В 1373 г. Венеция получила особого инквизитора. Значение венецианского инквизитора было, однако, сведено до минимума; на него смотрели как на простого чиновника гражданской администрации. 17 апреля 1412 г. Великий Совет приказал изгнать греческого священника Михаила, богослужения которого привлекали массу богомольцев, но вести это дело так, чтобы никто не подозревал вмешательства Совета. Спустя месяц, 26 мая, приказ об изгнании был отменен, и сохранило силу только распоряжение об отстранении от должности священника. Во всем, что касалось личного его ведения, с инквизитором не считались. В 1422 г. Совет Десяти назначил особую комиссию для исследования виновности нескольких францисканцев, обвиненных в жертвоприношениях демонам. Месяцем позднее эта светская власть просила у Мартина V полномочия начать процесс по вопросу о неприкосновенности, которой пользовались нищенствующие. В следующем (1423) году Сенат выключил из государственной сметы статью на покрытие расходов инквизиции, так как считал ее бесполезной. Возможно, поэтому на Венецианскую и Тревизскую области в 1433 г. был назначен один инквизитор.
В 1450 г. Советом Десяти было установлено определенное число вооруженных слуг инквизитора. Сначала их было четыре, но в 1451 г. – двенадцать. То, что столь ограниченное число слуг оказывалось достаточным на обширный и густо населенный округ, показывает, что обязанности инквизитора были весьма ограничены и государство следило за ним; тем не менее продолжали назначать инквизиторов, хотя они и не могли действовать самостоятельно; в деле о колдуньях 1521 г. даже вмешательство самого Льва X не могло заставить синьорию отказаться от вынесения окончательного решения.
В 1494 г. один инквизитор Мантуи за неимением еретиков направил свою энергию против ссудных касс и всех граждан, заинтересованных в них. Ссудные кассы были основаны для поддержки бедных, находившихся до того во власти у еретиков и евреев.
В Тоскане торжество католичества было полное. В 1304 г. один из монахов в проповеди заявил, что ересь здесь полностью уничтожена; осталось только несколько отдельных еретиков, вынужденных скрываться. Но инквизиция была ценным орудием для римской курии при преследовании ею своих целей, не имевших ничего общего с вопросом о чистоте веры.
Кардинал де Санта Сабина во время своих посещений различных европейских дворов в качестве папского легата собрал большие суммы денег, которые были внесены на имя кардинала в крупный флорентийский банк братьев Аччьяюоли. Принимая деньги, администраторы банка обязались уплатить их, предоставляя решение всякого спора суду папской курии. В 1343 г. на счету кардинала было около двенадцати тысяч флоринов, которые банк не был в состоянии уплатить ему; город переживал торговый и финансовый кризис. Ломбардская война истощила государственное казначейство, и банкротство было общее. 9 октября 1343 г. Климент VI потребовал, чтобы синьория Флоренции заставила Аччьяюоли выдать кардиналу его деньги; при данных обстоятельствах это было невозможно, но курия приказала подвергнуть должников аресту. Инквизитору было приказано вынести приговор, причем ему разрешалось прибегнуть к помощи светской власти и наложить интердикт на город. 23 ноября 1345 г. инквизитор брат Петр ди Аквила приказал высшим сановникам города заключить должников в тюрьму и держать их там до тех пор, пока они не уплатят все полностью, и пригрозил в случае неповиновения отлучением от Церкви и интердиктом. Магистрат ответил, что он готов оказать помощь. У Аччьяюоли взяли все, что могли, и передали брату Петру, поручившись в уплате остальной суммы; но инквизитор хотел сделать весь город ответственным за долги отдельных граждан и нарушил закон Республики, приказав арестовать одного из директоров несостоятельного банка. Трое слуг инквизитора, исполнивших его приказание, были изгнаны согласно закону из города, причем им отрезали правые руки. Несмотря на все это, несостоятельные должники не платили денег. Тогда брат Петр наложил на город интердикт, но местное духовенство и население отказались повиноваться, так как Бонифаций VIII официально запретил прибегать к этой незаконной мере с целью взыскания долгов, и это папское распоряжение не было отменено. Церкви были по-прежнему открыты, и в них совершались службы, что вызвало новые преследования уже против епископа и священников. Интердикт ставил их вне закона флорентийских купцов. Ввиду этого приоры города 14 июня 1346 г. послали к папе комиссаров, уполномоченных дать от имени Республики обязательство уплатить кардиналу в восьмимесячный срок долги банка в размере семи тысяч флоринов.
28 июня 1347 г. папа приказал снять интердикт, оговорив, что, если деньги не будут уплачены вовремя, интердикт снова войдет в силу. Сумма, подлежащая уплате, была значительна. Доход Флоренции в эту эпоху не превышал трехсот тысяч флоринов, а Флоренция была одним из самых богатых государств Европы. Только одна Франция имела больший доход. Доход Неаполя был меньше, а эти три государства были самыми богатыми во всем христианском мире в XIV в.
