Эскадра 3 сентября вернулась в Кронштадт, на корабли погрузили снятые перед уходом в Свеаборг пушки. Корабль «Гавриил» был исключен из состава флота и сдан в порт по ветхости, а «Архистратиг Михаил» из-за старости обращен в транспорт. Вместо них в состав эскадры вошли «Чесма», «Мироносец» и только что построенный «Юпитер» (капитан 1-го ранга П.А. Бойль).
Затем часть эскадры была использована для перевозки в Свеаборг воспитанников различных учебных заведений, спешно переводимых, по постановлению Комитета министров, сильно опасавшегося за судьбу столицы, из Петербурга в более безопасные места. В октябре на кораблях «Борей» и «Северная звезда» из Кронштадта в Свеаборг были перевезены кадеты Морского корпуса. Фрегат «Полукс» (капитан-лейтенант И.Н. Бутаков), шлюп «Кола» (лейтенант Е.И. Вестингаузен) и шхуна «Стрела» (капитан-лейтенант Ф.И. фон Платер) доставили из Кронштадта в Свеаборг учеников и преподавателей Штурманского училища. В Роченсальм были переведены учебные суда Морского корпуса, а в Выборг — императорские яхты.
В октябре бриг «Коммерстракс», катер «Жемчуг» и тендер «Навигатор» конвоировали транспортные суда, на которых перевозился российско-германский легион (1600 человек) из Ревеля в порты Финляндии.
Архангельская эскадра в составе восьми кораблей: «Норд-Адлер» (капитан 1-го ранга Д. Гамельтон, флаг вице-адмирала Р.В. Кроуна), «Не-тронь-меня» (капитан 1-го ранга Ф.К Митьков), «Победоносец» (капитан 2-го ранга Ф.А. Дзивович), «Принц Густав» (капитан-командор С.Г. Скотт), «Святослав» (капитан 1 -го ранга И.Г. Степанов), «Саратов» (капитан 2-го ранга Ф.И. Языков), «Всеволод» (капитан 2-го ранга П.Н. Нордштейн), «Три Иерарха» (капитан 1-го ранга В.И. Терновский) была подготовлена к переходу на Балтику. 11 августа она вышла в море. Экипажи кораблей были укомплектованы в основном рекрутами, еще ни разу не бывавшими в море. В океане на широте Шетландских островов суда были застигнуты свирепым четырехдневным штормом Большинство кораблей получили повреждения рангоута и рулей, сильную течь, особенно сильно пострадал флагманский «Норд-Адлер», который потерял грот- и фор-стеньги. 18 сентября 7 кораблей зашли в Готенбург. Только благодаря отличному знанию морского дела и редкой энергии вице-адмирала Р.В. Кроуна, опытности и распорядительности командиров и офицеров корабли сравнительно благополучно дошли до Готенбурга, где полторы недели занимались исправлением повреждений. От дурной пищи, недостатка одежды и особенно обуви около 200 человек из их экипажей заболели цингой. Корабль «Всеволод» в океане разлучился с эскадрой и, получив сильные повреждения, зашел в Фридрихсвен, где остался на зимовку (летом 1813 г. он перешел в Кронштадт). На нем особенно сильно свирепствовала цинга (225 больных и 90 умерших).
Исправив повреждения, эскадра 27 сентября покинула Готенбург, пройдя через Большой Бельт, вошла в Балтийское море и 9 октября прибыла в Свеаборг. Посланный Р.В. Кроуну указ о следовании прямо в Англию (не заходя в Балтийское море) до него вовремя не дошел, поэтому он получил предписание идти из Свеаборга обратно в Готенбург на соединение с Е.Е. Тетом.
В то время когда корабли Р.В. Кроуна проходили Датские проливы, Балтийскому корабельному флоту была поставлена новая задача. 28 сентября был подписан Высочайший указ на имя адмирала Е.Е. Тета об отправлении вверенной ему эскадры двумя отрядами к берегам Англии для действий с английским флотом против Франции. В Готенбурге к ней должны были присоединиться корабли, шедшие из Архангельска, а в Англии — способные выйти в море суда, переданные Д.Н. Сенявиным «на хранение» английскому правительству. В связи с тем, что Дания находилась в союзе с Францией, русские эскадры должны были следовать в Северное море не обычным путем через Зунд, а через Большой Бельт.
Александр I вынужден был пойти на эту меру (отправление русских эскадр в Англию), чтобы убедить Георга III в своем намерении продолжать войну до конца, до полного разгрома армии Наполеона.
Об этом говорилось в инструкции, данной императором послу в Англии Х.А. Ливену перед отбытием его в Лондон: «Для Вашего отъезда я выбрал момент, когда французская армия находится в Москве, чтобы этим еще лучше подчеркнуть мою непоколебимую решимость продолжать войну, несмотря на это серьезное событие. Вам известны мои решения и даже планы в отношении Петербурга, если враг распространит свои действия до тех мест. Эти решения остаются постоянно неизменными, и именно в то время, когда Наполеон находится в моем кабинете в Кремле, я посылаю Вас в Лондон, чтобы выразить твердую уверенность, что я не заключу мира до тех пор, пока враг не будет изгнан из пределов нашей страны, даже и в том случае, если для этого мне придется уехать за Казань. Все необходимое для этого подготовлено. Это заверение, которое Вы от моего имени сделаете в Англии, должно быть для нее самым верным залогом неизменности моих решений. Для того чтобы дать ей еще одно доказательство этого, вслед за вами я пошлю все мои морские силы, способные крейсировать в море».
