряка фон Дезина. Ничто не менялось к. лучшему, наоборот, становилось все хуже и хуже.
Вскоре после того как Мордвинов стал морским министром, служба для Ушакова стала невыносимой. В 1802 году новый император Александр I перевел Ушакова на Балтику главным командиром гребного флота, а через два года стараниями Мордвинова его фактически отстранили от дел флота, назначив начальником флотских команд в Петербурге.
Ушаков еще два года маялся на этом посту, не имея возможности влиять на судьбу флота, приходящего во все больший и больший упадок. Наконец, не выдержав засилья иноземцев, интриг Мордвинова и всей бессмыслицы дальнейшей службы, он подает рапорт об отставке и получает ее. В 1807 году адмирал Ушаков увольняется от службы с мундиром и с пенсией в полный оклад содержания.
Тихая жизнь в отставке от любимого дела перемежалась только редкими визитами старых друзей да вестями, приходившими с газетных страниц.
Адмирал Федор Федорович Ушаков, кавалер орденов Владимира 4, 3 и 2-й степеней, Георгия Победоносца 4 и 2-го класса, Александра Невского с бриллиантовыми знаками к нему, Командорского креста Иоанна Иерусалимского и ордена Святого Януария; пожалованный за Средиземноморский поход турецким султаном Селимом III двумя алмазными челенгами на шляпу, двумя золотыми табакерками с бриллиантами и алмазами, собольею шубой и пятью медными пушками; награжденный Сенатом Республики семи островов мечом, украшенным алмазами, Сенатом островов Занте, Цериго, Кефалония и Св. Мавра — мечом и щитом с благодарственной надписью, золотыми медалями, также с надписями в его честь, скончался в своей наследственной деревеньке Алексеевне, Темниковского уезда, Тамбовской губернии 2 октября 1817 года.
Судьба его друзей и соратников до конца дней была связана с русским флотом. Адмирал Сенявин продолжил дело Ушакова в третьем походе русского флота в Средиземное море в 1805–1807 годах. Егор Метакса дослужился до чина капитана 2-го ранга и до 1814 года служил на Черноморском флоте. Захар Веков проделал с адмиралом Сенявиным третий Средиземноморский поход и оказал большую помощь ему своими знаниями театра и старыми связями. Он умер после пленения русского флота англичанами в Портсмуте, разделив судьбу многих русских моряков, умерших, как тогда писали, «от неизвестной болезни», а на самом деле — от голода.
Воспитанник Захара Акоп принял фамилию Извеков и по просьбе Ушакова был зачислен в Кадетский корпус чужестранных единоверцев. Окончил его по первому разряду и служил на флоте. В 1825 году за сочувствие декабристам был разжалован и сослан, след его затерялся где-то в Сибири. Счастливее оказался бывший адъютант Ушакова Петр Балабин. Он один из всех героев этой повести женился, был счастлив в детях и внуках. С флотом он расстался вскоре после возвращения в Севастополь.
Слава Ушакова и его соратников по достоинству оценена только в советское время. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 3 марта 1944 года были учреждены орден Ушакова двух степеней и медаль его имени, которыми награждаются офицеры и матросы советского Военно-Морского Флота за подвиги во славу своей Отчизны.
В отечественной истории Средиземноморский поход 1798–1800 годов русского Черноморского флота под командованием прославленного флотоводца Федора Федоровича Ушакова занимает особое место. Героические дела, свершенные русскими солдатами, матросами и офицерами, взятие неприступной крепости на острове Корфу во многом определили расстановку политических и военных сил в связи с французской экспансией на Средиземном море.
Военные события, о которых рассказывается в исторической повести «Корабли надежды», были следствием социально-политических потрясений, вызванных Великой французской буржуазной революцией 1787–1794 годов.
Феодально-монархическая Европа не могла смириться с появлением в самом центре континента республиканского государства, где «чернь» посмела обезглавить короля и провозгласила лозунг: «Свобода, Равенство, Братство!» Все монархи Европы считали своим долгом принять участие в восстановлении необходимого «порядка», в организации «крестового похода» против республики. Русская императрица Екатерина II призывала к немедленному военному подавлению революции: «Дело французского короля есть дело всех государей… В настоящее время достаточно десяти тысяч человек, чтобы пройти Францию из конца в конец». По императрица ошибалась, как ошибались и другие монархи и правительства Европы.
Первыми подавить французскую революцию попытались австро-прусские войска, которые сначала добились определенных успехов и сумели потеснить республиканскую армию. Казалось, что дни республики сочтены. Австрия, Пруссия, Англия, Испания и Голландия, входившие в первую антифранцузскую коалицию, торжествовали.
Однако, к великому изумлению Европы, неопытная вначале, слабо вооруженная и обученная, французская революционная армия вскоре не только отразила «крестовый поход», но, после назначения командующим французской армией в Италии молодого генерала Бонапарта, в ряде сражений нанесла поражения военным силам коалиции, что привело к подписанию мирного договора между воюющими сторонами. Однако этот договор не принес длительного мира в Европу. Политическая обстановка продолжала оставаться напряженной. Вскоре распалась первая антифранцузская коалиция. Только Англия, защищенная Ла-Маншем, с ее громадными заморскими владениями, жемчужиной которых была Индия, осталась недосягаемой для армии Бонапарта.
В 1794 году в результате контрреволюционного переворота к власти во Франции пришла крупная буржуазия. Ей потребовались новые рынки и территории, а также мешала конкуренция промышленности Англии. Это определило политику Франции, которая начала вести захватническую войну. Так война за независимость республиканской Франции превратилась в войну за годсподство в Европе, за передел колоний.
В результате кампаний 1796–1798 годов Францией были оккупированы Ломбардия, Пьемонт, Ионические острова и ряд крепостей на побережье Албании, составлявших часть Венецианской республики.
В планах Бонапарта Ионическим островам придавалось весьма большое значение. «Острова Корфу, Занте и Кефалония важнее для нас, чем вся Италия вместе…» — писал он. Действительно, достаточно посмотреть на карту, чтобы убедиться: острова Корфу, Св. Мавра, Кефалония, Занте, Паксос и другие, входящие в Архипелаг, являются прекрасной базой, с которой можно угрожать вторжением как на Балканский полуостров, так и на любую территорию восточного Средиземноморья.
Наступил 1798 год. Европа давно не переживала столь тревожного времени. В Тулоне и Бресте, Рошфоре и Лориане Франция снаряжала армию и сосредоточивала свои военно-морские силы. По первоначальному замыслу Бонапарта, армия вторжения должна была пересечь Ла-Манш и одним ударом покончить с Англией, которая не имела сильной сухопутной армии. Но на пути осуществления этого плана было препятствие — английский флот, самый крупный военный флот того времени, на котором служило около ста тысяч человек. Получая агентурные данные о приготовлении армии вторжения, английское правительство предприняло все меры, дабы обезопасить Британию. Более шестидесяти кораблей блокировали французские порты, готовые сорвать любой план по высадке десанта.
Явное превосходство англичан на море заставило французское правительство отказаться от десанта на Британские острова. Был принят другой план: лишить Англию самой богатой колонии — Индии, которая была краеугольным камнем ее экономического могущества; рухнет экономическое могущество, не станет и английского господства в европейских делах. Но единственный возможный путь в Индию для французской армии лежал через Египет и страны Ближнего Востока.