Ислам на Северном Кавказе начал распространяться с VIII столетия. Первыми его приняли народы Дагестана, куда он проник в результате арабских завоеваний. В конце VII века арабы захватили Дербент, который стал называться «Баб аль-Джихад» – «Ворота борьбы за веру». Затем арабские войска завоевали внутренние районы Дагестана. К концу VIII века в Дагестане были построены мечети. В XI – XII веках ислам принимают народы юга Дагестана, а к XIV веку ислам распространяется среди наиболее многочисленного дагестанского народа – аварцев. В XVI – XVIII веках возникают очаги мусульманской образованности – медресе, где обучали детей арабской грамоте, при крупных мечетях создаются библиотеки, что способствовало формированию в Дагестане традиций классического исламского образования и появлению влиятельного слоя мусульманского духовенства – эфенди. Среди них выделилась группа алимов (улемов) – мусульманских ученых, знатоков Корана и шарита, владеющих арабским, персидским, турецкими языками. Алимы также считались хранителями традиций и нравственных норм. На основе арабской графики алимы создали систему письма для некоторых языков Дагестана.
На Западный Кавказ ислам начал проникать в XIII – XIV веках из Золотой Орды. С Золотой Ордой тесно связаны ногайцы, которые являлись тюрским мусульманским народом, с XIII века кочевавшим в степях Прикавказья. В наши дни ногайцы проживают в Дагестане, Ставропосльском крае, Карачаево-Черкесской и Чеченской республиках. В Чечне ислам распространился в XV – XVI веках. В XVI – XVII веках ислам распространяется в Кабарде, затем в Осетии. После захвата крепостей в Крыму и на Черноморском побережье, а также стремясь подчинить кавказских горцев, султаны Османской империи начали усиленно распространять среди них ислам. В начале XVIII века османский султан Марад IV приказал крымским ханам, которые были вассалами Османской империи, распространять ислам среди адыгов – черкесов. Те адыгские роды, которые отказывались принять ислам, уходили в казачьи станицы по рекам Тереку и Кубани, став частью кубанского и терского казачеств. Муллами у адыгов долгое время были выходцы из Турции и Крыма, которых в должности утверждал константинопольский муфтий.
В середине XVIII века ислам распространился среди балкарцев и в Карачае. К концу XVIII века положение ислама на Западном Кавказе стало довольно прочным. Однако в отличие от Дагестана и Чечни, где распространился шафиитский мазхаб ислама, на Западном Кавказе распространился мазхаб ханифитский.
Временем наивысшего расцвета ислама и мусульманской культуры в России явилась вторая половина XIX – начала ХХ века. В Казанской, Симбирской, Пензенской, Нижегородской, Самарской, Саратовской, Оренбурской, Уфимской, Вятской губерниях, то есть в местах наибольшей концентрации мусульманского населения, у мусульман одна мечеть и один мулла приходились на 150 человек. В то же время у православных один священник приходился на 1,5 тыс. человек, а у крещеных инородцев – на 15 тыс. человек. У мусульман одна школа приходилась на 100 человек, а у православных – на 1,5 – 3 тысячи человек. В Уфимской губернии, где по перепеси населения 1897 года из 2220,6 тысяч жителей 1181,9 тысяч составляли мусульмане, имелось 1555 мечетей, 4665 мулл и 6220 медресе и мактабов. В то же время православных церквей насчитывалось всего 349, священников – 360, церковно-приходских школ – 231.
Практически каждый мулла, который выбирался членами прихода из своей среды, являлся учителем грамоты для детей своих прихожан даже в тех местах, где не было мактабов (элементарная школа) и медресе. Он находился в постоянном общении со своими прихожанами, выступая также в роли судьи и лекаря. Русский православный священник назначался на приход помимо участия прихожан. На рубеже XIX – ХХ веков усиливается мусульманское влияние на многие нерусские народы – чувашей, черемисов и др. Расцвету ислама и мусульманской культуры способствовало и то, что мусульманские народы России вследствие их роли торговых посредников между Центральной Россией и Средней Азией первыми из всего мусульманского мира вступили в стадию капиталистического развития.
