В первые месяцы 1933 года СС, как, впрочем, и другие нацистские организации, росли с чрезвычайной скоростью. Соответственно возникали новые командные посты, присваивались новые звания — карьеры делались стремительно: отставные унтер-офицеры за несколько лет проходили все ступени карьерной лестницы и получали генеральские чины. Энергичный Беккер — профессиональный военный, да еще и совсем недавно оставивший службу в рейхсвере и не успевший растерять приобретенных там навыков — оказался очень к месту и вскоре был назначен адъютантом дислоцированного в Грейфсвальде 74-го штандарта СС в звании обершарфюрера СС (что примерно соответствовало званию фельдфебеля в рейхсвере). Беккер успешно прививал дисциплину своим подчиненным, до изнурения заставлял их проходить различные тренировки. Руководство оценило его усердие, и уже в марте 1934 года его произвели в гауптшарфюреры СС (аналог обер-фельдфебеля рейхсвера). Наконец, 17 июня 1934 года Гельмут Беккер получил первое офицерское звание — унтерштурмфюрера СС. Всего за год и четыре месяца службы в СС он достиг того, на что даже 12 лет беспорочной службы в рейхсвере не давали ни малейшей надежды.
1934 год стал временем рождения частей усиления СС (SS-Verfügungstruppe).[66] Сюда Хауссер привлек наиболее подготовленных членов СС, отдавая предпочтение отставным офицерам и унтер-офицерам. Если рядовым составом два штандарта — «Дойчланд» и «Германия» — укомплектовать было достаточно просто: от желающих не было отбоя, то с командными кадрами в СС были существенные проблемы. Поэтому кандидатура Беккера пришлась как нельзя лучше, а Гельмут немедленно ответил на предложение Хауссера согласием — ведь это позволяло ему фактически вернуться на столь любимую им военную службу, причем уже офицером. Таким образом состоялось назначение унтерштурмфюрера СС Гельмута Беккера военным инструктором и адъютантом 2-го штурмбанна 3-го штандарта СС (позже он стал известен как штандарт «Германия»), тем более что дислоцировался он все в том же Грейфсвальде. Уже в феврале 1935 года Беккер получил очередное звание оберштурмфюрера СС.
Беккер был на своем месте, поэтому с первого взгляда кажется довольно странным то, что через год — 1935 году — он вдруг перешел в 1-й штандарт соединений «Мертвая голова», который носил название «Верхняя Бавария» и дислоцировался близ концентрационного лагеря Дахау. Однако здесь надо учитывать и тот факт, что инспектору соединений СС «Мертвая голова» Теодору Эйке также остро требовались специалисты по военной подготовке. И хотя «Мертвая голова» и части усиления и были самостоятельными, все же они были частью единой организации — СС и перевод вполне мог состояться и по приказу сверху: для усиления «Мертвой головы». Кроме того, перспективы для карьеры у Эйке были на тот момент значительно шире. Как бы то ни было Беккер согласие дал и приступил к исполнению своих обязанностей. Надо отметить, что жесткие методы, которыми Беккер превращал охранников концлагерей в идеальных солдат, сразу же получили одобрение неврастеничного Эйке и он стал оказывать Беккеру протекцию. И позже также Эйке постоянно продвигал Беккера, так как в нем инспектор концлагерей видел идеального солдата — отчаянно храброго и жесткого.
Несмотря на то что Беккер состоял в соединениях «Мертвая голова», основной задачей которых была охрана концентрационных лагерей — для этого они собственно и создавались, — сам он к концлагерям отношения не имел. Изначально задачей Беккера была организация подготовки личного состава. Поэтому он и был назначен командиром 9-го штурма штандарта «Верхняя Бавария» (еще его часть иногда называли ротой обучения пополнений — Rekrutenausbildungs-Kompanie), в задачу которого входила подготовка пополнения для всего штандарта, кроме того, ему была поручена организация системы физической подготовки всего штандарта. На Беккера также легла задача фактического создания и затем руководства курсами младшего командного состава (Unterführer-Lehrgang). Несмотря на то что в рейхсвере он был только унтер-офицером и опыта командования воинскими частями не имел, Беккеру удалось в сжатые сроки наладить как подготовку унтер-офицеров, так и значительно улучшить физическую подготовку подчиненных — именно эту цель поставил перед ним Эйке. Высокие результаты были оценены по достоинству, в 1936 году Беккер был произведен в гауптштурмфюреры СС (что соответствовало капитану в вермахте) и назначен командиром 1-го штурмбанна своего штандарта. В этом же году — 9 ноября — он получил еще одно повышение и стал штурмбаннфюрером СС, а 30 января 1938 года стал оберштурмбаннфюрером. В вермахте, даже после того как он одним росчерком пера был увеличен в разы, служебный рост даже отдаленно не походил на то, что творилось в СС.
Беккер был включен в состав подразделения штандарта, которое было использовано в составе немецких войск в ходе операций по аншлюсу Австрии, занятию Судетской области и оккупации Чехии. Его штурмбанн был придан сухопутным войскам как 1-й батальон СС Судетского добровольческого корпуса (Sudetendeutschen Freikorps). Это можно было назвать в определенной степени приобретением военного опыта, хотя и боевых столкновений эсэсовцы и не имели (как, впрочем, и части вермахта). В то же время Беккер и его подчиненные получили опыт марш-бросков в обстановке, приближенной к боевой. Все это оказало большое влияние на боеспособность штандарта.
С началом Польской кампании штандарт «Верхняя Бавария», в который входил штурмбанн Беккера, следовал за регулярными частями вермахта, проводя «зачистку» захваченной территории. Штандарт действовал в зоне ответственности 10-й армии генерала Вальтера фон Рейхенау, то есть в Верхней Силезии. Сведений, принимал ли Беккер участие в этот период в репрессиях против гражданского населения, нет, однако штандарты «Мертвая голова» хотя и не входили в состав эйнзатцгрупп полиции безопасности и СД, однако задачей штандатов было также оказание им помощи. В этом же районе действовала базировавшаяся в Ченстохове эйнзатцгруппа II оберштурмбаннфюрера СС Эмануэля Шэфера и 2-я полицейская группа, которой командовал однофамилец Беккера — генерал-майор полиции Герберт Беккер.
Как уже говорилось в очерке о Теодоре Эйке, в середине октября 1939 года в учебном лагере СС в Дахау начала формироваться дивизия СС «Мертвая голова». Штандарт «Верхняя Бавария» полностью вошел в состав дивизии, и на его основе был сформирован 1-й пехотный полк СС «Мертвая голова» (SS-Totenkopf-Infanterie Regiment 1). Беккер сохранил свой прежний пост и стал таким образом командиром 1-го батальона полка. Его батальон был одним из лучших и наиболее подготовленных в дивизии. Об этом говорит хотя бы тот факт, что из командиров рот батальона только гауптштурмфюрер СС Лёнхольдт (командир 2-й роты) не получил за время войны Рыцарского креста или Германского креста в золоте. Гауптштурмфюрер СС Отто Вильгельм Крон (командир 4-й роты) стал кавалером Рыцарского креста, гауптштурмфюрер СС Адольф Куртц (командир 1-й роты) — Германского креста в золоте, а гауптштурмфюрер СС Иоахим Шубах (командир 3-й роты) получил обе эти высокие награды. Это был лучший показатель среди батальонов полка.