В 1346 г. за растрату денег, причитающихся римской курии, делегат папского нунция во Флоренции аббат Николо возбудил дело против инквизитора брата Петра. Синьория тотчас же обвинила его и представила доказательства того, что брат Петр вымогал у некоторых граждан деньги, возбуждая против них ложные преследования по обвинению в ереси. Петр бежал, не желая подвергнуться неприятностям процесса. По истечении законного срока аббат Никколо, имевший полномочие от папы, объявил в 1347 г. брата Петра уклоняющимся от суда и мятежником и отлучил его от Церкви. В то время как Никколо тщетно вызывал Петра на суд, он был назначен 12 февраля 1347 г. епископом С.-Анджели де Ломбарди, а в ответ на отлучение был переведен 29 июня 1348 г. на лучшую кафедру в Тривенто.
Флорентийцы посылали одну за другой просьбы о выборе инквизиторов из числа граждан в надежде, что они будут вести себя скромнее иностранцев; в 1354 г. инквизитором Тосканы был назначен флорентиец. Но этого было, очевидно, недостаточно, и синьория в целях самозащиты обнародовала законы, чтобы сократить злоупотребления инквизиторов. Их обязали ограничить число своих вооруженных слуг шестью. Затем постановили, что ни один гражданин не может быть арестован без согласия подестата, который был обязан арестовывать всякого, указанного ему епископом. Эти мероприятия существенно ограничивали права инквизитора, у него отобрали его особую тюрьму и приказали заключать арестованных в общественную тюрьму; ему было запрещено накладывать денежные наказания; все осужденные, признанные им еретиками, должны быть сжигаемы. Все возраставшее неповиновение инквизиции выразилось еще в 1340 г. в Сиенне тем, что были приняты законы против некоторых злоупотреблений святого трибунала. Инквизитор обратился с жалобой к Бенедикту XI, который тотчас объявил эти законы недействительными и приказал вычеркнуть их из книги статутов. Еще в 1355 г. Иннокентий VI тщетно потребовал пересмотра статутов Флоренции. В 1372 г. была сделана попытка смещения крайне непопулярного тосканского инквизитора. Но Григорий XI заявил, что он ему полностью доверяет. В 1373 г. инквизитором Тосканы был вновь назначен брат Петр Липпо, занимавший этот пост в 1371 г. Служебная карьера Петра, неоднократно прерывавшаяся, продолжалась, по крайней мере, до 1384 г. Как и его предшественники, он не отступал перед сопротивлением, вызванным в свободных городах Италии процессами инквизиции. Пистойя последовала примеру Флоренции и попыталась оградить своих граждан муниципальными статутами. За это в 1375 г. на нее был наложен интердикт, и ее жители были отлучены от Церкви. Брат Петр также жаловался на Флоренцию, которая мешала свободе действий инквизиции. Григорий приказал в том же 1375 г. синьории отменить статуты, противоречащие инквизиции. Флоренция не обратила на этот указ никакого внимания; городские жители разрушили инквизиторскую тюрьму и изгнали инквизитора из города. В ответ Григорий 31 марта 1376 г. не только наложил на город интердикт и отлучил его от Церкви, но исключил также граждан из числа христиан; имущество их, где бы оно ни было, подлежало конфискации, а они сами – отдаче в рабство. По всему христианскому миру хватали флорентийские товары, и купцы могли считать себя счастливыми, если им удавалось добраться домой живыми, питаясь дорогой Христовым именем. Некоторые монархи, подобные должнику флорентийских банкиров – английскому королю Эдуарду III, обратили их в рабство. Флоренция была вынуждена смириться. В силу условий мирного договора, заключенного с папой 28 июля 1378 г., Республика соглашалась отменить все законы, ограничивавшие власть инквизиции и стеснявшие свободу Церкви. Но запрещенное законодательство почти целиком вошло в кодекс, пересмотренный в 1415 г., во время Великого Раскола.
Во время Великого Раскола в Центральной Италии служители папского престола не имели никакой власти, чтобы заставить повиноваться, хотя Пизанская инквизиция, ободренная собравшимся в этом городе в 1409 г. собором приговорила одного человека к костру за постоянные открытые хулы и оскорбления святого трибунала. Когда на Констанцском соборе был положен конец Расколу, Мартин V в булле от 14 ноября 1418 г. заявляет, что еретики-фратичелли, когда инквизиторы пытаются применить к ним свою власть, требуют суда какого-нибудь светского сеньора, грозят своим преследователям, так что инквизиторы не смеют более исполнять своих обязанностей. Для устранения этого зла Мартин стал заменять официальных инквизиторов лицами, специально уполномоченными, например, в 1424 г. Мартин послал во Флоренцию профессора богословия и одного доминиканца судить трех фратичелли.