Раймунд, спасшийся как бы чудом от неминуемой гибели, не стал терять даром времени и отвоевал часть своих земель. Тринадцатилетний Людовик IX был коронован в Реймсе, а регентство было предоставлено его матери Бланш Кастильской.
Вступивший 19 марта 1227 г.на папский престол Григорий IX принял под свое покровительство регентшу и ее сына, они обязались вести войну против ереси. На соборе, бывшем в Нарбонне Великим Постом 1227 г., были отлучены от Церкви все, не сохранившие присягу на верность Людовику: народ всюду, где можно было сделать это без большого риска, вернулся к Раймунду. Приказывая епископам строго разыскивать еретиков и предлагая светским властям наказывать их, тот же собор отметил, что даже и в занятых французами землях преследование еретиков значительно ослабло.
В 1227 г. война тянулась без решительных результатов. Раймунд не мог помешать крестоносцам опустошить всю страну вплоть до стен Тулузы. У регентши Бланш было много причин желать заключения мира из-за осложнений отношений с Англией и некоторыми из могущественных баронов Франции. Раймунд также не переставал просить мира. Брак единственной дочери-наследницы Раймунда, Иоанны, с одним из младших братьев Людовика IX, с передачей им и их наследникам владений графа, мог мирным путем принести те же политические выгоды, как и крестовый поход. От искренне благочестивого Раймунда, который много раз показывал свою готовность применить суровые меры против еретиков, можно было ожидать удовлетворительного разрешения и религиозных вопросов.
Григорий IX был рад положить конец войне, начатой Иннокентием двадцать лет тому назад. Уже в марте 1228 г. он убеждал Людовика IX заключить мир, следуя советам легата. В основу переговоров было положено сватовство; письмом от 23 июня папа уполномочивает легата Романо устранить препятствие к браку, заключавшееся в кровном родстве сторон, если брак Иоанны с одним из братьев Людовика даст стране мир. Другое послание папы от 21 октября, призывавшее прелатов снова проповедовать крестовый поход против альбигойцев, указывает на то, что надо было оказать на Раймунда давление. Французские войска начали страшно опустошать его владения. Наконец, в декабре 1228 г. Раймунд уполномочил аббата Грансельва принять все предложения посредника – Тибо де Шампань. В Мо в присутствии консулов Тулузы предварительные условия были подписаны в январе 1229 г. Великий четверг 12 апреля 1229 г. был днем окончания этой долгой войны.
Раймунд дал присягу преследовать еретиков, их единомышленников и тех, кто дает им пристанище; он не должен щадить никого. Все должны быть наказаны в самое короткое время, а для обнаружения еретиков должна быть основана инквизиция. На нужды этого судилища Раймунд соглашался уплачивать по две марки за каждого, кто будет схвачен в течение первых двух лет, и по одной марке по истечении этого срока. В отношении других еретиков он обещал всецело подчиниться всем приказаниям легата или папы. Его бальи, или местные судьи, должны были быть добрыми католиками; он будет защищать Церковь, всех ее членов и все ее привилегии; он конфискует по решениям духовных судов имущество остающихся отлученными от Церкви в течение года; он возвратит все имения, отнятые у церквей с самого начала смут, и уплатит десять тысяч серебряных марок за разграбленные имущества частных лиц; он будет требовать правильной уплаты десятины; в виде особого штрафа он должен внести пять тысяч марок в пять монастырей, которые ему будут указаны, шесть тысяч марок на укрепление замков, которые король займет в обеспечение интересов Церкви, от трех до четырех тысяч марок на содержание в Тулузе в течение десяти лет двух магистров богословия, двух докторов канонического права, шести учителей грамматики и свободных искусств. Его покаяние будет состоять в том, что тотчас же после отпущения грехов, не позднее, как через два года, он отправится на пять лет в крестовый поход в Палестину. Несмотря на неоднократные напоминания, Раймунд не исполнил этой епитимьи до своей смерти в 1247 г.
Народ должен был принести присягу, повторяемую каждые пять лет, в силу которой каждый обязывался всеми средствами преследовать еретиков, их сообщников и всех, кто будет давать им приют; кроме того, все должны оказывать содействие Церкви и королю, если будет начато преследование ереси.