В обмен на это Александр вновь просил помощи оружием и военным снаряжением, т.к. российские арсеналы были уже значительно опустошены.
Для перевозки Х.А. Ливена в Лондон был выделен тот же фрегат «Кастор», который перевозил Лористона. Александр I дал Ливену указание ехать через Стокгольм, с тем чтобы сделать там шведскому королю и главным образом наследному принцу такие же заверения, которые ему поручалось сделать а Лондоне. 1 октября «Кастор» вышел в море.
15 октября из Кронштадта вышел первый отряд адмирала Е.Е. Тета в составе кораблей «Храбрый», «Смелый», «Орел», «Мироносец», «Чесма», фрегатов «Венера», «Свеаборг» и корвета «Гермиона». Суда были загружены мукой, а также медными листами для обшивки судов, шедших из Архангельска (предполагалось, что эскадра Р.В. Кроуна направится сразу в Англию). Кроме того, на суда эскадры погрузили 15 тысяч пудов (240 т.) пеньки для нужд британского флота.
Спустя 10 дней, 25 октября, вышел из Кронштадта второй отряд под командованием контр-адмирала М.П. Коробки в составе кораблей «Память Евстафия» (капитан 2-го ранга А.Т. Быченский 4-й), «Трех Святителей» (капитан-командор В.Р. Розе), «Юпитер», фрегата «Архипелаг» (капитан-лейтенант Л.П. Половцев), корвета «Мельпомена» (капитан-лейтенант П.И. Василевский) и транспорта «Иоанна-Шарлота».
Наконец, 28 октября из Свеаборга вышла эскадра вице-адмирала Р.В. Кроуна: корабли «Норд-Адлер», «Святослав», «Три Иерарха», «Не-тронь-меня», «Победоносец» и бриг «Гонец». Корабль «Принц Густав» из-за повреждений, полученных при переходе из Архангельска, был оставлен в Свеаборге. Корабль «Саратов», выходя из Свеаборга, по вине лоцмана ударился о подводный камень у острова Грохара, получил пробоину в днище и затонул. Экипаж был спасен, а командир оправдан. Корабль впоследствии был разобран. К эскадре Р.В. Кроуна присоединились корабли «Северная звезда» и «Борей», доставившие в Свеаборг кадет Морского корпуса.
Таким образом, Александр I почти весь боеспособный корабельный флот отправил в Англию.
Отряды Е.Е. Тета и М.П. Коробки 1 ноября соединились у острова Рюген. Здесь же они были встречены английским отрядом из четырех кораблей под командованием контр-адмирала Мориса. Для обеспечения прохода мало изученным проливом на русские суда прибыли лоцмана.
12 ноября в Бельте соединились все три русские эскадры. 18 ноября они встали на якорь у Готенбурга. На рейд Готенбурга пришел фрегат «Кастор», который вышел из Кронштадта с русским послом в Англии графом Х.А. Ливеном на борту. 21 ноября русские суда начали последний этап перехода в Англию. В этот день с якоря снялись с интервалом в несколько часов суда М.П. Коробки и Р.В. Кроуна (к эскадре Р.В. Кроуна присоединился и фрегат «Кастор»), а 22-го — эскадра Е.Е. Тета. Соответственно, 29 и 30 ноября они прибыли в Ширнесс
На переходе от Скагена к берегам Англии наши эскадры, предупрежденные шедшим вместе с ними со своей эскадрой английским адмиралом, ожидали встречи с французским флотом в числе 25 линейных кораблей (из Шельды и Текселя) и приготовились к бою, но неприятель не появился.
Затем суда эскадры Р.В. Кроуна перешли в порт Чатам, где они последовательно ставились в док для обшивки подводной части медными листами. Обычно эту операцию проходили все построенные в Архангельске суда по прибытии в Кронштадт.
Русские суда стояли в английских базах, периодически выходя в крейсерства совместно с английскими отрядами. Общее командование соединенными флотами было поручено английскому адмиралу Юнгу.
В результате французский флот, имевший в портах Ла-Манша и Северного моря 38 одних только линейных кораблей, не считая фрегатов и более мелких судов, вынужден был бездействовать до конца войны.
Корабли эскадры вице-адмирала Д.Н. Сенявина, стоявшие в Англии, с 1808 г. были осмотрены специально созданной под руководством контр-адмирала А.Л. Элиота комиссией из офицеров и судостроителей. Комиссия признала годными к дальнейшей эксплуатации только два корабля — «Сильный» и «Мощный». На них были перегружены орудия и часть такелажа с остальных судов, которые были проданы англичанам (по цене новых).
