После 1331 г. новый архиепископ Валеран попытался устроить постоянную епископскую инквизицию и назначил для этого особого комиссара, обязанностью которого было разыскивать еретиков и который имел право прощать и присоединять к Церкви отрекшихся от своих заблуждений. Это был настоящий инквизитор. Однако в марте 1335 г. Валеран констатировал, что ересь росла и в городе, и в епархии; он призвал всех своих прелатов и все свое духовенство помогать инквизиции. Но и эта мера оказалась также малодейственной, как и предшествующие попытки. Еретики публично носили свою отличительную одежду и совершали свои обряды; мало того, инквизитор давал разрешение грехов, не требуя доказательств правоверия. В октябре того же года архиепископ издал новое пасторское послание, в котором отменял эти разрешения от грехов и отмечал постоянный рост ереси.
В Вестфалии также епископы уничтожали ереси в своих епархиях. В 1335 г. страсбургский епископ Бертольд попытался против еретиков применить Клементины. В том же году несколько жертв было сожжено в Меце. В 1336 г. в Магдебурге было открыто несколько Братьев Свободного Духа, которые признались пред судьей в своих верованиях. Однако архиепископ выпустил их на свободу, когда они на словах отреклись от своих заблуждений. Но в том же году был первый случай папской инквизиции в Северной Германии. Августинский отшельник монах Иордан получил полномочие инквизитора на всю Саксонию. Но он слабо знал инквизиционное судопроизводство; и, открыв в Ангермюнде гнездо луцифериан, предложил им оправдаться посредством священного очищения. Четырнадцать из них не могли найти необходимого числа соприсяжников и были тотчас же сожжены. Из Ангермюнде Иордан отправился в Эрфурт, где присутствовал на разборе дела бегарда. Еретик утверждал, что он сын Божий и воскреснет через три дня после своей смерти; судьи попытались признать его сумасшедшим, но он утверждал, что в здравом уме, отказался отречься и погиб на костре.
В 1336 г. была открыта в Австрии крупная секта луцифериан. Их обряды – это вечный рассказ о колдовстве. Они заразили своей ересью огромное число людей, и для их уничтожения были широко применены костер и другие жестокие наказания.
В следующем году много простых людей в Бранденбурге были вовлечены в поклонение дьяволу тремя злодеями, которых обратил в бегство один доминиканец. Однако простые люди продолжали упорствовать в своих заблуждениях и предпочитали костер отречению. Другой случай луциферианизма был обнаружен в Зальцбурге в 1340 г. В кафедральном соборе священник Рудольф бросил на землю чашу с причастием, уже раньше подобное святотатство он совершил в Галле. Он упорствовал в своей ереси и был сожжен. В 1339 г. три старика-ересиарха Братьев Свободного Духа были арестованы в Констанце и судимы епископом. Они были признаны виновными в святотатстве и богохульстве, но твердо стояли на своем до тех пор, пока их не повели на казнь; тогда они отреклись и были осуждены на пожизненное заключение в башне на хлеб и воду. В 1342 г. двое других были доведены силою до раскаяния в Вюрцбурге.
Однако преследование еретиков велось с перерывами. Поэтому, например, в Швабии в 1347 г. ересь бегардов распространялась беспрепятственно и безудержно. Еретик Иоганн Мехлин открыто проповедовал свое ложное учение по всей Верхней Германии; его красноречие привлекало к нему огромное число учеников, даже среди знатных и духовных. Подобная веротерпимость существовала и в Нидерландах, так как известно, что около этого времени в Брюсселе жила одна женщина, писавшая трактаты о Духе Свободы и о Любви. Небольшая секта, основанная ею, просуществовала до начала XV в. В тридцатые годы XIV в. кардинал Пьер д'Айльи приказал инквизитору уничтожить еретиков; преследование шло без жестокостей, лишь с помощью проповеди; однако можно думать, что инквизитор не ограничивался одним этим, так как еретики составили заговор убить его; но инквизитор внезапно исчез.
После спорного избрания в 1314 г. Людовика Баварского отношение между империей и папством были чрезвычайно натянуты. Победа при Мюльдорфе в 1322 г., обеспечившая Людовику императорскую власть, вызвала в 1323 г. окончательный разрыв между Людовиком и Иоанном XXII. Каждый из противников называл своего врага еретиком и объявлял его лишенным всех прав. Когда Иоанн предал Германию интердикту, то Людовик в ответ на это начал жестоко преследовать духовных лиц, признававших папские духовные наказания. Это препятствовало преследованию ереси. Когда в 1347 г. Людовик умер и императором был признан его соперник Карл IV, «император священников», Рим надеялся, что будет разбита оппозиция епископов папской инквизиции и что начнется постоянное и систематическое преследование; в Германии будет покончено с веротерпимостью. В 1348 г. Иоганн Шанделанд, доктор доминиканского монастыря в Страсбурге, был назначен папским инквизитором для всей Германии. Но в 1347 г. «черный мор» перешел с Востока в Европу; он быстро распространялся в течение 1348-1349 гг., охватив Францию, Италию, Венгрию, Германию и Англию. В одной только Флоренции с марта по июль 1348 г. умерло до ста тысяч человек. В Париже погибло пятьдесят тысяч жителей; в С.-Дени и Страсбурге по шестнадцать тысяч.
