В конце ноября 1941 года Вейхс, тяжело заболев и сдав командование 2-й армией генералу Р. Шмидту, убыл на лечение в Германию. Вернулся на фронт в середине января 1942 года, когда 2-я армия вела тяжелые оборонительные бои на рубеже Орел, Курск. Это был период общего контрнаступления Красной Армии зимой 1941/42 годов. В конце июня 1942 года на северном фланге группы армий «Юг» возглавил группу «Вейхс», в состав которой вошли его 2-я армия, 4-я танковая армия (генерал Г. Гот) и 2-я венгерская армия (генерал Г. Яни). Участвовал в неудачном наступлении генерал-фельдмаршала Ф. фон Бока на Воронеж. 13 июля 1942 года назначен командующим группы армий «Б», заменив на этом посту генерал-фельдмаршала Ф. фон Бока. В ее состав, кроме немецких 2-й и 6-й армий, вошли недостаточно надежные в боевом отношении армии союзников — 2-я венгерская, 3-я румынская и 8-я итальянская армии.
Возглавлял немецко-фашистские войска в ходе развернувшейся в июле 1942 года Сталинградской битвы — крупнейший битвы Второй мировой войны. В августе 1942 года разгромил на Среднем Дону, в районе Калача, 2 советские армии (1-ю танковую и 62-ю общевойсковую). Неоднократно обращал внимание верховного командования (ОКВ) и лично Гитлера на опасное положение флангов его группы армий. Но все его предостережения оказались безрезультатными. Когда Красная Армия перешла в контрнаступление под Сталинградом, Вейхс обратился к Гитлеру с просьбой разрешить отвести 6-ю армию, над которой нависла угроза окружения, из района Сталинграда за Дон, но получил отказ. В конце ноября 1942 года в связи с созданием на сталинградском направлении группы армий «Дон» (генерал-фельдмаршал Э. фон Манштейн) большая часть войск, входивших до этого в группу армий «Б», была передана в новую группу армий. В распоряжении Вейхса остались лишь 2-я армия и итальянская 8-я армия, которые были разгромлены Красной Армией в январе 1943 года. Несмотря на столь сокрушительное поражение, которое Вейхс потерпел под Сталинградом и на Дону и какого немецко-фашистская армия еще ни разу за всю войну не испытывала, 1 февраля 1943 года Гитлер произвел Вейхса в генерал-фельдмаршалы. 14 февраля 1943 года остатки группы армий «Б» были расформированы, а ее штаб выведен в резерв ОКХ (главное командование сухопутных войск). 10 июля 1943 года он также был расформирован. Но не у дел Вейхс находился недолго. 25 августа 1943 года он был назначен командующим вновь созданной на Балканах группой армий «Ф» (около 600 тыс. человек). Основное назначение этого оперативно-стратегического объединения заключалось в ведении борьбы с югославскими партизанами и несении оккупационной службы на Балканах. После капитуляции Италии и ее перехода на сторону антигитлеровской коалиции произвел захват контролируемых итальянцами территорий на Балканском полуострове.
Понимая всю бесперспективность борьбы с восставшими против немецко-фашистских оккупантов балканскими народами, Вейхс в сентябре 1943 года обратился к Гитлеру с предложением вывести германские войска с Балкан и использовать их на других фронтах, но получил отказ. В конце 1943 года провел против югославских партизан 3 крупных наступательных операции, которые имели лишь частичный успех. Будучи не в силах сломить волю югославского народа к сопротивлению, установил на контролируемой его войсками территории жесткий оккупационный режим, не останавливаясь перед массовыми казнями заложников и проведением тактики «выжженной земли». В конце 1943 года в оперативное подчинение Вейхса была передана находившаяся в Греции группа армий «Е», и он, таким образом, объединил под своим командованием все немецко-фашистские войска на Балканах.
После вступления Красной Армии на территорию Болгарии и Югославии войска групп армий «Ф» и «Е» начали отход с Балкан (сентябрь 1944 года). К началу 1945 года они продолжали еще удерживать значительную часть Югославии, ведя боевые действия в 100 км западнее Белграда и восточнее Сараево. В январе 1945 года начальник Генерального штаба сухопутных войск генерал Г. Гудериан предпринял попытку добиться назначения Вейхса на пост командующего группой армий «Висла», но она закончилась неудачей. Гитлер отверг предложение Гудериана, и чтобы как-то смягчить свое негативное отношение к кандидатуре Вейхса, наградил его дубовыми листьями к Рыцарскому кресту (5 февраля 1945 года). Постепенно большая часть войск, находившихся в подчинении Вейхса, была переброшена на другие фронты. В конце марта 1945 года остатки группы армий «Ф» был расформированы, а ее штаб упразднен за ненадобностью. Сам Вейхс был переведен в резерв ОКВ и участия в завершающих сражениях Второй мировой войны уже не принимал.
После капитуляции Германии арестован американскими войсками. В лагере для военнопленных Вейхс серьезно заболел и в 1947 году был освобожден из плена. После выхода на свободу поселился в Западной Германии и вел уединенную жизнь. Вейхс оказался одним из немногих высших военачальников Третьего рейха, которым удалось избежать суда за военные преступления во время Второй мировой войны.
* * *
Высокий, жилистый, в очках с толстыми стеклами и металлической оправой, с манерами прирожденного аристократа Вейхс внешне походил скорее на какого-то университетского профессора, нежели на полководца. Но это было обманчивое представление. Гудериан как-то заметил, что Вейхс был «столь же умен, сколь полон гордости и мужества». Старый кавалерист, педантичный служака, профессионал высокого класса, считавший, что кадровый военный не должен вмешиваться в политику, он первое время не сочувствовал нацистам, но затем стал неплохо сотрудничать с ними. Поворотным моментом, сыгравшим решающую роль в изменении его отношения к нацистам, явилось решение Гитлера о развертывании на базе 100-тысячного рейхсвера мощных германских вооруженных сил (вермахта). Это не только полностью соответствовало традиционным представлениям Вейхса о роли и месте армии в системе государственных институтов власти, но и открывало для него лично широкие возможности сделать военную карьеру. Вместе с тем Вейхс в дальнейшем был вынужден постоянно балансировать между своими глубокими религиозными убеждениями (он всю жизнь оставался ревностным католиком), которые входили в противоречие с идеологическими установками и практикой нацистского режима, и своей приверженностью Гитлеру. Благодаря своей лояльности фюреру ему удалось успешно избежать устроенной в 1938 году В. Браухичем по приказу Гитлера «генеральской чистки» и в последующем сохранять доверие Гитлера почти до самого конца войны, хотя он не раз и довольно резко выступал против карательных акций СС, что любому другому вряд ли бы так легко сошло с рук. И после окончания войны Вейхсу удалось успешно избежать военного трибунала победителей, хотя по части военных преступлений в Югославии за ним много чего числилось.
