В ходе войны народный комиссар ВМФ неоднократно проявлял творческую инициативу в использовании флотов и флотилий, докладывая свои предложения Ставке Верховного Главнокомандования.
Так в августе 1941 г. Н.Г. Кузнецов предложил Сталину нанести бомбовые удары по Берлину флотской авиацией с острова Эзель. Сталин дал согласие. Эти бомбежки по Берлину в августе 1941 г. имели большое политическое и военное значение, в том числе и для советского народа. Кузнецов участвовал в разработке этой операции и лично нес ответственность перед Ставкой за ее выполнение.
В октябре 1941 г. с Балтики меня перевели служить в Оперативное управление Главного штаба ВМФ, которое возглавлял одаренный моряк, прошедший школу войны в Испании, имеющий большой опыт работы в штабах, — Владимир Антонович Алафузов. В то время он замещал начальника главного штаба ВМФ адмирала И.С. Исакова, так как последний в начале войны был назначен заместителем главкома Северо-Западного направления — для координации действий Краснознаменного Балтийского флота с сухопутными войсками. А в 1942 г., после поездки на Дальний Восток, адмирал И.С. Исаков был командирован Ставкой на Кавказ, где потерял ногу, после чего длительное время лечился. В этот период за него в главном штабе ВМФ работал Алафузов.
Знакомясь с работой Оперативного управления ГШ ВМФ, я понял, что с началом войны народный комиссар ВМФ Н.Г. Кузнецов установил четкую систему работы Главного штаба и центральных управлений Военно-Морского Флота и их взаимодействие. Нацелил их на обеспечение выполнения задач, поставленных флотам и флотилиям, на осуществление за этим контроля.
Народный комиссар ВМФ постоянно был связан с флотами и флотилиями.
Мне довелось наблюдать работу Н.Г. Кузнецова на командном пункте главкома при оперативных докладах, рассмотрении планов операций и действий сил флотов, флотилий. Могу сказать, что прежде всего меня поражало глубокое знание Кузнецовым обстановки на флотах и флотилиях, фронтах и в стране, состояния сил и средств флотов и флотилий, планируемых действий, результатов их выполнения, а также о допущенных недостатках и о принятых мерах по их устранению.
Народный комиссар ВМФ стремился быть чаще на флотах и флотилиях, но его поездки осуществлялись только с разрешения Ставки. Были случаи, когда Ставка задерживала выезд. Часто бывал Кузнецов с поручениями Ставки и в Ленинграде в период его блокады. На местах он внимательно выслушивал доклады командующих и других командиров, давал четкие конкретные указания и строго спрашивал за недостатки и промахи. Посещал корабли, части, аэродромы. Все проходило в спокойной, доброжелательной обстановке.
Н.Г. Кузнецов имел постоянную тесную связь и взаимопонимание с начальником Генерального штаба, особенно с Маршалами Советского Союза Б.М. Шапошниковым и A.M. Василевским, с которыми его объединяли также дружеские отношения.
С первых дней войны народный комиссар, Главный морской штаб сосредоточили силы на одном из основных направлений организаторской работы — взаимодействии Военно-Морского Флота с сухопутными войсками. Н.Г. Кузнецов подходил к этому вопросу творчески, инициативно, целеустремленно, отрабатывая формы и методы четкого взаимодействия сил армии и флота.
Несмотря на то, что основной ареной вооруженной борьбы Советской Армии был сухопутный театр военных действий, флот выполнял ряд важнейших оперативно-стратегических задач, содействуя сухопутным войскам в ведении оборонительных и наступательных операций на приморских направлениях. Проводил самостоятельные операции по нарушению морских сообщений врага и защите своих коммуникаций. Военно-Морские Силы приняли самое активное участие в обороне побережья Балтики, Черного и Азовского морей, Баренцева моря, в разгроме фашистских войск под Москвой, Ленинградом и Сталинградом, в Заполярье, на Кавказе и Прибалтике, а также в завершающих сражениях в Европе и под Берлином. И главком ВМС Н.Г. Кузнецов, руководя ими, бывал на всех театрах военных действий. Там, где возникала необходимость в нем.
Одной из характерных особенностей действий флота была длительная и упорная оборона военно-морских баз совместно с сухопутными войсками. Фашистское командование рассчитывало захватить крупные советские военно-морские базы с суши и тем самым обречь на неминуемую гибель Балтийский, Черноморский и Северный флоты Поэтому одной из важнейших задач ВМФ была оборона основных военно-морских баз. Как известно, в первые месяцы войны три наши главные базы — Таллин, Севастополь, Полярный — оказались под угрозой захвата немецко-фашистскими войсками, и их защита имела важное стратегическое значение.
Оборона Таллина, Моонзундских островов, полуострова Ханко проходила в весьма невыгодных для нас условиях. До 26 августа 1941 г. моряки Балтики и бойцы 10-го стрелкового корпуса, нанеся огромный урон противнику, сделали все возможное для обороны главной военно-морской базы Балтийского флота Таллина и отвлекли крупные силы врага от главной цели — Ленинграда. Когда же силы и возможности при обороне Таллина были исчерпаны, настало время срочной эвакуации базы, вывода главных корабельных сил флота в Кронштадт и Ленинград. Однако главнокомандование Северо-Западного направления — Ворошилов и Исаков — с такой просьбой к Сталину обратиться не решились.
Эту непростую задачу взял на себя нарком ВМФ Кузнецов с присущей ему решительностью и глубоким знанием обстановки. Именно решительные действия народного комиссара ВМФ позволили сохранить боевое ядро Балтийского флота, которое сыграло в будущем важную роль в обороне Ленинграда. Единственно правильным было и обоснование Н.Г. Кузнецовым решения эвакуировать войска гарнизона Таллина морским путем. Анализ действий балтийцев, ошибок, допущенных при этом, позволил их не повторить при эвакуации войск из Одессы.
Одна из ярчайших, героических страниц в истории Великой Отечественной войны — оборона Севастополя. Народный комиссар ВМФ постоянно уделял внимание обороне города и оказывал всевозможную помощь.
Сейчас, спустя годы, можно увидеть, понять, оценить огромную выдержку и чувство ответственности Н.Г. Кузнецова за порученное дело, тщательность отработки вопросов, связанных с ведением боевых действий Военно-Морского Флота.
Оценивая Н.Г. Кузнецова как народного комиссара ВМФ, необходимо отметить его деятельность по проведению десантных операций. В ходе войны наш флот совместно с сухопутными войсками осуществил высадку нескольких десятков оперативных и тактических десантов, что было очень важно для сухопутных армий, фланги которых упирались в море. Наиболее крупные десанты наш флот высадил во время войны в Керченско-Феодосийской (1941), Новороссийской (1943) операциях, на побережье Керченского полуострова (1943) и на острова Моонзундского архипелага (1944). Противнику же на протяжении всей войны не удалось высадить ни одного десанта на приморских флангах наших войск.