Бедствия черного мора вызвали лихорадку раскаяния, хотя Германия менее пострадала, чем остальная Европа; в ней погибло только около четверти населения, но весной 1349 г. страна вдруг покрылась толпами флагеллантов (бичующихся), заглаживавших свои грехи самобичеванием. От Польши до Рейна процессии флагеллантов встречали мало препятствий. Однако в Эрфурте городские власти запрещали им вход; из Магдебургской провинции их прогнал архиепископ. Когда флагелланты Страсбурга решили устроить постоянное братство, Карл IV воспротивился этому; эти бродячие толпы уже приняли угрожающий характер; в разных местностях эти фанатики жестоко преследовали евреев; толпы нападали на церкви и духовенство. В Турнэ оратор флагеллантов объявил, что нищенствующие монахи – скорпионы и антихристы; на границах Мейсена два доминиканца, вздумавшие образумить толпу флагеллантов, были побиты камнями. 20 октября 1349 г. вышла булла, осуждавшая флагеллантов. Это осуждение основывалось на презрительном отношении их к «власти ключей» (папе) и церковному благочинию, в устраивании самостоятельных общин и совершении обрядов, несходных с общепринятыми. Папа упоминал о жестокостях, совершенных ими против евреев, и о покушениях против собственности и юрисдикции Церкви. Всем прелатам было приказано распустить немедленно конгрегации бичующихся; тех же флагеллантов, которые не послушаются, заключить в тюрьму до нового распоряжения, а в случай нужды прибегать к помощи светской власти.
На Констанцском соборе 1417 г. Герсон говорил, что члены секты флагеллантов доходили до отрицания таинства исповеди и покаяния, так как они восхваляли особую форму сердечного сокрушения, считая ее не только выше той формы покаяния, которая предписывается Церковью, но даже и мученичества, говоря, что они сами проливают свою кровь, а кровь мучеников была пролита другими. Эти идеи были близки к ереси. Когда булла, осуждавшая флагеллантов, была получена немецкими прелатами, то они решили строго применить папские предписания. Священники объявляли флагеллантов нечестивой сектой, осужденной Святым Престолом. Тем, кто смиренно вернется к вере Церкви, обещали прощение, а тем, кто будет упорствовать, грозили строгим применением канонов. Многие из этих еретиков были казнены или подверглись различным пыткам, многие были заключены в тюрьмы. На провинциальном соборе кельнский архиепископ отлучил от Церкви всех духовных, присоединившихся к флагеллантам. Весной 1353 г. этот прелат приказал всем деканам и ректорам собрать капитулы, прочесть его указ и принять меры к публичному и поименному отлучению от Церкви всех, кто не подчинится, виновные должны быть отрешены от должности. Лихорадка бичевания рассматривалась Церковью как настоящая ересь. К толпам флагеллантов, с момента первого их появления, во многих местностях приходили еретики, считавшиеся лоллардами, бегардами и келлитами. Охваченные общим преследованием, все они оказывали друг другу поддержку.
Около конца 1352 г., став папой, Иннокентий VI попытался ввести в Германии папскую инквизицию; с этой целью в июне 1353 г. он подтвердил инквизиторский мандат Иоганна Шанделанда и просил всех немецких прелатов оказывать ему действительную помощь. Вредное безумие бегардов, говорил он, снова проявилось, и нужно принять серьезные меры против этого зла; так как инквизиция не имела в епархиях своих тюрем, то прелатам было предложено предоставить в полное распоряжение святого трибунала епископские тюрьмы. Хроника сообщает, что Иоганн отличался энергией и имел успех. Однако ничто не свидетельствует о его содействии осуждению на костер бегардского ересиарха Бертольда фон Рорбака в 1356 г. Неуспех, который встретила попытка Иннокентия ввести свою инквизицию, сказывается в решении, принятом архиепископом на весеннем синоде в Кельне в 1357 г. Отмечая рост секты бегардов, грозящей заразить весь город и всю епархию, прелат совершенно не упоминает ни о папской инквизиции, ни о канонах. Он упоминает о мерах, принятых его предшественниками, и, согласно с ними, приказывает всем приходским священникам выступить против еретиков, грозя им, что в случае небрежности они сами будут преследуемы; он также грозит отлучением от Церкви всем, кто милостыней поддерживает существование бегардов.