Ислам сыграл роль мощного мобилизующего фактора в формировании национального капитала. Свою торгово-промышленную деятельность мусульманские купцы и предприниматели рассматривали как служение Богу через служение мусульманской общине – умме посредством повышения ее благосостояния. Поэтому они выделяли значительные средства на строительство мечетей и медресе, религиозную и просветительскую деятельность, благотворительность. Особенно прославились своей благотворительной деятельностью купеческие фамилии Юнусовых, Расулевых, Танеевых, Ерзиных, Агеевых, Асадуллаевых, Исхаковых и других. Так, в начале ХХ века «король нефти и керосина» Ага Шамси Асадуллаев на свои средства в Москве в Малом Татарском переулке построил многоэтажное здание мусульманского культурного центра с медресе, библиотекой, лекционными и концертными залами. Благодаря принципам мусульманской благотворительности (закят, садака), являющейся одной из пяти столпов ислама, степень солидарности между трудом и капиталом в мусульманской среде была значительно выше, чем в православной.
Видные представители обновленческого течения мусульманской мысли ориентировались на включение мусульманских народов в сферу капиталистического развития и обновление ислама достижениями европейской цивилизации, поэтому не случайно основной сферой деятельности мусульманских просветителей в России стали мусульманское образование и печать. С помощью реформирования системы обучения мусульманской интеллектуальной элиты должен был осуществиться синтез исламских ценностей с достижениями европейской культуры. Практически при каждой мечети уже имелась элементарная школа (мактаб). При соборных мечетях действовали школы повышенного типа – медресе, куда специально приглашали учителей. Реформы Екатерины II в вероисповедании создали условия для открытия медресе высшего типа, в которых готовили священнослужителей, муэдзинов, мударрисов (учителей). В медресе начинают преподаваться общеобразовательные предметы, русский и иностранные языки. В конце 1800 года был издан указ императора Павла I о разрешении печатать мусульманские религиозные книги. Вскоре в казанской Восточной типографии были напечатаны первые экземпляры Корана. В середине XIX века общий ежегодный тираж изданий мусульманских типографий превысил 100 тыc. экземпляров. В 1857 году был издан первый мусульманский календарь. К началу XX века начали выходить мусульманские газеты и журналы. Из выпускников медресе, читателей и корреспондентов мусульманской периодики начал формироваться слой слой мусульманской интеллигенции, который стал основой мусульманского общественного движения как умеренного, так и радикального толков. В начале ХХ века география учебных заведений, где получали образование российские мусульмане значительно расширилась. К таким традиционным центрам исламской учености, как Каир, Стамбул, Бухара, Бахчисарай и Казань, прибавились Париж, Женева, Лондон, не говоря уже об университетах Санкт-Петербурга и Москвы.
В декабре 1917 года мусульманскому съезду в Петрограде была передана одна из крупнейших святынь мусульманского мира – «Коран Османа» («Мусхаф Усмани»). Это была рукопись Корана, которая принадлежала халифу Осману, третьему праведному халифу, правившему в VII веке. До 1867 года эта рукопись хранилась в мечети Хаджи-Ахрар в Самарканде, которая попала туда после взятия Багдада войском Тимура в конце XIII века. После того, как Самарканд был взят русскими войсками, рукопись Корана была взята в качестве трофея и затем передана в Императорскую библиотеку Санкт-Петербурга. После возвращения мусульманам, «Коран Османа» несколько лет (с 1918 по 1924 год) хранился в Уфе в духовном управлении, затем был возвращен в Самарканд в ту же мечеть. С 1941 года он находился в Музее истории народов Узбекистана в Ташкенте. Весной 1989 года по распоряжению правительства Узбекистана «Коран Османа» был передан четвертому курултаю мусульман Средней Азии.
Во времена Советской власти отношение к верующим-мусульманам по своей сути не отличались от отношения к другим вероисповеданиям. Великая Отечественная война с ее невзгодами и переживаниями в некоторой мере способствовала росту религиозных настроений в некоторых кругах населения. Это сказалось и на состоянии религиозности настроений среди верующих мусульман. Во время войны и в первые годы после нее выросло количество действующих мечетей, выросло также численность учащихся религиозных школ. В соответствии с советским законодательством было организовано в Ташкенте Духовное управление мусульман Средней Азии и Казахстана. Теперь, кроме него, имеются еще три Духовных управления мусульман, расположенных в Уфе, Баку и Махачкале.
В настоящее время ислам является второй по численности последователей конфессией России после православного христианства.