С начала 1941 г. и до начала войны — нарком ВМФ и ГМШ отправляли донесения И.В. Сталину и в Генеральный штаб с информацией о подготовке немцев к войне, поступавшей из различных источников.
5 июня — издал приказ, обязывающий «об обнаруженных недочетах фактической оперативной готовности корабля, части, соединения, флота доносить мне как о чрезвычайном происшествии, выявлять лиц, проводивших последнюю проверку, и строго наказывать за случаи притупления внимания и очковтирательские заключения».
13 июня — доложил И.В. Сталину факты, о которых ранее докладывал в Генеральный Штаб и наркомат обороны, о выводе всех немецких кораблей из советских портов и просил разрешить вывести все советские корабли из немецких портов, чем вызвал его крайнее неудовольствие. По этому случаю секретарь И.В. Сталина А.Н. Поскребышев зафиксировал в телефонограмме: «Сегодня (14 июня. — Р.К.) Сталина И.В. в Кремле посетил адмирал Н.Г. Кузнецов. В докладе он упомянул, предоставив даже статистические данные, о выводе всех немецких кораблей из советских портов и просил разрешения вывести все советские корабли из немецких. «Хозяин» выпроводил его вон. Неужели адмирал не читал сегодняшнее сообщение ТАСС, опровергающее провокационные слухи о нападении Германии на Советский Союз? Всюду провокации… Все наши враги и ложные друзья пытаются стравить нас с Гитлером в своих интересах…»
14 июня — в газетах опубликовано сообщение ТАСС, опровергающее слухи о нападении Германии на СССР
Приказал всем флотам перейти на боевую готовность № 2, базам и соединениям — рассредоточить силы и усилить наблюдение за водой и воздухом, запретить увольнение личного состава из частей и с кораблей. Корабли приняли необходимые запасы, привели в порядок материальную часть, было установлено определенное дежурство. Весь личный состав остался на кораблях. Была усилена политработа среди краснофлотцев в духе постоянной готовности встретить и отразить нападение врага.
Июнь — направил начальника ГМШ ВМФ И.С.Исакова на ЧФ для участия в военных учениях, проводившихся с целью отработки высадки десанта и его отражения.
14 июня — в соответствии с решением ГВС ВМФ от 6 июня (председатель Совета — нарком Н.Г. Кузнецов) издан приказ по НК ВМФ о создании комиссии по регулированию и приемке размагничивающего устройства линкора «Марат». Приказ предписывал произвести с 20 по 26 июня измерения магнитного поля корабля и его прохождение над индукционными минами, а в III квартале 1941 г. провести контрольные стрельбы неконтактными торпедами. В комиссию вошли от НТК ВМФ: Б.В. Хорошкин (председатель), Б.Е. Годзевич (заместитель), И.В. Климов, от НИМТИ ВМФ — П.И. Смирнов, от ЦКБ НКСП — B.C. Евдокимов, от ЛФТИ — А.П. Александров, от ЦНИИ НКСП — И.И. Дехтяр. К работе комиссии были привлечены сотрудники ЛФТИ П.Г. Степанов, В.Р. Регель, Г.Я. Щепкин, К.К. Щербо, Д.В. Филиппов, от ЦНИИНКСП — И.М. Фомин. Таким образом, решения ГВС ВМФ создавали к началу войны предпосылки к обеспечению защиты кораблей от магнитных мин противника. (О конкретных мерах см.: Ткаченко Б.А. История размагничивания кораблей советского Военно-морского флота. Л.: Наука, 1981. С. 42–47.)
20 июня — ГВС ВМФ (председатель Н.Г. Кузнецов) принял решение об ускорении строительства военно-морских баз, особенно для Северного флота, об усилении противовоздушной обороны флота, разведки и дозорной службы, об увеличении состава Северного флота.
До начала войны — разработаны и введены в действие на всех флотах «Наставления» по организации боевой деятельности Военно-Воздушных Сил, подводных лодок и различных классов надводных кораблей.
21 июня (в 21.50) — связался с флотами, узнал обстановку и приказал (по телефону) действовать, без промедления при получении приказа о переходе на высшую боевую готовность.
21 июня (в 23.00) — вызван к наркому обороны и проинформирован о возможном нападении в эту ночь фашистов. Приказал в 23.50 телеграммой флотам немедленно перейти на оперативную готовность № 1 и еще ранее — устно по телефону — перейти на готовность № 1, не дожидаясь телеграммы. Кроме приказа по телефону и телеграммой, отправил вторую телеграмму для военных советов флотов следующего содержания: «В течение 22–23 июня возможно внезапное нападение немцев. Нападение немцев может начаться с провокационных действий. Наша задача не поддаваться ни на какие провокационные действия, могущие вызвать крупные осложнения. Одновременно флотам и флотилиям быть в полной боевой готовности встретить возможный внезапный удар немцев или их союзников. Приказываю перейти на оперативную готовность № 1. Тщательно маскировать повышение боевой готовности. Ведение разведки в чужих территориальных водах категорически запрещаю. Никаких других мероприятий без особого распоряжения не проводить. Кузнецов». Таким образом, высшая боевая готовность № 1 была объявлена на флоте в 23 ч 50 мин 21 июня.
Директива о переходе на повышенную боевую готовность № ЗН/87 в 23 ч 50 мин 21 июня. Им изданы:
Директива о возможности внезапного нападения немцев № ЗН/88 в 01 ч 12 мин 22 июня.
Директива о принятии мер предосторожности в связи с угрозой нападения фашистской Германии, б/н.
22 июня (в 03.07) — вражеские самолеты совершили налеты на главную базу в Севастополе и на Измаил с целью заблокировать ЧФ. Сбросили на входной фарватер базы и в Северной бухте электромагнитные мины. Их встретил огонь зенитной артиллерии. В полной боевой готовности встретили шквальный огонь с румынской стороны корабли Дунайской флотилии. Воздушным атакам подверглись также Лиепайская и Рижская ВМБ КБФ. Магнитные мины были сброшены с самолетов в районе Кронштадта. Были сброшены бомбы в районе главной базы СФ — Полярного. Однако нападение фашистской Германии не застало ВМФ врасплох. Флот не потерял ни одного корабля. Флоты и флотилии начали действовать согласно предвоенным планам обороны.
22 июня (в 03.15) — нарком ВМФ получил первое телефонное сообщение от командующего ЧФ Октябрьского Ф.С. о том, что на Севастополь совершен налет.
После звонка из Севастополя — пытался по телефону доложить обстановку И.В.Сталину, которого не нашел. Разговаривал с Г.М. Маленковым. Последний перепроверил сведения Кузнецова, звонил в Севастополь.
22 июня (до 05.17) — под свою ответственность нарком ВМФ приказал передать флотам официальное извещение, что Германия начала нападение на наши базы и порты, которое следует отражать силой оружия.