Stamps. Science. 308, no. 5729 (2005): 1738a.
“Величайший ученый”: Kim J., Park K. Ethical Modernization: Research Misconduct and Research Ethics Reforms in Korea Following the Hwang Affair. Science and Engineering Ethics. 19, no. 2 (2013): 358. Пожертвование яйцеклеток: Saunders R., Savulescu J. Research Ethics.
Couzin J. STEM CELLS: …And How the Problems Eluded Peer Reviewers and Editors. Science. 311, no. 5757 (2006): 23–4; Rossner M. Hwang Case Review Committee Misses the Mark. Journal of Cell Biology. 176, no. 2 (2007): 131–2.
Saunders R., Savulescu J. Research Ethics.
Kim J., Park K. Ethical Modernization.
Там же.
Chong S., Normile D. STEM CELLS: How Young Korean Researchers Helped Unearth a Scandal. Science. 311, no. 5757 (2006): 22–5.
Ahn M.-Y., Normile D. Korean Supreme Court Upholds Disgraced Cloner’s Criminal Sentence. Science. 27 Feb. 2014.
Я уверен, что Снаппи, в отличие от мужчины, клонировавшего его, был чудесным. Kim M. J. et al. Birth of Clones of the World’s First Cloned Dog. Scientific Reports. 7, no. 1 (2017): 15235.
Я испытываю совершенно иррациональное чувство гордости из-за того, что эту лабораторную методику, используемую теперь повсеместно, Саузерн изобрел в моей альма-матер – Эдинбургском университете. Southern E. M. Detection of Specific Sequences among DNA Fragments Separated by Gel Electrophoresis. Journal of Molecular Biology. 98, no. 3 (1975): 503–17.
Полностью саузерн-блоттинг выглядит примерно следующим образом. Берется молекула ДНК, разрезается ферментами на более мелкие фрагменты, которые затем прогоняются через специальный гель под действием электрического тока (этот процесс называется электрофорезом). Фрагменты разного размера движутся через гель с разной скоростью, поэтому после подачи тока в течение некоторого времени о размере фрагмента можно судить по его положению в геле. После электрофореза с помощью щелочного раствора двойная спираль ДНК расщепляется на отдельные нити (это освобождает место для зонда, как мы сейчас увидим). Затем содержимое геля переносится на специальную мембрану (обычно нитроцеллюлозную, но используется также и нейлоновая), на которую добавляется другая, изначально имевшаяся нить ДНК (тот самый “зонд”), предварительно радиоактивно помеченная. Этот зонд связывается с соответствующими участками ДНК, перенесенной на мембрану из геля, и тогда с помощью рентгеновской пленки можно увидеть, где связывание произошло (а значит, например, какие гены присутствуют в вашем образце ДНК). В итоге вы видите различные участки ДНК, выстроенные размытыми полосками разного размера и интенсивности. Вместо радиоактивных меток при блоттинге также можно использовать цветные красители.
С помощью нозерн-блоттинга детектируют РНК, а с помощью вестерн-блоттинга – белки. Еще есть истерн-блоттинг (для обнаружения модификаций белков) и даже фар-истерн-блоттинг (far-eastern). Последний метод назван так потому, что имеет отношение к истерн-блоттингу, но разработан в Японии.
Obokata H. et al. Stimulus-Triggered Fate Conversion of Somatic Cells into Pluripotency. Nature. 505, no. 7485 (2014): 641–7; Obokata H. et al. Bidirectional Developmental Potential in Reprogrammed Cells with Acquired Pluripotency. Nature. 505, no. 7485 (2014): 676–80.
Это некоторое упрощение: индуцированные стволовые клетки имеют несколько иные свойства по сравнению с эмбриональными, что может в итоге оказаться весьма важно в медицинском контексте – это покажут лишь дальнейшие исследования. К слову, процесс получения индуцированных плюрипотентных стволовых клеток еще не был открыт в 2004–2005 годах, вот почему Хван сосредоточился на работе со стволовыми клетками эмбрионов.
Nobel Media. The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2012. Oct. 2012. www.nobelprize.org/prizes/medicine/2012/summary/
Как писала газета The Japan Times, продажи каппоги резко выросли, когда Обоката прославилась. Hooper R. Stem-Cell Leap Defied Japanese Norms. Japan Times. 14 Feb. 2014.
Ishii S. et al. Report on STAP Cell Research Paper Investigation. 31 March 2014.
“Красный шрифт – для провальных результатов”: https://ipscell.com/stap-new-data. “Все они оказывались красными”: Meskus M. et al. Research Misconduct in the Age of Open Science: The Case of STAP Stem Cells. Science as Culture. 27, no. 1 (2018): 1–23. Еще эта статья дает интересную тему для обсуждения: как для развенчания методики STAP использовался интернет – анонимные комментарии к поддельным изображениям и блог, каталогизирующий попытки воспроизвести результаты.
Gallagher J. Stem Cell Scandal Scientist Haruko Obokata Resigns. BBC News. 19 Dec. 2014.
Katsura I. et al. Report on STAP Cell Research Paper Investigation. 25 Dec. 2014; Kameda M. “STAP Cells” Claimed by Obokata Were Likely Embryonic Stem Cells. Japan Times. 26 Dec. 2014.
Cyranoski D. Collateral Damage: How One Misconduct Case Brought a Biology Institute to Its Knees. Nature. 520, no. 7549 (2015): 600–3.
Cyranoski D. Stem-Cell Pioneer Blamed Media “Bashing” in Suicide Note. Nature. 13 Aug. 2014.
Bik E. M. et al. The Prevalence of Inappropriate Image Duplication in Biomedical Research Publications. MBio. 7, no. 3 (2016): e00809–16. О самой Бик см. Bartlett T. Hunting for Fraud Full Time. Chronicle of Higher Education. 8 Dec. 2019.
Bik E. M. et al. The Prevalence of Inappropriate Image Duplication.
Например, известно, что если просить людей выбрать наугад число от 1 до 10, то они гораздо чаще остальных чисел будут выбирать семерку. Если в наборе данных наблюдается непропорциональное количество семерок, это явный намек на то, что к созданию этих данных приложил руку человек. См., например, тут: www.reddit.com/r/dataisbeautiful/comments/acow6y/asking_over_8500_students_to_pick_a_random_number.
Важно отметить, что статистики используют слово “ошибка” не в отрицательном смысле – оно просто означает разницу между измеренным значением и истинным значением измеряемой величины.
И действительно, весь смысл многих статистических тестов состоит в том, чтобы отделить реальные эффекты – скажем, нового лекарства, испытываемого учеными, – от этой случайной ошибки выборки.
Haldane J. B. S.