Когда были обеспечены интересы Церкви и религии, брак Иоанны с одним из братьев короля был признан проявлением особой благосклонности к Раймунду. Его признали лишенным всех владений, но король милостиво давал ему область старой Тулузской епархии с тем, чтобы после его смерти она перешла к его дочери и к зятю; таким путем это наследство было упрочено за королевским домом. Раймунду были также даны Ажан, Руэрг, Керси (за исключением Кагора) и часть Альбигойи с тем, чтобы эти земли после его смерти перешли к его дочери; обширные пространства между герцогством Нарбоннским и графствами Велэ, Жеводан, Вивье и Лодев король оставлял себе, Маркизат Провансский (владение Империи по ту сторону Роны) был отдан Церкви. Раймунд потерял две трети своих владений. Он должен был разрушить укрепления Тулузы и тридцати других замков без права когда-либо возводить на их месте новые; он должен был передать королю восемь других укрепленных замков и ежегодно в течение пяти лет выдавать ему на их содержание по полторы тысячи марок; он должен был принять энергичные меры против своих упорствующих вассалов. Была объявлена всеобщая амнистия и были восстановлены в своих правах лишенные своего звания рыцари, за исключением еретиков. Раймунд обязывался обеспечить общественное спокойствие и изгнать навсегда грабителей с больших дорог. Все вассалы Раймунда и весь народ его должны были скрепить эти условия своею присягой и обязаться свято выполнять их. Если в течение сорока дней после объявления он не исполнит какого-либо из принятых им обязательств, то все предоставленные ему земли переходят к королю, его подданные освобождаются от всяких обязательств по отношению к нему, а сам он, как и прежде, подвергается отлучению от Церкви.
Парижский договор оправдал возлагавшиеся на него надежды. Иоанне Тулузской и предназначенному ей супругу, брату Людовика Альфонсу, было в 1229 г. по девять лет. Свадьба их состоялась в 1237 г., и когда в 1249 г. умер Раймунд, они унаследовали все его земли. В 1271 г. они умерли один за другим, не оставив после себя наследников; тогда Филипп III завладел не только графством Тулузским, но и всем югом Франции.
В течение двадцати лет несчастное население Лангедока, остававшееся верным Тулузскому дому, не знало ни минуты покоя. Только чудом во время последнего крестового похода население избавилось от полного истребления, а будущее его рисовалось в самых мрачных красках, так как римская Церковь могла наводнить юг новыми полчищами мародеров под сенью креста.
Борьба веротерпимости против тенденции преследования была поднята и проиграна. После такого красноречивого предупреждения, как падение двух Раймундов, нечего было опасаться, что явятся новые владетельные князья, которые проявят терпимость к еретикам. Церковь, призвав на помощь себе государство, поторопилась извлечь выгоду из общей победы, и вскоре среди тех, кто так долго мешал ей, открыла свои действия инквизиция.
Быстрое развитие религиозной нетерпимости уже ясно видно в угрозах Апокалипсиса, направленных против вероотступников и еретиков Семи Церквей. Богословие выдвинуло вопросы, на которые у евангелистов не дано ответа. В пылу споров богословы перестали считать христианами тех, кто расходился с ними в вопросах обрядности и учения или в некоторых догматических тонкостях. Люди, занимавшие высокое положение в Церкви, могли давать силу закона своим мнениям; менее же сильные были объявлены отпавшими от католичества, и деление между верными и еретиками становилось все заметнее.
Самым опасным мятежником являлся теоретик, высказывавший сомнения относительно догматической правильности мнений лица высшего, чем он, в церковной иерархии; и если ему удавалось собрать около себя учеников, то он становился главой еретического направления. Там, где еретиков было достаточно много, чтобы образовать свою общину, они не обращали никакого внимания на то, что их отсекали от Церкви. Результатом было то, что этих сектантов стали преследовать с большей жестокостью, чем самых закоренелых преступников. Уже одно то, что они отказались склониться перед признанным авторитетом, являлось тяжким преступлением. Торжество нетерпимости стало неизбежным, когда христианство сделалось государственной религией. Ереси уничтожались без всякого снисхождения, включительно до костра, который был впервые принят на Константинопольском соборе 1143 г., при патриархе Михаиле Оксисте (1143-1146), как мера наказания для богомилов. Нередко инициатива преследования исходила от светской власти.